Contact
12-16 rue Buffon
CP39
75005 Paris
Responsabilités dans l'unité
- Responsable de la Cellule de valorisation informatique BIRD (Biodiversité, Informatique, Ressources et Développements)
- Assistante de prévention coordinatrice pour l’UMR (réseaux de 8 AP)
- Elue au conseil de l’UMR
- Correspondante valorisation pour la Délégation Paris B
- Correspondante valorisation pour le MNHN
Responsabilités hors unité
- Elue au conseil de l’UFR 918
- Elue à la commission Recherche de l’UFR 918
- Référente Egalité-Parité-Lutte contre les discriminations de l’UFR 918
- Nommée au conseil du département « Origines et Evolution » du MNHN
- Membre du groupe de travail « Eco-responsabilité de la Recherche » du MNHN
- Représentante du MNHN aux groupes « Technique » et « Communication » du consortium international World Flora Online
- Secrétaire du TDWG
- Co-organisatrice du groupe de travail sur les standards géographiques Geographical schemes IG du TDWG
Présentation
En tant que responsable de la Cellule BIRD, mon rôle est d’assister les équipes de recherche de l’unité dans leurs projets de développements informatiques relatif à l’Informatique pour la Biodiversité. Cela comprends plusieurs activités comme une veille active des différentes possibilités de financements, un accompagnement dans la définition et la rédaction de leurs spécifications fonctionnelles, le recrutement et la gestion quotidienne de leur projet.
Ma recherche porte sur l’utilisation des méthodes de la biogéographie comparative à diverses régions du globe avec un intérêt particulier à la région Sud-est asiatique et l’Ouest du Pacifique. Je travaille actuellement au développement d’une ontologie pour les aires biogéographiques afin d’en faciliter leur utilisation et interopérabilité par la standardisation.
Enfin, j’assure un rôle de conseil technique auprès de Françoise Lopez, notre web master.
Bourses et prix
- 2017 AAP « OPUS, soutien à manifestations scientifiques » Sorbonne Universités (1930€), organisation de la réunion d’automne du consortium World Flora online
- 2017 AAP « Séminaires internationaux » Sorbonne Universités (6240€), organisation de la réunion d’automne du consortium World Flora online
- 2014 AAP Sorbonne Universités “La décision: processus et dynamique”, RESCU-ME (Reaching a new Ecological State for Conservation Using Modelling of Evolutionary biogeographic areas)(98760€ pour 2 ans). Utilisation des méthodes de la biogéographie comparative pour le développement d’un outil d’aide à la prise de décision quant à la délimitation des aires de conservation.
- 2011 Prix étudiant (prise en charge des frais d’inscription, du voyage et de l’hébergement) “Southeast Asia biogeography: new insights with a new methodological approach”, Biosystematics meeting, Berlin.
- 2011 Bourse « Women in Science » EDIT Gender Action Plan 1500€
- 2009 AAP “Projets innovants“ FRB 12000€ (2 ans).
Projets
BioRealm est une ontologie pour les aires biogéographiques.
Collaboration: Pier Luigi Buttigieg (Max Planck Institute for Marine Microbiology, Allemagne)
Etude de la biogéographie comparative de l’île de Sulawesi.
Collaboration: Bernard Michaux (Kawakapaka, Nouvelle-Zélande) et Richard Leschen (Manaali Whenua Landscare research, Nouvelle-Zélande)
Etude de la distribution et de la biogéographie comparative des tortues sur le continent nord américain.
Collaboration: Christopher Hoagstrom (Weber State University, Etats-Unis)
Groupe de travail (Interest Group) du TDWG sur les standards géographiques.
Convenors
- Francisco Pando - Real Jardín Botánico-CSIC, Madrid
- Nicolas Bailly - FishBase/SeaLifeBase, Q‑quatics, Philippines; Beaty Biodiversity Museum and Sea Around Us, University of British Columbia, Vancouver
- Visotheary Ung - ISYEB, CNRS, Muséum national d’Histoire Naturelle, Paris
Motivation
Knowledge of species’ geographical distributions is critical to understanding evolutionary processes, changes in ecological communities, and now most importantly the conservation of biodiversity. Ultimately, our knowledge of species distributions comes from assembling records of specimens and observations made by many individuals over many years. Tasks required to compile occurrence data include documenting locations when specimens or observations are collected, extracting and harmonizing data from many sources, georeferencing collecting localities without geocoordinates, applying quality control, and analyzing occurrence data against other geospatial phenomena. Almost all of these tasks can be facilitated if the biological records are connected to a common scheme of hierarchically organized named areas or geospatial entities.
