Lucie BITTNER
Maître de Conférences
Entité de rattachement
Atelier de bio-informatique (ABI)
Recherches
Habilité(e) à diriger des recherches
Contact
Réseaux sociaux
Courriel
lucie.bittner [at] mnhn.fr
Adresse(s)
45 rue Buffon
CP50
75005 Paris
Responsabilités dans l'unité
- Responsable de l’équipe ABI avec Mathilde Carpentier
- Co-animation des séminaires de l’ISYEB
- Co-responsable de l’Axe Approches Omiques pour la biodiversité avec Pierre de Villemereuil
Présentation
Lucie Bittner est enseignante en bioinformatique, évolution moléculaire et microbiologie, et chercheuse en génomique évolutive et environnementale.
En 2009, elle a obtenu un doctorat en Systématique et Evolution, au Muséum National d’Histoire Naturelle à Paris. Après des contrats post-doctoraux en France et en Allemagne, elle a rejoint l’Université Pierre et Marie Curie (désormais Sorbonne Université) en tant que Maître de conférences en 2013.
Elle est coresponsable de l’équipe Atelier de BioInformatique depuis 2019, et est membre junior de l’Institut Universitaire de France depuis 2020.
Elle s’intéresse à la diversité, l’évolution et à l’adaptation des organismes non-modèles et plus particulièrement des micro-organismes dans leur environnement. Elle étudie les communautés planctoniques et leur interactions et impacts dans les écosystèmes en utilisant des méthodes de biologie des systèmes. Membre de l’expédition Tara Océans (2009-2013), elle travaille, entre autre, depuis 2010 sur des données à l’interface entre la biologie moléculaire, la bioinformatique et l’océanographie.
Publications
2025
- , mars 2025 — « Metatranscriptomes-based sequence similarity networks uncover genetic signatures within parasitic freshwater microbial eukaryotes » in AquaEcOmics.. , , tex.hal_id: hal-05006807 tex.hal_version: v1
- , 2025 — Ancient Microbiomes as Mirrored by DNA Extracted From CenturyOld Herbarium Plants and Associated Soil. Molecular Ecology Resources , , e14122ISSN1755-098X, 1755-0998
- , 2025 — Metatranscriptomes-based sequence similarity networks uncover genetic signatures within parasitic freshwater microbial eukaryotes. Microbiome vol. 13, n° 1, p. 43 Publisher: BioMed Central tex.hal_id: hal-04984439 tex.hal_version: v1
2024
- , décembre 2024 — « Identification of DNA viruses in ancient DNA from herbarium samples » in Viral Metagenomics.. vol. 2732, , p. 221-234 Type: 10.1007/978-1-0716-3515-5_15ISBN978-1-07-163514-8
- , août 2024 — The genomic potential of photosynthesis in piconanoplankton is functionally redundant but taxonomically structured at a global scale. Carbon fixation is a key metabolic function shaping marine life, but the underlying taxonomic and functional diversity involved… Science Advances vol. 10, n° 33, eadl0534 Accession Number: 39151014 ISBN: 2375-2548 Publisher: American Association for the Advancement of Science (AAAS) Type: 10.1126/sciadv.adl0534
2023
- , décembre 2023 — Picoeukaryotic photosynthetic potential is functionally redundant but taxonomically structured at global scale. Abstract Primary production, performed by RUBISCO, and often associated with carbon concentration mechanisms, is of major… , , Type: 10.1101/2023.09.22.558943
- , juin 2023 — « Functional trait-based approaches as a common framework for aquatic ecologists: Synthesis and recent results » in ALSO Aquatic Sciences Meeting.. Aquatic ecologists face challenges in identifying the general rules of the functioning of ecosystems. A common framework,… Limnology and Oceanography vol. 66, n° 3, p. 965-994 Type: 10.1002/lno.11655
- , 2023 — Beyond the limits of the unassigned protist microbiome: inferring large-scale spatio-temporal patterns of Syndiniales marine parasites. Abstract Marine protists are major components of the oceanic microbiome that remain largely unrepresented in culture… ISME Communications vol. 3, n° 1, p. 16ISSN2730-6151
2022
- , 2022 — Genomic differentiation of three picophytoplankton species in the Mediterranean Sea. Environmental Microbiology vol. 24, n° 12, p. 6086-6099ISSN1462-2912, 1462-2920
2021
- , 2021 — Towards omics-based predictions of planktonic functional composition from environmental data. Abstract Marine microbes play a crucial role in climate regulation, biogeochemical cycles, and trophic networks. Unprecedented… Nature Communications vol. 12, n° 1, p. 4361ISSN2041-1723