Thèses en cours

 En 2026

• AFFHOLDER Antoine - « Multifonctionnalité de la transparence chez les papillons ». Encadrant(e)s ELIAS Marianne, ISYEB ; Christine Andraud, (CRC) ; Doris Gomez, (CEFE) & Thierry Ondarçuhu, (IMFT).

• AYMERIE dit EYMERIC Aurore - « Usages des données d’exploration de la biodiversité marine des milieux profonds » Encadrantes  Anouk Barberousse, 

      UMR 8011 /Sciences Normes Démocratie) & Sarah Samadi, ISYEB.

• BERTRAND Constance - « Dynamiques et rôle des microbiomes dans la réponse adaptative des plantes endémiques des Kerguelen au changement climatique - MICROKE » Encadrant(e)s Roland Marmeisse, ISYEB  & Françoise BINET, ECOBIO de Rennes 1.

• BIGNON Barbara - « Éclairages mutuels de l’éthologie et de la physique sur l’enfouissement d’insectes dans un milieu granulaire ». Co-encadrants Frédéric Legendre, ISYEB & Baptiste Darbois-Texier, FAST (Université Paris-Saclay)

• BOUCHER Antoine : « Les dynamiques spatiales et temporelles de diversification des insectes dans la région néotropicale – analyses comparatives dans deux familles sœurs de Lépidoptères aux biologies contrastées, depuis leur divergence lors de l’époque Paléocène ». ncadrant(e)s : Marianne Elias & Rodolphe Rougerie, ISYEB.

• BOROWIECKA Angelika - « Mycobacterium tuberculosis, paysage adaptatif et succès épidémique  » Encadrant Thierry Wirth, ISYEB.

• BRISSET Olivier - « Genetic and phenotypic impacts of multiple-sources reintroduction for the plant Arenaria grandiflora in the Fontainebleau forest » » Encadrant(e)s Nathalie Machon, Paul Verdu & Stefano Mona, ISYEB.

• CAROULLE Mattéo - « Evolution, développement et génétique des carpelles chez les Angiospermes : une affaire de style. » Encadrants Florian Jabbour, ISYEB,  &  Patrick LAUFS, (IJPB)

• CARTER Jackson : : Beyond 3D Geometric Morphometrics via Deep Learning.Co-Encadrants  Raphaël Cornette,  ISYEB ;  Marc Lelage ,INRIA & Ronan ALLAIN CR2P.

• CHAVANIS Théo : « Thermorégulation et adaptation aux variations climatiques chez les papillons de montagnes. » Encadrantes Marianne Elias , ISYEB & Anne Michelin ,CRC.

• CLEMENT Julien : « Évolution des modes de reproduction dans un contexte de changements environnementaux chez la fourmis thermophile Cataglyphis piliscapa. » Encadrante Claudie Doums, ISYEB.

• COHU PUEL Louna : « Study of the relationship between selection and genetic architecture of traits in the common lizard » Encadrement :  Pierre de Villemereuil &  Elise Gay, ISYEB.

• DANI Julia GabrIele : « Biologie évolutive, biologie de la reproduction et rôle des trichomes floraux dans Calydorea Herbert. (Iridaceae). »
  Encadrants Olivier Chauveau, Univ.Paris Saclay & Florian Jabbour , ISYEB.

• DELAIRE Tomé - « Divergences des stratégies éco-évolutives et du potentiel adaptatif de deux espèces de grandes raies parapatriques (complexe Dipturus batis) »
  Co-encadrant(e)s Bertrand Bed’Hom, ISYEB/MNHN ;  Anne Lizé, BOREA/MNHN & Alexandre Carpentier, BOREA/Université de Rennes.
      
• DELOCHE Lara : « Les Neottia chlorophylliennes, chainons manquants entre l’autotrophie et la mixotrophie chez les Orchidées ? » Encadrants Marc-André Selosse, ISYEB & Etienne Delannoy.

• DESHAYES Hugo - « Histoire d’un processus d’invasion : aperçu génomique de la colonisation de la Sicile par la fourmi de feu (Solenopsis invicta) »Encadrants :  Stefano Mona, ISYEB & Quentin Helleu, StrinG.

• DIAS GUILARDI Mariana – « Maternal-fetal detection of rabies virus in the vampire bat Desmodus rotundus » Encadrants Olivier Gascuel & Alexandre Hassanin. 

• DOMINO Sélène - « La biologie va-t-elle vers un pluralisme ontologique ? », co-encadrement Guillaume Lecointre, ISYEB & Francesca Merlin, IHPST.