The most commonly used spatial hierarchies are based on administrative entities, such as countries, states, provinces, counties, etc., but typically these entities have only moderate correspondence with natural features that influence species distributions. For these reasons one of the earliest standards created and ratified by TDWG was the World Geographic Scheme for Recording Plant Distributions (WGSRPD, Hollis & Brummit 1992; Brummit 2001), which provided a hierarchical system of terrestrial entities that better reflect biogeographic regions while also specifying their relationships to administrative entities. Despite the increasing prevalence of georeferenced species occurrence data, an area-based scheme to present, retrieve and communicate species spatial distribution and associate information remains relevant and needed. The approach of WGSRPD, combining adminstrative limits and biogeographical concepts in a hierarchical scheme, has been a success, as the hundreds of papers citing this standard prove. And its utility is not diminishing; in just 2020, Google Scholar identifies 43 papers that cite the WGSRPD.
Since publication of the version 2, full or partial representations of the WGSRPD have been offered as an Access database (mdb), ESRI shape files (shp), and GeoJSON. TDWG typically receives several inquiries every year about updating WGSRPD, even offers of assistance, but without an active interest group, the expressions of interest have never been coordinated into an actual update. This interest group will provide that coordination.
Purpose and Scope
The purpose of this interest group is to coordinate the development of one or more geographical schemes, including standard names, abbreviations, and boundaries, that are practically useful for managing occurrence data and species distributions. This interest group will update the WGSRPD, will apply the same approach to marine areas to make the coverage global, and will maintain the standard(s) going forward. In addition to the text, areas will be provided under various digital formats (database, GeoJSON, shapefiles, …).
Etude de la biogéographie comparative de l’Australie.
Collaboration: Daniel Murphy (Royal Botanic Gardens Victoria, Australie), Malte Ebach (University of New South Wales, Australie)
Le projet Wrold Flora Online est un projet international regroupant 42 partenaires qui a pour but de créer une flore mondiale en ligne.
Publications
- 2024 — eDNA-based survey of the marine vertebrate biodiversity off the west coast of Guadeloupe (French West Indies). Biodiversity Data Journal vol. 12, , e125348,ISSN1314-2828, 1314-2836
- septembre 2023 — < span style="font-variant:small-caps;">BIOREALM</span> —An ontology of comparative biogeography: New insights into the semantics of biodiversity conservation. Abstract Aim We aimed to apply ontological techniques to address semantic ambiguities in protected area and conservation… JOURNAL OF BIOGEOGRAPHY vol. 50, n° 9, p. 1576-1586,ISSN0305-0270
- décembre 2022 — Comparative biogeography of North American turtle faunas: Neogene regionalization. Frontiers of Biogeography vol. 14, n° 4, Publisher: International Biogeography Society. tex.hal_id: hal-03934749 tex.hal_version: v1,ISSN1948-6596
- octobre 2022 — « The sociological history of transforming TDWG to the Biodiversity Information Standards (TDWG) » in TDWG annual conference.. , ,,
- août 2022 — « Biotectonics of Sulawesi: principles, methodology and area relationships » in 4th Southeast Asia Gateway.. , ,,
- 2022 — Honing the Visibility of TDWG: Communications expertise required. All organizations need clear and succinct mission and vision statements to communicate the purpose and overall goals of the… Biodiversity Information Science and Standards vol. 6, , ISBN: 2535-0897 Publisher: Sofia : Pensoft Publishers, 2017- Type: 10.3897/biss.6.93644,
- 2022 — The Sociological History of Transforming TDWG to Biodiversity Information Standards (TDWG). Thirty-seven years—why celebrate this prime number anniversary of the founding of the Taxonomic Databases Working Group (TDWG)… vol. 6, , Publication Title: Biodiversity Information Science and Standards Type: 10.3897/biss.6.93866,ISBN2535-0897
- 2021 — Biotectonics of Sulawesi: Principles, methodology, and area relationships. Zootaxa vol. 5068, n° 4, p. 451-484,ISSN1175-5334, 1175-5326
- avril 2020 — LIMES: a tool for comparing species partition. Bioinformatics vol. 36, n° 7, p. 2282-2283 ISBN: 1367-4803 Publisher: Oxford University Press (OUP) Type: 10.1093/bioinformatics/btz911,
- 2020 — World Flora Online: Placing taxonomists at the heart of a definitive and comprehensive global resource on the world’s plants. TAXON vol. 69, n° 6, p. 1311-1341,ISSN0040-0262, 1996-8175