Depuis 1998 par année et par ordre alphabétique des doctorants.
- 2023,2022,2021,2020,2019, 2018, 2017 2016, 2015, 2014, 2013, 2012, 2011, 2010, 2009,
2008, 2007, 2006, 2005, 2004, 2003, 2002, 2000, 1999, 1998
2024
- ARACHELOFF Camille - "Adaptation et biophysique du vol chez les libellules (Insecta Odonatoptera) : contexte évolutif et fonctionnel, base d'une paléo-inspiration". Encadrant Romain Garrouste, ISYEB. (Thèse soutenue le 10 Octobre 2024)
- Juliette Berger - Socialité et convergence : apport de données écomorphologiques et transcriptomiques" Encadrants Frédéric Legendre et Phlippe Grandcolas ISYEB (Thèse soutenue le 2 avril 2024)
- BUCHER Manon - "Les grandes extinctions de masse ont-elles impacté l’évolution des Insectes : le cas des Hémiptères". Encadrant Thierry Bourgoin, ISYEB. (Thèse soutenue le 17 mai 2024)
- DE BAUDOIN Adèle - "Sauvegarde des paysages sonores : transcription, représentation et visualisation sonore pour la musique électroacoustique et l'écologie". Encadrants Jérôme Sueur, ISYEB & Pierre Courprie, Université Evry-Paris-Saclay. (Thèse soutenue le 31 mai 2024)
- FERNANDEZ Desamarie - "Partage de niche écologique des carnivores sur l'île de Palawan aux Philippines" Encadrant(e)s Pierre-Michel Forget, MECADEV & Géraldine Veron, ISYEB. (Thèse soutenue le 28 juin 2024)
- GAIDDON Teddy - "Des sauts d’harmoniques aux métasurfaces acoustiques : Apport de la modélisation acoustique non linéaire pour l’étude des innovations évolutives et la recherche de métamatériaux". Encadrants Tony Robillard, Philippe Grandcolas, ISYEB & Vincent Tournat, LAUM, Le Mans. (Thèse soutenue le 28 juin 2024)
- GRASSO Gianluca - "HoloHerbarium: herbaria preserve plant microbiota responses to environmental changes". Encadrant Roland Marmeisse, ISYEB. (Thèse soutenue le 7 octobre 2024)
- JOUAULT Corentin - "Impact des interactions biotiques et paléo-évènements sur la diversification des Insecta" Encadrants Frédéric Legendre & André Nel, ISYEB; Vincent Perrichot, Univ.Rennes & Fabien condamine, ISE Montpellier. (Thèse soutenue le 10 juillet 2024)
- LEMARCIS Thomas - "Impact de la distance phylogénétique sur le succès de capture des exons chez les néogastéropodes" Encadrants Nicolas Puillandre. ISYEB. (Thèse soutenue le 26 avril 2024)
- LAURENT-WEBB Liam - "Les réseaux mycorhiziens et endophytiques dans les écosystèmes tempérés et désertiques". Encadrants Marc-André Selosse, ISYEB & Marc Ducousso, CIRAD. (Thèse soutenue le 9 avril 2024)
- MAURICE Kenji - "Structuration des communautés et des réseaux microbiens des sols et des plantes dans un écosystème aride". Encadrants Marc Ducossau, UMR AGAP Montpellier & Marc-André Selosse, ISYEB. (Thèse soutenue le 4 avril 2024)
2023
- CHATELAIN Paul - ""Mimétisme Müllérien et déclin de pollinisateur". Encadrantes Claire Villemant, ISYEB & Isabelle Dajoz, UMR 7618, Institut d'Écologie de Paris. (Thèse soutenue le 15 septembre 2023).
- COLLOBERT Géromine - "Evolution de l’épiphytisme chez les plantes vasculaires et impact sur leur diversification". Encadrants Jean-Yves Dubuisson & Florent Martos, ISYEB. (Thèse soutenue le 22 décembre 2023)
- COUEDEL Marion - "Étude du cryptobiome récifal des Mascareignes : apports des mini-récifs artificiels (ARMS) couplés aux approches d’écologie moléculaire" Encadrantes Agnès Dettai, ISYEB et Mireille Guillaume, MNHN. (Thèse soutenue le 27 juin 2023).
- DORE Maël - "Évolution et biodiversité chez les papillons mimétiques néotropicaux face aux changements globaux" (replay) (Biodiversity and evolution of neotropical Müllerian mimetic butterflies facing climate change).Encadrant(e)s Marianne Elias, ISYEB & Colin Fontaine, CESCO.(Thèse soutenue le 1er juin 2023).
- JEAN-PIERRE Aurélie : "Influence des facteurs environnementaux sur la répartition et l'abondance de quatre espèces d'oiseaux, d'intérêt patrimonial et cynégétique dans les forêts de la Guadeloupe". Encadrante Gladys LORANGER-MERCIRIS, ISYEB. (Thèse soutenue le 15 décembre 2023)
- JOURDAIN-FIEVET Lucile : "Morphométrie et phylogénomique au service de la biodiversité : systématique de Dombeya section Dombeya (Malvaceae)." Encadrants Jean-Yves Dubuisson ISYEB & Timothée Le Pechon. (Thèse soutenue le 8 décembre 2023)
- LESTURGIE Pierre - "From (super)genes to ecosystems through the lens of genomics: different shades of genetic diversity in marine organisms". Encadrant(e)s Stefano Mona & Manuela Lopez-Villavicencio ISYEB. (Thèse soutenue le 13 décembre 2023)
- LINCHAMPS Pierre - "Diversité et évolution des faunes de micromammifères quaternaires d’Afrique du Sud : nouvelles approches pour la reconstruction des paléoenvironnements des Hominines anciens" Encadrant(e)s Raphaël Cornette ISYEB, Pierre Latouche & Emmanuelle Stoetzel. (Thèse soutenue le 8 decembre 2023)
- MALEM Julien - "Apports de la Géologie dans l'analyse biogéographique de la Nouvelle-Calédonie". Encadrants Frédéric Legendre Tony Robillard, ISYEB & Dominique Cluzel, Université de Nouvelle Calédonie. (Thèse soutenue le 19 Octobre 2023)
- OBAID Sarah - "Acoustic monitoring of wetland habitats in dry regions: bird community dynamics related to migration". Encadrants Jérôme Sueur, ISYEB & Frédéric Jiguet, CESCO. (Thèse soutenue le 18 janvier 2023)
- OSSOLA Violaine - "Adaptation thermique des papillons tropicaux aux ailes transparentes". Encadrantes Marianne Elias, ISYEB & Doris Gomez, CEFE. (Thèse soutenue le 14 décembre 2023)
- SALIBA Elie "Understanding and managing Zoological Nomenclature in the era of Big Data and Open Science" Encadrantes Annemarie Ohler & Régine Vignes-Lebbe ISYEB. (Thèse soutenue le 6 décembre 2023)
- VOET Inessa - "Processus de diversification des musaraignes afrotropicales" (Replay). Encadrant(e)s Violaine Nicolas & Raphaël Cornette, ISYEB. (Thèse soutenue le 9 mars 2023).