• DUCANCEL Joshua - « Evolution de la dispersionf. Importance de l’hétérogénéité spatiale dans le maintien d’un polymorphisme de dispersion » encadrant(e)s Claudie Doums,  Stefano Mona, ISYEB & Thibaud Monnin (IEES).

• DUPILLIER Raphaël - « Evolution du vol battu et de l’iridescence chez les papillons Morphos  » Encadrant(e)s Vincent Debat, ISYEB & Violaine Llaurens.

• DURAND Morgane - « Exploration de la cryptofaune benthique dans l’océan Austral, apport du métabarcoding de mini-récifs artificiels. Encadrant(e)s : Nadia Améziane, Cyril Gallut,  ISYEB, Station marine de Concarneau &  Karin Gérard, Universidad de Magallanes (UMAG), Punta Arenas, Chile.

• FOUERE-KLEIN  Nathan -« Caractérisation des aspects scientifiques et productifs d’une agriculture d’intérieur durable en base lunaire habitée pour soutenir la vie des astronautes » Encadrant(e) Florian Jabbour & Eugénie Carnero Diaz ISYEB

• GHARBI Nour - Impact des migrations et des facteurs socio-économiques sur la propagation et le succès de souches épidémiques de tuberculose. Encadrant Thierry WIRTH, ISYEB.

• GLASZMANN D’ONT Anouk - « Gestion éco-évolutive de la pêche d’une espèce surexploitée, le corail rouge de Méditerranée Corallium rubrum » Encadrants: Didier Aurelle, AMU, ISYEB & Stéphane Hourdez (CNRS, LECOB)

• GONDIN Antonio Walison - « Révision taxonomique et phylogénomique du genre Polyporus (Polyporaceae). » Universidade Federal Rural da Amazônia (UFRA) Encadrant(e)s : Universidade Federal Rural da Amazônia (UFRA) &  Sundy Maurice, ISYEB

• GUILBAUD Marine - « Effet de l’arsenic (As), du fer (Fe) et des micro-nanoplastiques (MNPs) sur la croissance de plusieurs morphotypes de Sargasses aux Antilles. » Encadrant(e)s Magalie BAUDRIMONT, & Pierre-Yves Pascal, ISYEB.

• HEDERLÉ Rachel - « Approches taxonomiques et suivi de la faune marine mobile par l’étude de l’ADN environnemental : De la biodiversité marine à l’appui aux politiques publiques » Encadrant(e)s J.L. Jung & V. Ung , ISYEB.

• JAGOU Marie-Stella - « Histoire évolutive de Cynorkis (Orchidaceae) dans les îles de l’océan Indien : rôles des facteurs climatiques dans la divergence des espèces et des populations ». Encadrants Thierry Pailler (Université de la Réunion) & Florent Martos, ISYEB.

• KAMGA MESSADO Lydie - « Interactions entre les orchidées épiphytes et leurs pollinisateurs » .Encadrants Bonaventure Sonké(univ.Yaoudé), Vincent Droissart (IRD) & Florent Martos,  ISYEB.

• KLEIN Estelle - « Understanding the relation between morpho-functional patterns and burrowing performance in moles : a bio-inspired approach » Encadrants Raphaël Cornette, ISYEB ;  Damien Chablat & Mathieu Porez

• KOCH Léa - « Evolution des dispersions natale et adulte : héritabilité et sélection naturelle chez un organisme ectotherme » Encadrant(e)s Pierre de Villemereuil, , ISYEB & Jean-François le Galliard, IEES.

• LACOME Lilian - « Comment l’océan profond façonne-t-il la biodiversité ? Une approche phylogénétique intégrant données moléculaires et registre fossile des téléostéens » . Encadrants : Eric Queinnec, Donald Davesne , ISYEB & Gaël Clément ,CR2P.

• LE FLANCHEC Thomas : « Coévolution entre le virus Monkeypox et ses hôtes ». Encadrants Alexandre Hassanin, ISYEB  & Antoine Gessain, Institut Pasteur.

• LE FLOCH Glenn - « Écologie comportementale et évolutive des associations interspécifiques d’oiseaux limicoles (Aves, Chadriiformes) en migration et en hivernage » Encadrants Michel Baguette & Vincent Bels, ISYEB.

