Lucie BITTNER
Professeur(e)
Entité de rattachement
Atelier de bio-informatique (ABI)
Recherches
Habilité(e) à diriger des recherches
Contact
Réseaux sociaux
Courriel
lucie.bittner [at] mnhn.fr
Adresse(s)
45 rue Buffon
CP50
75005 Paris
Responsabilités dans l'unité
- Responsable de l’équipe ABI avec Mathilde Carpentier
- Co-animation des séminaires de l’ISYEB
- Co-responsable de l’Axe Approches Omiques pour la biodiversité avec Pierre de Villemereuil
Présentation
Lucie Bittner est enseignante en bioinformatique, évolution moléculaire et microbiologie, et chercheuse en génomique évolutive et environnementale.
En 2009, elle a obtenu un doctorat en Systématique et Evolution, au Muséum National d’Histoire Naturelle à Paris. Après des contrats post-doctoraux en France et en Allemagne, elle a rejoint l’Université Pierre et Marie Curie (désormais Sorbonne Université) en tant que Maître de conférences en 2013.
Elle est coresponsable de l’équipe Atelier de BioInformatique depuis 2019, et est membre junior de l’Institut Universitaire de France depuis 2020.
Elle s’intéresse à la diversité, l’évolution et à l’adaptation des organismes non-modèles et plus particulièrement des micro-organismes dans leur environnement. Elle étudie les communautés planctoniques et leur interactions et impacts dans les écosystèmes en utilisant des méthodes de biologie des systèmes. Membre de l’expédition Tara Océans (2009-2013), elle travaille, entre autre, depuis 2010 sur des données à l’interface entre la biologie moléculaire, la bioinformatique et l’océanographie.
Publications
2025
- Rimet Frédéric, Lemonnier Clarisse, Alric Benjamin, Beja Pedro, Bittner Lucie, Bylemans Jonas, Leese Florian, et al. 2025. « Omics to Study and Manage Aquatic Environments: A Snapshot From the A qua E c O mics Meeting (EvianlesBains, 2025) ». Molecular Ecology 34 (juillet). Wiley. https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-05273477.
- 1.Monjot Arthur, Bronner Gisèle, Courtine Damien, et al. Trait-based approach coupled to metatranscriptomic-derived sequence similarity network: towards the depiction of the functional diversity of freshwater microbial eukaryotes. In: 16th International Congress of Protistology (ICOP/ISOP — 2025). ; 2025. https://hal.science/hal-05134808.
- Rizos Iris, Romac Sarah, Juery Caroline, Berthelier Charlotte, Decelle Johan, Bernardes Juliana, Corre Erwan, Bittner Lucie, et Not Fabrice. 2025. « Transcriptomic analyses reveal sexual cues in reproductive life stages of uncultivated Acantharia (Radiolaria) ». Protist 177 (avril). Elsevier: 126102. https://hal.science/hal-05127873.
- Orsini Luisa, Maignien Loïs, Meissner Kristian, Thalinger Bettina, Beja Pedro, Logares Ramiro, Bittner Lucie, et al. 2025. AquaEcOmics meeting: exploring aquatic ecology through omics. March 17-20, 2025. Program and abstracts booklet. https://hal.inrae.fr/hal-05250537.
- Monjot Arthur, Rousseau Jérémy, Bittner Lucie, et Lepère Cécile. 2025. « Metatranscriptomes-based sequence similarity networks uncover genetic signatures within parasitic freshwater microbial eukaryotes ». Microbiome 13 (février). BioMed Central: 43. https://hal.science/hal-04984439.
- Grasso Gianluca, Debruyne Régis, Adamo Martino, Rué Olivier, Lejzerowicz Franck, Bittner Lucie, Bianciotto Valeria, et Marmeisse Roland. 2025. « Ancient Microbiomes as Mirrored by DNA Extracted From CenturyOld Herbarium Plants and Associated Soil ». Molecular Ecology Resources, janvier, e14122. doi:10.1111/1755-0998.14122.ISSN1755-098X, 1755-0998
- Laymand Emile, Galand Pierre E., Bouget François-Yves, Bittner Lucie, et Joux Fabien. 2025. « FiveYear Time Series Reveals ShortTerm Blooms of Planktonic Fungi in a Coastal Mediterranean Site ». Environmental Microbiology Reports 17 (janvier): e70154. doi:10.1111/1758-2229.70154.ISSN1758-2229, 1758-2229
- Monjot Arthur, Rousseau Jérémy, Bittner Lucie, et Lepère Cécile. 2025. « Metatranscriptomes-based sequence similarity networks uncover genetic signatures within parasitic freshwater microbial eukaryotes ». Microbiome 13 (janvier). BioMed Central: 43. doi:10.1186/s40168-024-02027-0.
- Rihm Gaspard, Benedetti Fabio, et Bittner Lucie. 2025. « Do trophic strategies shape biogeography and environmental niches? Marine dinoflagellates as a case study ». ISME Communications 5 (janvier): ycaf153. doi:10.1093/ismeco/ycaf153.ISSN2730-6151
- Rimet Frédéric, Lemonnier Clarisse, Alric Benjamin, Beja Pedro, Bittner Lucie, Bylemans Jonas, Leese Florian, et al. 2025. « Omics to Study and Manage Aquatic Environments: A Snapshot From the A qua E c O mics Meeting (EvianlesBains, 2025) ». Molecular Ecology 34 (janvier). Wiley: e70041. doi:10.1111/mec.70041.ISSN0962-1083, 1365-294X