2022
- ALILI Rohia - "Microbiote intestinal et obésité : Intérêt du séquençage par nanopore dans la détection des signatures métagénomiques dans l'obésité et lors d'interventions nutritionnelles". Co-encadrant(e)s Thierry Wirth & Karine Clément. (Thèse soutenue le 2 février 2022).
- BENAVIDES José-Luis - "Study of communication and acoustic behaviour of Eneopterinae crickets (Orthoptera: Gryllidae) ". Encadrants Tony Robillard, ISYEB ; Hannah ter Hofstede, Dartmouth college NH, USA et Carlos Sperber, Univ. Viçosa, Brésil. (Thèse soutenue le 9 février 2022)
- BERNARD Charles - "Réseaux de communication au sein de communautés microbiennes environnementales" Encadrants Philippe Lopez et Eric Bapteste, ISYEB; Yantan Li, MCAM. (Thèse soutenue le 20 janvier 2022)
- CHANIAL Elisa - "La numérisation des soins de proximité : une approche phylogénétique en sciences de gestion". Co-encadrants Etienne Maclouf & Guillaume Lecointre. (2022) Thèse soutenue le 30 novembre 2022)
- CHOTARD Ariane - "Evolution des queues chez les Papilionidae (Lepidoptera): approches macro évolutive et expérimentale" (replay). Encadrant(e)s Violaine Llaurens & Vincent Debat, ISYEB.(Thèse soutenue le16 décembre 2022)
- CONJARD Suzanne - "Les Gerroidea (Insecta Hemiptera) des habitats marins de Guadeloupe: taxonomie intégrative, écologie et interactions microbiennes". Co-encadrants Olivier Gros & Romain Garrouste ISYEB. (Thèse soutenue le 25 novembre 2022)
- FIGURA Tomas - "Mixotrophie chez les orchidées et les pyroles (Ericacées)". Encadrants Jan Ponaert, Université Charles, Prague & Marc-André Selosse, ISYEB.
- HANAFI-PORTIER Mélissa - Structure spatiale à multi-échelles de la biodiversité benthique des monts sous-marins et pentes insulaires à partir de l'analyse d'images : approches méthodologiques et rôle de l'habitat". Encadrantes Sarah Samadi, ISYEB & Karine Olu, IFREMER Brest. (Thèse soutenue le 21 Octobre 2022 à Brest)
- HUMANN-GUILLEMINOT Ségolène - "Contamination diffuse des néonicotinoides dans les habitats agricoles et effets sublétaux chez le moineau domestique " Encadrant Pierre-Henri Gouyon, ISYEB. (Thèse soutenue le 19 septembre 2022)
- MAISONNEUVE Ludovic - "Étude du conflit entre sélection sexuelle et adaptation: une approche mathématique" (replay). Co-encadrantes Violaine Llaurens, ISYEB et Charline Smadi, UPS3611 Institut national de recherche en science et technologie de l'environnement et de l'agriculture. (Thèse soutenue le 21 septembre 2022)
- PAEZ Erika "Ecologie des communautés et évolution du motif coloré au sein du genre de papillon néotropical Adelpha (Nymphalidae)" (replay). Co-encadrants Marianne Elias, ISYEB et Keith Willmott, université de Gainesville USA. (Thèse soutenue le 24 juin 2022)
- PAPALE François - "Cohérentisme historique et pratiques classificatoires: la phylogénétique contemporaine comme cas d'étude". Encadrants E. Bapteste, ISYEB & Frédéric Bouchard, ,Univ. Montréal, Canada. (thèse soutenure le 31 mars 2022)
- PETROLLI Rémi - "Symbioses mycorhiziennes de orchidées : approche fonctionnelle et évolutive" Encadrants Marc-André Selosse, Pierre-Henri Gouyon & Florent Martos, ISYEB. (Thèse soutenue le 29 novembre 2022)
- - Ramahandrison Andriamirado Tahina" Impact des perturbations anthropiques de la végétation et du milieu aquatique sur la diversité des coléoptères adéphages aquatiques (Hydradephaga) de Madagascar et quelques avancées dans la taxonomie du groupe". Co-encadrants Bakolimalala Rakouth & Michaël Manuel ISYEB.(Thèse soutenue le 14 decembre 2022)
- Sivager Gary - Identification des déterminants physiologiques et moléculaires à l’origine de la réponse différentielle d’agrumes diploïdes et polyploïdes vis-à-vis de la maladie du Huanglongbing (HLB). Co-encadrants Raphael Morillon & Olivier Gros ISYEB. (Thèse soutenue le 29 avril 2022)
- TAHAR Mathilde - "Par delà tout finalisme : Bergson critique des évolutionnistes". Encadrants Pierre-Henri Gouyon, ISYEB & Paul Antoine Miquel, Université Toulouse 2. (Thèse soutenue le 23 septembre 2022)
- TERRAY Léa - "Impacts des changements climatiques sur le phénotype des petits mammifères marocains du Pléistocène à l'Anthropocène" (replay). Co-encadrants Raphaël Cornette, ISYEB et Pascale Braconnot LSCE-CEA. (Thèse soutenue le 1er avril 2022)
- TER-OVANESSIAN Louis - "Apparition d’un métabolisme primitif dans les scénarios géochimiques d’origine de la vie avant le « monde ARN " (replay). Encadrant(e)s Marie-Christine Maurel, ISYEB & Jean-François Lambert, SU UMR 7197 (LRS). (Thèse soutenue le 16 décembre 2022)
- ZALKO Julie - "Limites d'espèces, différenciation écologique et adaptations morpho-anatomiques dans un jeune groupe de légumineuses endémiques néocalédoniennes (Arthroclianthus Baill., Nephrodesmus SchindL)" Co-encadrants Florian Jabbour, Thierry Deroin et Corinne Sarthou, ISYEB. (Thèse soutenue le 23 mai 2022)
2021
- CAMPOS Paola - >Apports de l'ADN ancien dans l'étude de l'émergence et de l'évolution d'agents pathogènes de cultures".(replay). Co-encadrants Nathalie Becker, ISYEB ; Adrien Rieux, UMR PVBMT, CR-CIRAD-Université de La Réunion, St Pierre 97410 & Lionel Gagnevin, CR-CIRAD, UMR PHIM Montpellier. (Thèse soutenue le 8 décembre 2021).
