Marc-André SELOSSE

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Pages personnelles, bibliographie et productions scientifique

• Research articles
• Popular articles
• Books and chapters
• Recently supervised theses
• Online productions (videos, texts, interviews)

Research activities

My main research activities focus on soil microbiota and mycorrhizal symbioses, which link most plant roots to soil fungi. I use methods from molecular biology (NGS, transcriptomic) to investigate microbial populations and mycorrhizal communities, which are largely comprised of non-cultivable species. Moreover, isotopic methods (natural abundance of stable isotopes, 13C and 15N) provide efficient tools for investigating plant and fungal exchanges in situ.

I try to keep a strong naturalist eye and expertise in mycology and botany. Using mycorrhizal associations as model systems, my co-workers and I address questions about the ecology and evolution of symbiosis.

Four main research themes can be distinguished :

• Population genetics of ectomycorrhizal fungi (1994 – present), from local (forest stand) to global (trans-continental) scale, especially in the genus Laccaria, and more recently on Amanita and Tuber  species.
• Ectomycorrhizal communities in Mediterranean forests (1998 – present), with a focus on their response to human and climatic disturbances, not only in terms of taxonomy, but also at functional level (secreted enzymatic activities).
• Mycoheterotrophy (2000 - present), i.e. biology and physiology of plants that use their mycorrhizal fungi as a carbon source, either exclusively (full mycoheterotrophy), or in addition to photosynthesis (green ‘mixotrophic’ plants). Identity of associated fungi and plant ecophysiology are under focus in temperate and tropical regions.
• Orchid mycorrhizae (2000 - present), fungal partners (diversity, coevolution), anatomy of the interaction (TEM), and plant metabolism (Cf. previous item ), in temperate and tropical regions.
• Networks of biological interactions (2000 - present), locally (mycorrhizal networks) or at evolutionary levels.

I

I am more generally interested in symbiosis and its evolution in general, with a particular penchant for some models, such as the hyper-diverse Sebacinales, the orchid tribe Neottieae and its fascinating albino individuals and truffles (Tuber melanosporum).

This is a team story: as you will see from authors’ names in my publication list, this research would not have been possible without numerous collaborators!

I m an editor of the New Phytologist and an associate editor of Symbiosis, Botany Letters and Ecology Letters as well as Espèces I’m corresponding member of the Académie d’Agriculture de France and of the Institut Universitaire de France.

I am president of Fédération BioGée. I also work in the boards of the French botanical Society,  France-Orchidée, the French,  Agroforestery Association   and Tela botanica.

I teach actively at Muséum and in various universities and ‘grandes écoles’ (AgroParisTech, Ecole Normale supérieure at Paris (rue d’Ulm), Saclay and Lyon, Science-Po Lille, Ecole des Hautes Études en Santé Publique ) and at University of  Gdansk (Poland). My topics cover plants, algae and fungi (from biology to ecology), biology of interaction, as well as evolution and general ecology, and I teach as often as possible in the field.

I devote attention to future biology teachers, and invest in outreach by way of talks, field trips, papers, and books: eg. edited by Vuibert on symbiosis (2000), and by Actes Sud on microbiota in plants, animals and civilization (2017, translated into Polish, Dutch, Estonian, and Chinese), on tannins (2019, translated into Italian), on soil (2021) and on various biological topics for a large audience (Petites histoires naturelles, 2021).

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• CV - Qui suis-je ? Format (Pdf) - 276.99 KB

• Ré-écoutez mes chroniques dans la Terre au Carré  sur France Inter

Pages personnelles, bibliographie et productions scientifiques

• Articles de recherche
• Articles de Vulgarisation
• Ouvrages et chapitres d’ouvrages
• Thèses encadrées récemment
• Productions en ligne (vidéos, tribunes, interviews)

