Florent MARTOS

Grâce au précieux soutien de la Fondation Professeur Athanase Saccas, dans le cadre d’une convention de mécénat, nous menons un projet scientifique consacré à la découverte et à l’étude de la diversité des champignons dans les forêts tropicales de Madagascar et de La Réunion.

Ce travail est réalisé en collaboration avec nos partenaires scientifiques à Madagascar, le Parc Botanique et Zoologique de Tsimbazaza et le Missouri Botanical Garden, ainsi qu’à La Réunion avec le laboratoire PVBMT.

Sur le terrain, des équipes franco-malgaches explorent des forêts tropicales particulièrement riches, comme la forêt d’Iaroka à Madagascar, afin de collecter et inventorier des champignons, des orchidées et leurs racines. Ces missions permettent de mieux comprendre un phénomène peu étudié en région tropicale : les mycorhizes, des associations symbiotiques vitales entre les plantes et les champignons.

De retour au laboratoire, nous analysons ces échantillons grâce à des techniques modernes d’identification moléculaire, comme le barcoding et le metabarcoding. Ces méthodes nous permettent de reconnaître les espèces présentes, de décrire de nouvelles espèces encore inconnues, de mieux comprendre leur classification et d’étendre les connaissances sur la répartition géographique des espèces déjà connues.

Nous étudions également les réseaux symbiotiques entre plantes et champignons. Ces analyses nous aident à comprendre comment ces associations se structurent dans la nature et comment elles ont évolué au fil du temps entre les différentes îles du sud-ouest de l’océan Indien.

Nous remercions chaleureusement la Fondation Professeur Athanase Saccas pour son engagement en faveur de la recherche scientifique et de la connaissance de la biodiversité fongique. Son soutien contribue à renforcer l’amitié franco-malgache, ainsi qu’à rendre possibles l’exploration, la conservation et la valorisation d’un patrimoine naturel encore largement méconnu

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Dans le projet ReMiNat—consacré à la restauration des milieux naturels à La Réunion, et porté par le Parc National de La Réunion, le CIRAD et l’Université de La Réunion—notre action vise à comprendre comment l’ouverture du couvert forestier, les propriétés physico-chimiques du sol et les méthodes de contrôle des plantes invasives influencent les communautés de champignons mycorhiziens à arbuscules (AMF). Ces champignons jouent un rôle important dans le fonctionnement des sols et la régénération végétale ; mieux connaître leur réponse aux pratiques de restauration pourrait donc contribuer à une gestion plus durable des forêts indigènes à La Réunion.

Notre étude cherchera à améliorer l’évaluation des actions de restauration en analysant, par métabarcoding, les communautés d’AMF présentes dans les sols de deux sites restaurés. Ces sites disposent déjà de données sur l’ouverture du couvert, les caractéristiques du sol et les communautés végétales indigènes et exotiques, ce qui permettra de comparer la diversité taxonomique et fonctionnelle des champignons avec les caractéristiques du milieu et la survie et la croissance des plantes.

Past2ECO vise à élucider les mécanismes génétiques et évolutifs d’adaptation des cultures au changement climatique en intégrant la diversité historique dans les herbiers et contemporaine du blé et du sorgho. L’enjeu est de relier les diversités génétiques, phénotypiques, environnementales et pratiques agricoles afin de prédire et de mobiliser l’adaptation pour des systèmes agroécologiques durables.

Past2ECO est structuré en quatre axes :

1. Caractériser la diversité historique via l’ADN ancien sur herbiers
2. Identifier les bases génomiques de l’adaptation et prédit les réponses futures via le « genomic offset »
3. Évaluer en plein champ les génotypes en mélange selon un gradient adaptatif et des expérimentations participatives
4. Développer des approches d’IA pour la discrimination des variétés ainsi que pour leur phénotypage numérique.

Notre contribution s’inscrit principalement dans l’axe 1 et consiste à caractériser puis à mettre à disposition du consortium scientifique et du public les ressources d’herbiers de blé et de sorgho dans la collection des plantes vasculaires du Muséum national d’Histoire naturelle.