- DA SILVA Ophélie - "Impacts de la diversité planctonique sur les cycles biogéochimiques océaniques : intégration des données omics dans les modèles de fonctionnement des écosystèmes". Encadrant(e)s Lucie Bittner, ISYEB ; Fabien Lombard & Lionel Guidi, Laboratoire Océanographique de Villefranche-sur-mer.
- DUROCHER Marine - "Histoires biologique et culturelle de deux rongeurs emblématiques des Petites Antilles : approches bioarchéologiques" Co-encadrant(e)s Sandrine Grouard, Allowen Evin & Violaine Nicolas ISYEB. (Thèse soutenue le 7 juillet 2021).
- GARDERE Mathieu - "Origine de l’endémisme en milieu insulaire : le modèle des Campanules de l’archipel du Cap Vert". Encadrants Serge Muller et Jean-Yves Dubuisson, ISYEB. (Thèse soutenue le 14 septembre 2021)
- GALIPOT Pierre - "Caractérisation de la morphogenèse des pétales à forme élaborée". Co-encadrants Florian Jabbour, ISYEB et Catherine Damerval, Laboratoire génétique quantitative et évolution Le Moulon, Gif-sur-Yvette. (Thèse soutenue le 22 septembre 2021).
- JACQUIER Lauren - "Réponse à l’urbanisation d’un insecte eusocial : interconnexion des réponses génétiques, plastiques, et rôle de l’environnement social"ED MNHN-SU. Co-encadrants Claudie Doums, ISYEB et Mathieu Molet, IESS Paris à Sorbonne Université. (Thèse soutenue le 29 septembre 2021).
- KERDONCUFF Elise -Méthodes d’inférence démographique récente utilisant les polymorphismes et leur liaison génétique".(replay). Co-encadrants Guillaume Achaz, ISYEB et Amaury Lambert, Collège de France. (Thèse soutenue le 12 novembre 2021).
- LABBACI Asma - "Bioecologie de quelques espèces de Formicidae notamment le genre Tapinoma dans le parc national du Djurdjura nord d'Algérie". Encadrantes Amel MILLA (ENSV) et Claudie Doums, ISYEB.( Thèse soutenue le 13 septembre 2021)
- PEREZ-LAMARQUE Benoît. "Caractérisation et modélisation de l'évolution des interactions hôtes-microbiotes" (replay). Co-encadrants Hélène Morlon, Institut de Biologie Ecole Normale Superieure UMR 8197 ; directeur de thèse Marc-André Selosse, ISYEB et co-directeur de thèse, Florent Martos, ISYEB. (Thèse soutenue le 29 juin 2021).
- PINNA Charline - Evolution de la transparence chez les lépidoptères mimétiques" (replay). Co-encadrantes Marianne Elias, ISYEB ; Christine Andraud et Doris Gomez, CEFE Montpellier. (Thèse soutenue le 17 décembre 2021).
- REY-RODRIGUEZ Yvan - "Reconstructing past climate and environment using rodent assemblages from the Middle to Late Pleistocene in western As" (replay). Co-encadrantes Christiane Denys, ISYEB et Emmanuelle STOETZEL, UMR7194. (Thèse soutenue le 14 avril 2021)
- ROMEÏ Martin - "Existe-t-il un signal phylogénétique dans les structures tridimensionnelles des protéines ?" Encadrant(e)s Guillaume Lecointre, Mathilde Carpentier, ISYEB & Jacques Chomilier, IMPMC. (Thèse soutenue le 2 décembre 2021)
- SALAZAR NINO Karen-Andréa - "Does and how the environment impact the biodiversity: contrasting European and South-American ladybird beetles". Encadrants Guillaume Achaz et Romain Nattier, ISYEB. (Thèse soutenue le 10 décembre 2021)
SCHUBNEL Thomas "L’évolution des insectes passée aux rayons X : étude des homologies de nervation alaire via la µCT et le registre fossile" (replay). Encadrants André Nel, Laure Desutter et Frédéric Legendre, ISYEB. (Thèse soutenue le 7 décembre 2021)
2020
- ARNAL Pierre - "Approche phylogénomique de la dynamique spatiale et temporelle de diversification chez les insectes" : Analyse des patrons globaux de diversité chez les Lépidoptères Saturniidae et Sphingidae". Encadrants Marianne Elias et Rodolphe Rougerie, ISYEB. (Thèse soutenue le 14 décembre 2020.)