• Le GOUELLEC Maël - « Histoire évolutive de la baleine à bosse (Megaptera novaeangliae) dans l’hémisphère Sud : apport des données de séquençage du génome entier ».
  Co-encadrement entre Stefano Mona et Jean-Luc Jung.

• Le QUELLEC Pauline : Inspiration des structures d’échinodermes et valorisation de ressources marines pour la confection par impression 4D pour des applications marine. Encadrant(e)s Nadia Ameziane, ISYEB & Mickaël Castro (IRDL, UBS).

• MELEKIAN Alice - « Biomécanique de la morsure chez les marsupiaux actuels et fossiles : méthodes de dissection manuelle et virtuelle » Encadrantes Géraldine Veron,  ISYEB & Sandrine Ladevèze (CR2P) 

• MORHAIN Brice - « Quels processus expliquent la diversité taxonomique et adaptative des animaux benthiques? Etudes de la lignée des Polynoidae à traves les différentes biomes et régions de l’océan mondial. » Encadrant(e)s SAMADI Sarah, ISYEB & Stéphane HOURDEZ 

• NAINIA Ayoub  - « Extraction automatique d’informations à partir de la littérature taxonomique par l’intelligence artificielle ». Encadrante Régine Vignes Lebbe, ISYEB & Hajar Mousannif.

• NGUYEN Khac Dieu - « Étude des bambous épineux (Poaceae, Bambusoideae) Vietnam : Morphologie, Classification et Identification » Encadrants Régine Vignes & Marc Pignal, ISYEB

• OMARJEE Abdelmajid - « Développement de  méthodes d’inférence de démographique en génétique des populations pour une application en biologie de la conservation. »  Encadrants Jérome Fuchs ISYEB, Guillaume Achaz & Amory Lambert, Collège de France.

• PARSEKIAN Antoine - « Co-évolution des formes et des couleurs chez les papillons du genre Charaxes » Encadrant(e)s : Vincent Debat & Marianne Elias, ISYEB.

• PERY Marine - « Ontogénie et variabilité individuelle des comportements d’acquisition de la nourriture chez les oiseaux limicoles (Aves, Charadriiformes, Charadrii et Scolopaci). » Encadrants : Michel Baguette, Vincent Bels, ISYEB & Eric Feunteun, BOREA

• RASMUSSEN Bruno - « Etude taxonomique et écologique des microlépidoptères : pour une écologie de la restauration des forêts naturelles de Polynésie française. » Encadrants : Joël Minet, Rodolphe Rougerie, ISYEB & Jean-Yves Meyer, délégation à la recherche de la Polynésie française, SECOPOL.

• REMI Pierre - « Caractérisation de bactéries géantes sulfo-oxydantes en lien avec le fonctionnement des mangroves » Encadrants Olivier Gros, ISYEB & Jean-Marie Volland.

• RIOU Manon - «  Diversité des baleines à bosse de Madagascar : importance de la fidélité aux habitats et du comportement migratoire à la lumière du changement global de l’Océan mondial « .  Encadrants Jean-Luc Jung, ISYEB & Olivier Adam, LAM (SU)

• ROUSSEAU Jeremy - « Innovations structurales et fonctionnelles chez les dinoflagellés : l’alliance des masses de données omiques et de l’apprentissage profond nous permet-elle de les identifier ? » Encadrantes Lucie Bittner & Mathilde Carpentier ISYEB.
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  ROYER Louna « Multidisciplinary study of a key innovation: Comparative transcriptomics and physicochemical analysis of the harmonic hopping phenomenon in the Lebinthini crickets ». Encadrants : Antonia Monteiro, National University of Singapore & Tony Robillard, ISYEB. 

• SACHOT Pierre - “Dynamiques spatio-temporelles de la communauté de micromammifères de la ville de Paris: enjeux socio-territoriaux et écologiques.” Encadrante Aude Lalis, ISYEB.

• SUCIU Stéphanie - « Écologie de l’interaction cétacés/céphalopodes aux Açores » Encadrants José M N Azevedo, Université des Acores & Jean-Luc Jung, ISYEB.

• WANG Dero - « Une approche génomique de l’évolution des coraux noirs le long d’un gradient de profondeur ».
  Co-direction Sarah Samadi, Didier Aurelle, & Magalie Castelin, ISYEB.

• YU Zheyuan - « Patrons biogéographiques et dynamique de diversification des Eneopterinae (Orthoptera, Gryllidae). Encadrants Tony Robillard, ISYEB ; Gaël Kergoat (CBGP) & ZhuQing He (Univ. Shanghai).