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Présentation

Lucie Bittner est enseignante en bioinformatique, évolution moléculaire et microbiologie, et chercheuse en génomique évolutive et environnementale.

En 2009, elle a obtenu un doctorat en Systématique et Evolution, au Muséum National d'Histoire Naturelle à Paris.  Après des contrats post-doctoraux en France et en Allemagne, elle a rejoint l'Université Pierre et Marie Curie (désormais Sorbonne Université) en tant que Maître de conférences en 2013.

Elle est coresponsable de l’équipe Atelier de BioInformatique depuis 2019, et est membre junior de l’Institut Universitaire de France depuis 2020.

Elle s’intéresse à la diversité, l’évolution et à l'adaptation des organismes non-modèles et plus particulièrement des micro-organismes dans leur environnement. Elle étudie les communautés planctoniques et leur interactions et impacts dans les écosystèmes en utilisant des méthodes de biologie des systèmes. Membre de l’expédition Tara Océans (2009-2013), elle travaille, entre autre, depuis 2010 sur des données à l’interface entre la biologie moléculaire, la bioinformatique et l'océanographie.

Publications

2024
  • Grasso Gianluca, Rotunno Silvia, Debruyne Régis, Bittner Lucie, Miozzi Laura, Marmeisse Roland & Bianciotto Valeria, décembre 2024« Identification of DNA viruses in ancient DNA from herbarium samples » in Viral metagenomics.. vol. 2732, , p. 221-234 tex.hal_id: hal-04455136 tex.hal_version: v1
2023
  • Martini Séverine, Larras Floriane, Boyé Aurélien, Faure Emile, Aberle Nicole, Archambault Philippe, Bacouillard Lise, Beisner Beatrix E, Bittner Lucie, Castella Emmanuel, Danger Michael, Gauthier Olivier, Karp-Boss Lee, Lombard Fabien, Maps Frédéric et al., 2023« Functional trait-based approaches as a common framework for aquatic ecologists: Synthesis and recent results » in ALSO aquatic sciences meeting.. Limnology and Oceanography vol. 66, n° 3, p. 965-994 Issue: 3 tex.hal_id: hal-04117032 tex.hal_version: v1
  • Rizos Iris, Debeljak Pavla, Finet Thomas, Klein Dylan, Ayata Sakina-Dorothée, Not Fabrice & Bittner Lucie, 2023Beyond the limits of the unassigned protist microbiome: inferring large-scale spatio-temporal patterns of Syndiniales marine parasites. Abstract Marine protists are major components of the oceanic microbiome that remain largely unrepresented in culture… ISME Communications vol. 3, n° 1, p. 16
    ISSN
    2730-6151
2022
  • Da Silva Ophélie, Ayata Sakina-Dorothée, Ser-Giacomi Enrico, Leconte Jade, Pelletier Eric, Fauvelot Cécile, Madoui Mohammed-Amin, Guidi Lionel, Lombard Fabien & Bittner Lucie, 2022Genomic differentiation of three picophytoplankton species in the Mediterranean Sea. Environmental Microbiology vol. 24, n° 12, p. 6086-6099
    ISSN
    1462-2912, 1462-2920
2021
  • Faure Emile, Ayata Sakina-Dorothée & Bittner Lucie, 2021Towards omics-based predictions of planktonic functional composition from environmental data. Abstract Marine microbes play a crucial role in climate regulation, biogeochemical cycles, and trophic networks. Unprecedented… Nature Communications vol. 12, n° 1, p. 4361
    ISSN
    2041-1723
2020
  • Marchet Camille, Lecompte Lolita, Limasset Antoine, Bittner Lucie & Peterlongo Pierre, mars 2020A resource-frugal probabilistic dictionary and applications in bioinformatics. Discrete Applied Mathematics vol. 274, , p. 92-102
    ISSN
    0166218X
2019
  • Faure Emile, Not Fabrice, Benoiston Anne-Sophie, Labadie Karine, Bittner Lucie & Ayata Sakina-Dorothée, 2019Mixotrophic protists display contrasted biogeographies in the global ocean. The ISME Journal vol. 13, n° 4, p. 1072-1083
    ISSN
    1751-7370
  • Caputi Luigi, Carradec Quentin, Eveillard Damien, Kirilovsky Amos, Pelletier Eric, Pierella Karlusich Juan J., Rocha Jimenez Vieira Fabio, Villar Emilie, Chaffron Samuel, Malviya Shruti, Scalco Eleonora, Acinas Silvia G., Alberti Adriana, Aury Jean‐Marc, Benoiston Anne‐Sophie et al., 2019CommunityLevel Responses to Iron Availability in Open Ocean Plankton Ecosystems. Global Biogeochemical Cycles vol. 33, n° 3, p. 391-419
    ISSN
    0886-6236, 1944-9224
2009
  • Bittner Lucie, Flecher C., de Reviers Bruno, Le Gall Line & Payri Claude, 2009Genetic diversity and species boundaries of corallinales (Rhodophyta) in south Pacific Ocean. Phycologia vol. 48, suppl.4, p. 8