- BOUARAKIA Oussama - " Etude intégrative de rongeurs Gerbillinés des zones anthropisées du Maroc septentrional: approche morphométrique et moléculaire". Encadrantes Christiane Denys et Violaine Nicolas, ISYEB. Aziz BenhoussaUniv.Mohammed V Rabat, Maroc. (Thèse soutenue le 22 septembre 2020)
- FAURE Emile - "Apport des données méta-omiques dans la détection et la quantification des traits fonctionnels au sein des écosystèmes planctoniques" (replay) Co-encadrants Lucie Bittner, ISYEB et Sakina-Dorothée Ayata, Laboratoire Océanographique de Villefranche-sur-mer. (Thèse soutenue le 2 décembre 2020)
- HONORIO Romain - "Evolution morphologique : importance de la vie sociale et de la plasticité phénotypique sur la diversité morphologique dans les sociétés de fourmis". Encadrant(e)s Claudie Doums, ISYEB & Mathieu Molet , IESS Paris à Sorbonne Université. (Thèse soutenue le 18 décembre 2020.)
- LE ROY Camille -.Evolution des comportements de vol et diversification en sympatrie : les papillons Morpho comme cas d’étude " (replay) . Co-encadrants Vincent Debat, Violaine Llaurens, ISYEB et Florian Muijres, Univesrité de Wageningen, Pays Bas.(Thèse soutenue le 17 décembre 2020)
- LOUPPE Vivien - "Mobilité de l’homme et son impact sur l’environnement par l’étude de la dispersion et de l’adaptation des carnivores sauvages invasifs aux Antilles". Encadrante Géraldine Véron, ISYEB. (Thèse soutenue le 17 juillet 2020).
- LUKIC Marko - "Systematics and biogeography of the subgenus Heteromurus (Verhoeffiella) (Collembola, Entomobryidae) in the Dinaric Karst". Co-encadrants Louis Deharveng, ISYEB et Maja Zagmajster, Ljubljana, Slovénie. (Thèse soutenue le 6 mai 2020).
- BENOISTON Anne-Sophie - "Méta-omics et méta-données océanographiques: vers une nouvelle compréhension de la pompe à carbone biologique à l'échelle globale. Co-encadrement Lucie Bittner, ISYEB et Lionel Guidi, Laboratoire Océanographique de Villefranche-sur-mer. (Thèse soutenue le 26 septembre 2019).
- BOLANOS-SITTLER Pablo - "Suivi acoustique de la dynamique d’une population menacée du quetzal (Pharomachrus mocinno mocinno), oiseau porte-drapeau de la biodiversité du Guatemala". Encadrants Jérôme Sueur, ISYEB et Thierry Aubin, Université Paris-Saclay. (Thèse soutenue le 18 janvier 2019.)
- DELAUNAY Mathilde - "Comment faciliter l'identification de l'entomofaune ? Construction, évaluation et amélioration de clés d'identification numériques". Encadrants Romain Nattier et Régine Vignes-Lebbe, ISYEB. (Thèse soutenue le 10 mai 2019).
- ESPINOSA Felipe - "Tératologie florale chez les Ranunculaceae". Encadrants Florian Jabbour, ISYEB et Sophie Nadot, Paris sud. (Thèse soutenue le 29 mai 2019).
- FERNANDEZ-GARCIA Monica - "Late Pleistocene palaeoenvironmental reconstruction of Northeastern Iberia : taxonomic, taphonomic and isotopic approach based on small-mammal assemblages". Encadrant(e)s Christiane Denys, ISYEB ; Juan Manuel Lopez-Garcia & Marta Arzarello. (Thèse soutenue le 29 mars 2019)
- INSISIENGMAY Oudomphone “Systematics of Kaempferia L. (Zingiberaceae family) in Cambodia, Laos and Vietnam". Co-encadrants T. Haevermans (50%), ISYEB et M. Newman, Royal Botanic Garden, Edinburg, Écosse,UK. (Thèse soutenue le 28 février 2019.)
- KONDRATYEVA Anna - "Apports des mesures d’originalités phylogénétiques et fonctionnelles en écologie". Co-encadrants Philippe Grandcolas, ISYEB et Sandrine Pavoine, CESCO. (Thèse soutenue le 11 decembre 2019).
- LANNES Romain - "Recherche de séquences environnementales inconnues d'intérêt médical ou biologique au moyen de grands réseaux de similarité de séquences". Encadrants Philippe Lopez et Eric Bapteste, ISYEB. (Thèse soutenue le 19 novembre 2019).
- MICHAUD Margot - "Peut-on définir une radiation adaptative ? Etude du taux de diversification moléculaire versus disparité phénotypique chez les mammifères Carnivora". Co-encadrants Géraldine Véron, ISYEB / Stéphane Peigné et Anne-Claire Fabre, CR2P. (Thèse soutenue le 12 décembre 2019).
- PETZOLD Alice - "Biodiversité actuelle et historique des girafes. Apport des nouvelles technologies de séquençage". Co-encadrants Alexandre Hassanin, ISYEB & Michel Saint-Jalme, CESCO.(Thèse soutenue le 10 septembre 2019).
- RABEAU Lucile - "Diversité et radiations évolutives dans le genre d’hépatiques Riccia (Ricciaceae, Marchantiidae) : approches phylogénétiques et intégratives". Co-encadrants Jean-Yves Dubuisson et Catherine Reeb, ISYEB. (Thèse soutenue le 20 mars 2019).
- SCHNEIDER-MAUNOURY Laure - "Écologie et dynamique génétique des populations de truffe noire" (Tuber melanosporum). Encadrant Marc-André Selosse, ISYEB. (Thèse soutenure le 21 octobre 2019).
- SCULFORT Ombeline - "Histoire d’une convergence évolutive : évolution des défenses chimiques au sein de communautés de papillons mimétiques". Référents Violaine Llaurens, ISYEB et Bastien May. (Thèse sourtenue le 18 décembre 2019).
- ZAHARIAS Paul - "Taxonomie intégrative, spéciation et diversification des Turridae". (Gastropoda, Conoidea).Encadrant Nicolas Puillandre, ISYEB. (Thèse soutenue le 13 décembre 2019).
- AUBIER Thomas - "Diversity of warning signals, speciation and clade diversification" Encadrant principal Mathieu Joron, Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive de Montpellier et Marianne Elias, ISYEB. (Thèse soutenue le 14 sept.2018)
- AUVINET Juliette - "Histoire évolutive des remaniements chromosomiques en liaison avec la mobilisation d'éléments transposables chez les téléostéens antarctiques Nototheniidae : la radiation adaptative du groupe " Trematomus "".Co-encadrants Agnès Dettaï, ISYEB et Dominique Higuet, UMR 7138. (Thèse soutenue le 19 octobre 2018)
- BARY Sophie - "Les représentations de la biodiversité dans les fonds marins : une approche épistémologique et scientifique". Encadrante Sarah Samadi, ISYEB & Anouk Barberousse. (Thèse soutenue le 24 octobre 2018)
- DEL RIO Cédric - « Les Icacinaceae du Paléogène du Bassin Parisien (Co-encadrants Thomas Haevermans (33%), ISYEB / Dario de Franceschi (33%) CR2P et R. Thomas (33%). (Thèse soutenue le 16 novembre 2018)
- DIAS TARLI Vitor -"Taxinomie, Phylogénie et Distribution du genre Monastria Saussure, 1864 (Blattaria,Blaberidae) dans la forêt Atlantique brésilienne". (Co-direction Rosely Pellens/Philippe Grandcolas, UMR 7205) Thèse soutenue le 30 janvier 2018)
- DJELAILA Yassine - "Étude de la biométrie morpho-cranio-dentaire du complexe d’espèces Mériones shawii-grandis ( Mammalia : Rodentia) en Algérie, en Tunisie et au Maroc)". Université de Tizi-Ozou (Algerie),Co-encadrantes Malika Djerbaoui & Christiane Denys, UMR 7205.
- LALLEMAND Félix - "Évolution des interactions mycorhiziennes et de la mycohétérotrophie chez les orchidées". Encadrant Marc-André Selosse, ISYEB. (Thèse soutenue le 30 octobre 2018)
- LAPIERRE Marguerite - "Les modèles de références en évolution moléculaire". Co-encadrants Guillaume Achaz, ISYEB et Lambert Amaury, Collège de France. (Thèse soutenue le 25 septembre 2018)
- MANDON Perrine - "Origine évolutive des organismes phares des milieux hydrothermaux". Encadrante Sarah Samadi, ISYEB & Stéphane Hourdez (Thèse soutenue le 18 Sept. 2018)
- PALLANDRE Jean-Pierre "Etude de la variation de l’articulation sacro-iliaque chez les Carnivores" . Encadrant Vincent Bels, ISYEB. (Thèse soutenue le 18 décembre 2018)
- SABROUX Romain - "Biodiversité et histoire évolutive des Pycnogonides (Arthropoda : Pycnogonida)". Encadrants Alexandre Hassanin et Laure Corbari, ISYEB. (Thèse soutenue le 7 décembre 2018)
- SHAYYA Salman - "Forensic entomology and its application in Lebanon" Co-encadrants André Nel, ISYEB et D. Azar. (Thèse soutenue le 28 Sept. 2018)
- ULLOA Juan - "Estimation de la diversité acoustique animale en forêt tropicale". Encadrants de Thierry Aubin et de Jérôme Sueur. ISYEB.(Thèse soutenue le 11 juin 2018)
- VIERA Conrado Augusto - "Tulasnella distribuition and carbon flux in tropical epiphytic orchid" - Encadrants M.A Selosse, ISYEB & C. KASUYA, Viçosa. (Thèse soutenue)
- ZON Serge - "Diversity et structure des communautés de collemboles dans une mosaïque paysagère du centre de la CÔTE D’IVOIRE (Zougoussi, département de Toumodi)" Encadrants Yao Tano & Louis Deharveng ISYEB. (Thèse soutenue le 27 janvier 2018)
- BARBIER Maxime - "Histoire évolutive et propagation de la tuberculose à l’échelle planétaire : vers une approche intégrée combinant la génomique des populations et le typage multi-locus". (Encadrant Thierry Wirth, UMR 7205).Thèse soutenue en 2017
- BAURET Lucie - "Dynamique de formation d’un point chaud de diversité : l’exemple des fougères de Madagascar".(co-encadrants Myriam Gaudeul/Germinal Rouhan/Marc-André Selosse, UMR 7205). Thèse soutenue le 5 dec. 2017
- CAESAR Maram - "Systématique, évaluation et amélioration des connaissances taxonomiques sur la biodiversité". co-direction Roseli Pellens, Philippe Grandcolas & Jérôme Sueur ISYEB(Thèse soutenue le 15 juin 2017)
- DONG Jiajia - "Systématique et biogéographie du genre Cardiodactylus (Orthoptères : Eneopterinae : Lebinthini)" en Asie du Sud-Est (Co-encadrants Tony Robillard, UMR 7205 et Shengquan Xu).
- HSIN Lee - "Biodiversity Exploration and Phylogeny of Cocculiniform Gastropods" (Encadrant(e) Sarah Samadi, ISYEB & Wei-Jen Chen . (Thèse soutenue le 7 juillet 2017)
- LEFEBVRE Vincent - "Origine de la diversité des insectes pollinisateurs d’altitude : Le cas des diptères Empidinae dans le Parc National du Mercantour".(Co-Encadrant(e)s Claire Villemant, ISYEB & Christophe Daugeron. (Thèse soutenue le 22 novembre 2017)
- SANDERS Malcolm - "Chronologie de la diversification des Bursidae Thiele, 1929 (Gastropoda, Tonnoidea)". (Co-encadrants Nicolas Puillandre, ISYEB / Michel Laurin & Didier Merle). (Thèse soutenue le 8 décembre 2017.)
- TROUDET Julien - "Biodiversity occurences and patterns from the angle of systematics". Encadrant(e)s Frédéric Legendre & Régine Vignes-Lebbe, ISYEB. (Thèse soutenue le 29 novembre 2017.)
- Zhou Meng-Yuan- “Phylogeny and Systematics of Paleotropical bamboos (Poaceae – Bambusoideae)”. Co-encadrants Thomas Haevermans, ISYEB et De-Zhu Li Kunming, (Institute of Botany).(Thèse soutenue le 17 mai 2017)
- AISSAOUI Chrifia - "Néoendémisme de la faune malacologique du golfe de Gabés" (Encadrant Philippe Bouchet, UMR 7205).
- AKOUCHE Mariame - "Synsthèse in situ de nucléotides sur Silice". (Co-encadrants Jean-François Lambert, UMR 7197/UPMC et Marie-Christine Maurel, UMR 7205.)
- AMROUCHE-LARABI Lilia - "Systématique et Ecologie des musaraignes de Kabilye".(Co-encadrants Christiane Denys/Violaine Llaurens, UMR 7205).
- ANSO Jérémy - "Maintien à long terme des communautés d’insectes forestiers dans un contexte de changement global : Interactions entre communautés de grillons et espèces envahissantes de fourmis en Nouvelle-Calédonie" co-encadrants (Laure Desutter-Grandcolas, UMR 7205 / Hervé Jourdan, Université de Nouvelle Calédonie / IRD).
- BEDHENNA Abdelkader - (Encadrants Achaz Guillaume/Lambert Amaury).
- BOCHATON Corentin - "Squamates du Pléistocène supérieur et de l’Holocène de l’archipel guadeloupéen : évolution de la biodiversité et interactions avec l’homme".(Encadrant Ivan Ineich, UMR 7205).
- BOHAOUSSOU Kouakou Hilaire - "Diversité génétique et morphologique au sein du genre Malacomys (Rongeur, Muridae)". (Encadrante Violaine Nicolas, UMR 7205).
- CACHEUX Lauriane - "Rôle des séquences d’ADN centromérique dans les phénomènes de diversification et spéciation chromosomique chez les cercopithèques". (Encadrante Christiane Denys, UMR 7205).
- DA SILVA Laura - "Synthèse d’ARN en conditions prébiotiques". (Encadrante Marie-Christine Maurel, UMR 7205 et David Deamer (U.S.C.C. - USA).
- DAVESNE Donald - "La radiation initiale des acanthomorphes (Actinopterygii, Teleostei) : apport des fossiles et des données moléculaires."(co-encadrants Cyril Gallut et Guillaume Lecointre, UMR 7205).
- DESJONQUERE Camille - "Diversité et structure des communautés acoustiques subaquatiques des zones humides en milieu tempéré". (Co-direction Jérôme SUEUR, UMR 7205 et Fanny Rybak (CNPS-CNRS UMR 8195. Université Paris Sud).
- DIANAT Malahat - "Taxinomic revision of the genus Meriones by integrative molecular and morphological approach" (Encadrante Violaine Nicolas).
- FRAIMOUT Antoine -" Évolution de Drosophila suzukii en Europe". (Encadrant Vincent Debat, UMR 7205).
- MOUSSA Mirna - "Les amibes libres pathogènes des eaux chaudes de la Guadeloupe, étude écologique caractérisation moléculaire et prophylaxie des zones de baignade".(Co-encadrants Jérôme Guerlotté , UMR 7205 et Dr. Antoine Talarmin, Directeur de l’Institut Pasteur de Guadeloupe).
- NJUNJIC Iva "Evolution, adaptation and speciation in Anthroherpon Reitter, a genus of highly evolved subterranean Coleoptera". Encadrant principal Louis Deharveng, UMR 7205, co-encadrants Ivo Karaman (Serbie) et Michel Perreau (Université Diderot, Paris).
- WANG Menglin "Taxonomy, Phylogeny and Niche modelling of the Oriental and Palearctic Issidae (Hemiptera : fulgoromorpha)" (Co-encadrants Thierry Bourgoin, UMR 7205 et Yalin Zhang, Northwest A&F University, Chine)
- ZOUGHAILECH Abdelmalek - "Biodiversité comparée et endémisme des Collemboles de deux massifs Algériens dans un même contexte bioclimatique." (Encadrant principal Louis Deharveng, UMR 7205 ; co-encadrant Salah Hamra-Kroua (Constantine, Algérie).
- ZHOU Mengyuan - “Phylogeny and Systematics of Paleotropical bamboos (Poaceae – Bambusoideae)”. Encadrants T. Haevermans (50%), co-encadrement De-Zhu LI (50%) Kunming Institute of Botany, RPC)
- ARIAS Monica - "Origine et maintien de la variation adaptative dans un environnement variable".(co-encadrants Violaine Llaurens, UMR 7205 et Marc Théry UMR 7179), MNHN.
- BOUIGES Axelle -" Ecologie moléculaire de l’’écosystème forestier tropical africain". Encadrant Thierry Wirth, UMR 7205.
- CHAZOT Nicolas -" Diversité et structure phylogénétique de communautés de papillons mimétiques néotropicaux (Ithomiini) le long d’un gradient altitudinal." (Co-direction Philippe Grandcolas/Marianne Elias, UMR 7205.
- COMBY Morgane - "Bio-prospection, caractérisation et effet antagoniste d’endophytes isolés du blé contre la fusariose des épis". (Encadrante Joëlle Dupont, UMR 7205.)
- DAVESNE Donald - "La radiation initiale des acanthomorphes (Actinopterygii, Teleostei) : apport des fossiles et des données moléculaires."(co-encadrants Cyril Gallut et Guillaume Lecointre, UMR 7205).
- DE FREITAS VICENTE Natàlia-Maria - "Biogeography and integrative taxonomy of Eneopterinae crickets in South America." (Co-encadrant Karla Yotoko, Francisco De Mello et Tony Robillard, UMR 7205).
- DENYS Gaël - "Taxonomie intégrative des poissons d’eau douce de France métropolitaine" (Encadrante Agnès Dettaï, UMR 7205).
- FISLER Marie - "Histoire de la métaphore de l’arbre dans les Sciences Naturelles".
- GALINDO Lee-Ann - "Phylogénie, espèces crytiques et endémisme chez les Nassariidae : approche intégrative."
- GOUTTE Sandra - "L’adaptation au milieu torrenticole chez les Amphibiens Anoures : approches morphologiques, éco-éthologiques et phylogénétiques."
- HUBER Barbara - "Différenciation génomique, chimique et comportementale entre espèces proches chez les papillons Heliconius".(co-direction Mathieu JORON, Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive de Montpellier /Thierry WIRTH, EPHE, UMR 7205).
- PRIEU Charlotte -" Evolution et développement des grains de pollen chez les Angiospermes". (Encadrant Pierre-Henri Gouyon, UMR 7205).
- GOUTTE Sandra - "L’adaptation au milieu torrenticole chez les Amphibiens Anoures : approches morphologiques, éco-éthologiques et phylogénétiques."
- REEB Catherine - "Taxonomie intégrative du genre Riccardia (Aneuraceae, Marchantiophyta) en Afrique." (Encadrant Jean-Yves Dubuisson, UMR 7205).
- ROBUCHON Marine - "Deux cents ans de changements dans les communautés de macroalgues des côtes bretonnes. "(Encadrante Line Le Gall, UMR 7205).
- SLIMANI Noura - "Caractéristiques écologiques de l’habitat des hétéroptères aquatiques des bassins versants du nord-est tunisien".(Co-encadrants Eric Guilbert, UMR 7205 et Moncef Boumaiza, Université de Carthage, Tunisie).
- SOULEBEAU Anaëlle - "Moteurs de la diversification des plantes à Madagascar : liens entre biogéographie, écologie et histoire évolutive."(Co-encadrants Thomas Haevermans et Peter Lowry, UMR 7205).
ZGHIKH Leila - "Comment le fonctionnement (morphologie et dynamique) de l’appareil hyo-lingual des Squamates est-il modulé par leur stratégie alimentaire." (Denis Nonclerq Université de Mons, Institut des Biosciences/Vincent Bels, UMR 7205). Soutenance publique pour l’obtention du grade académique de Docteur en Sciences. (site : https://portail.umons.ac.be/FR/universite/facultes/fs/enseignement/doctorat/Pages/Soutenancepubliquedethesededoctorat.aspx)
- CHOUFANI Joanna - "Origine, taxinomie, évolution et systématique des Cératopogonidae (Diptera)".(Encadrant André Nel, UMR 7205).
- FERNANDES Simone - "Eels population genetics and conservation : an evolutionary perspective on declining stocks"
- HELFT Florence - "Sélection sexuelle et stratégie d’accouplement chez la fourmi polyandre Cataglyphis cursor". (Encadrante Claudie Doums, UMR 7205).
- JANION Charlène - "Springtail Diversity in the Cape Floristic Region" ( Equipe D.P.S.I.I.° Encadrant principal : Steven L. Chown, 5co-encadrants Jan Bengtsson Stellenbosch University (Afrique du Sud). et Louis Deharveng, UMR 7205.
- LE GROS Ariane - Rapid evolution in alien invasive species : study on morphological and genetic divergences invasives Ring-necked and Red-whiskered bulbuls.
- LE POUL Yann - Selection for mimicry in butterflies : Quantitative approaches on colour pattern resemblance and diversity (Co direction Mathieu JORON, Mariann ELIAS, Pierre-Henri GOUYON, UMR 7205).
- LY Ngoc-Sam - Biogéographie et Systématique des Musaceae d’Indochine : apports des données morphologiques et moléculaires. (Equipe D.E.V.F.)
- MELI Florent - Le balayage sélectif en contexte réel : étude moléculaire de l’invasion des allèles avantagés au sein des populations africaines de Drosophila melanogaster (Equipe B.I.P.E.M).
- MEROT Claire - La spéciation chez les papillons Heliconius : importance relative du mimétisme et de la divergence écologique.(Co-encadrants Mathieu JORON/Michel BAGUETTE, UMR 7205)
- SCHNEIDER Clément - "Systématique et phylogénie des Neelipleona (Collemboles)". (Encadrants : Louis Deharveng et Cyrille D’Haese, UMR 7205).
YU Daoyuan - "Systematics of Tomoceroidea Szeptycki, 1979 (Collembola : Entomobryomorpha)".(Encadrants : Feng Zhang, Nanjing University (Chine)/Louis Deharveng, UMR 7205).
- ABDELKRIM Jawad - Nouvelles technologies de séquençage et biodiversité.
- JANION Charlène - "Springtail Diversity in the Cape Floristic Region" (Encadrant principal : Steven L. Chown, co-encadrants Jan Bengtsson, Stellenbosch University, Afrique du Sud et Louis Deharveng, ISYEB).
- PRIE Vincent : Taxonomie et biogéographie des mollusques d’eau douce patrimoniaux : quelles échelles pour la délimitation des taxons et des unités de gestion ?
- Ly Ngoc-Sam « Biogéographie et Systématique des Musaceae d’Indochine : apports des données morphologiques et moléculaires. » Encadrants Thomas Haevermans & Porter P. Lowry II. ISYEB
- AUBRIOT Xavier - "Radiations évolutives, « innovations clés » et notions d’espèces dans le genre Euphorbia L. à Madagascar." Encadrants Thomas Haevermans & Porter P. Lowry II
- CORNETTE Raphaël - "Forme et fonction : modularité, disparité et performance de l’appareil manducateur de Crocidura russula (Soricomorpha, Soricidae)."
- GASC Amandine - "Analyse et suivi de la biodiversité animale par des techniques novatrices de bioacoustique."
- JACQUETFrançois - "Systématique et évolution des musaraignes d’Afrique Ouest-Centrale."
- LANGENFELD Aude - "Etude des bases moléculaires de l’interaction symbiotique de champignons endophytes et de la plante-hôte /Cephalotaxus harringtonia."
- MATAMORO VIDAL Alexis - "Etude de l’histoire évolutive de la morphologie du pollen des Euphorbiacées, et des mécanismes sous-jacents."
- NESI Nicolas - "Systématique et phylogéographie des chauves-souris africaines de la sous-famille des Epomophorinae (Chiroptera, Pteropodidae)."
- PERRARD Adrien - "Nervation Alaire, Taxonomie et Phylogénie du genre Vespa (Hymenoptera : Vespidae)."
- ROPARS Jeanne - "Exploration des génomes d’inoculums fongiques utilisés en fromagerie pour leur caractérisation taxonomique et phylogénétique et pourl’évaluation des contraintes liées à la domestication et à la perte du sexe chez ces organismes."
- SCHOELINK Charlotte - "Evolutionary systematics of Diplectanidae (Platyhelminthes, Monogenea) parasites of coral reef groupers (Perciformes, Serranidae)."
THUBAUTJustine - "Histoire évolutive et biologie des populations des mytilidés associés aux substrats organiques coulés. Approche comparative au sein des Bathymodiolinae des milieux réducteurs profonds."
TANCOIGNE Elise - "Evaluer la santé de la taxonomie zoologique : histoire, méthodes et enjeux contemporains. http://tel.archives-ouvertes.fr/ind..."
- ARABI Juliette - "Phylogénie des Chélicérates et évolution des taux de substitution dans leurs gènes mitochondriaux et nucléaires."
- CASTELIN Magalie - "Lien entre endémisme et développement larvaire en milieu marin : le cas des gastéropodes des monts sous-marins de la Zone Economique Exclusive de Nouvelle Calédonie."
- MISSOUP Alain Didier - "Systématique et biogéographie des rongeurs des forêts de la ligne volcanique du Caméroun (Afrique Ouest Centrale)."
JENNINGS Andrew P. - "Etude des facteurs expliquant la répartition et l’écologie des petits carnivores en Asie du sud."
- AGOLIN Mikaël - "Optimisation directe morpho-moléculaire de la phylogénie des Odontellidae : une méthode nouvelle au service de l’étude de l’évolution d’une famille de Collemboles Poduromorphes."
- BITTNER Lucie - "Phylogénie des Corallinales (Rhodophyta) et analyse de leur diversité génétique dans le Pacifique Sud" https://www.theses.fr/124602843
- EVIN Allowen - "Evolution des formes, insularité et phylogéographie des chauves-souris du bassin méditerranéen occidental."
- HERVÉ Christophe "Taxonomie du genre Drassodes Westring, 1851 (Aranae, Gnaphosidae), dans la région paléarctique ouest" Encadrantes Claie Villemant & Christine Rollard ISYEB. https://www.theses.fr/2009MNHN0033
- PATOU Marie-Lilith - "Phylogéographies comparées de petits carnivores d’Asie du Sud-est."
- STOETZEL Emmanuelle - "Les microvertébrés su site d’occupation D’El Harhoura 2 (Pleistocène supérieur - Holocène, Maroc) : systématique, taphonomie et paléoécologie."
- LALIS Aude - "Variabilité phénotypique et génétique des Mastomys (Rodentia, Muridae) de Guinée : Evolution, Environnement et Infection virale."
- LORION Julien - "Diversité et évolution des Mytilidae (Mollusca : Bivalvia) associés aux substrats organiques coulés."
- NGUEMBOCK Bill -"Biogéographie, phylogénie et phylogéographie des oiseaux du Cameroun."
PUILLANDRE Nicolas - "axonomie intégrative des Turridae : phylogénie, délimitation d’espèces et barcoding."
- FAILLE Arnaud - "Endémisme et Adaptation à la vie cavernicole chez les Trechinae pyrénéens (Coleoptera : Carabidae) . Approches moléculaire et morphométrique."
LEGENDRE Frédéric - "Phylogénie et évolution du comportement social chez les blattes et les termites".
- FUCHS Jérôme - " Biogéographie comparée des oiseaux forestiers de l’Ancien Monde : phylogénie et datation moléculaire"
- ROPIQUET Anne - "Etude des radiations adaptatives au sein des Antilopinae (Mammalia, Bovidae)"
- DUBOIS Jacques - "Phylogénie moléculaire et morphologique des Pimplinae (Hymenoptera, Ichneumonidae) parasites d’Araignées : scénarios évolutifs du parasitisme"
- MURIENNE Jérome - "Origine de la biodiversité en Nouvelle-Calédonie : Approche phylogénétique de l’endémisme et de la diversité écologique chez les Insectes Dictyoptères"
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CORDEIRA Pedro - S"ystématique et évolution morphologique du genre Calomys Waterhouse 1837 (Rodentia, Cricetidae, Sigmodontinae, Phyllotini). Applications de méthodes de morphométrie géométrique, de reconnaissances de patrons et de reconstruction phylogénétique en systématique évolutive."
ROBILLARD Tony - "Phylogénie des grillons Eneopterinae (Orthoptera, Grylloidea, Eneopteridae) et évolution de leurs modalités de communication acoustique."
- LECOMPTE Emilie - "Phylogénie et Phylogéographie des rongeurs des complexes d’espèces Praomys et Mastomys de la division Rattus (Muridae, Rodentia)."
GAUBERT Philippe - " Systématique et phylogénie du genre Genetta et des énigmatiques "Genet-like taxa" Prionodon, Poiana et Osbornictis (Carnivora, Viverridae) : caractérisation de la sous-famille des Viverrinae et étude des patrons de diversification au sein du continent africain."
- CALMET Claire - "Inférences sur l’histoire des populations à partir de leur diversité génétique : étude de séquences démographiques de type fondation-explosion."
DOBIGNY Gauthier - "Etude de la phylogénie et de la biogéographie évolutive du genre Taterillus (Rodentia, Gerbillidae)."
- CIBOIS Alice - "Phylogénie et biogéographie des Timaliidae (Aves, Passeriformes)."
DRIEUX-DUMONT Anne-Marie - "Contribution à la phylogénie des Carnivores par l’étude du CD4, une molécule du système immunitaire."
BED'HOM Bertrand - "Etude des caryotypes atypiques des Accipitridae (Aves, Falconiformes) par cytogénétique classique et moléculaire, et modélisation de leur évolution"
DUCROZ Jean-François - " Contribution des approches cytogénétiques et moléculaires à l’étude systématique et évolutive des genres de Rongeurs Murinae de la "division" Arvicanthis"