Activités de recherche

Ma recherche est centrée sur la microbiologie du sol et l’interaction mycorhizienne, une symbiose entre les racines de plus de 90% des plantes et des champignons du sol. J’utilise des méthodes issues de la biologie moléculaire (code-barre moléculaire, transcriptomique) pour étudier les populations microbiennes et les communautés mycorhiziennes, qui sont largement dominées par des espèces non cultivables. De plus, les méthodes isotopiques (abondance naturelle des isotopes stables 13C et 15N) fournissent de précieux marqueurs pour étudier la nutrition des organismes, et plus particulièrement les échanges entre les plantes et les champignons in situ

Mes travaux comprennent une activité et une expertise naturaliste (botanique, mycologie). En étudiant l’interaction mycorhizienne, mes collaborateurs et moi-même traitons des questions générales sur l’écologie et l’évolution des symbioses, en particulier celles qui créent des réseaux entre individus et espèces différentes.

Quatre thèmes majeurs peuvent être distingués :

• La génétique des populations des champignons mycorhiziens (1994 – actuel), de l’échelle locale (forêt) à l’échelle globale (inter-continentale) ; surtout sur le genre Laccaria, et plus récemment des espèces des genres Amanita et Tuber.
• Les communautés ectomycorhiziennes des forêts méditerranéennes et tempérées (1998 – actuel), avec un intérêt particulier pour leurs réponses aux perturbations climatiques et anthropiques, non seulement en termes taxonomiques, mais aussi plus fonctionnellement, en mesurant les activités enzymatiques excrétées.
• Mycohétérotrophie (2000 – actuel), c’est à dire la biologie des plantes qui utilisent leurs champignons mycorhiziens comme source de carbone, ou bien exclusivement (mycohétérotrophie complète) ou bien en complément de leur photosynthèse (espèces vertes dites ‘mixotrophes’). L’identité des champignons associés et l’écophysiologie de ces plantes sont étudiées dans les régions tempérées et tropicales, et interprétés dans une perspective évolutive.
• Mycorhizes des orchidées (2000 – actuel), en particulier nature des partenaires fongiques (diversité, coévolution), anatomie de l’interaction et métabolisme des plantes (Cf. point précédent), dans les régions tropicales et tempérées.
• Les réseaux d’interactions (2000 – actuel) entre plantes et champignons, à l’échelle de la parcelle (dont les réseaux mycorhiziens) et au niveau évolutif.

Je suis plus globalement intéressé par les symbioses et leur évolution en général, avec un penchant pour certains modèles, comme l’hyper-diversité des Sébacinales, les Neottieae, une tribu d’orchidées aux individus albinos fascinants, et la Truffe noire, Tuber melanosporum.

Mais l’aventure est collective – vous verrez dans les auteurs de mes articles les nombreux collaborateurs sans qui je ne pourrais travailler !

Je suis éditeur du New Phytologist et éditeur associé de Symbiosis et Botany Letters et Ecology Letters mais aussi à la revue Espèces. Je suis membre correspondant de l’ Académie d’Agriculture de France

et de l’Institut Universitaire de France.

Je suis président de la Fédération Biogée. Je participe aux bureaux de Société botanique de France, de France-Orchidée , de l’Association Française d’Agroforesterie et de Tela Botanica.

Je participe aux comités scientifiques de la Société Française d’Orchidophilie et de Tela Botanica.

J’enseigne activement au Muséum et dans diverses universités et grandes écoles dont AgroParisTech, Ecoles Normales supérieures de la rue d’Ulm (Paris), Saclay et de Lyon, Science-Po Lille, l’Ecole des Hautes Études en Santé Publique et à l’Université de Gdansk (Pologne). Mes cours portent sur les plantes, les algues et les champignons (de la biologie à l’écologie), la biologie des interactions et sur l’évolution et l’écologie en général – sur le terrain aussi souvent que possible. J’enseigne en particulier aux futurs enseignants en biologie-géologie notamment à la préparation à l’Agrégation SV-STU ENS/ParisXI/MNHN. Enfin, je m’investis beaucoup en vulgarisation, par des conférences, des excursions de terrain, des articles (voir infra), et des livres (ci-dessous).

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@MNHN - Web série pour que nature vive (2020)

• Les microbes sont aussi nos meilleurs alliés

Lauréat du prix scientifique Homme Nature Françoise Sommer (2021)

•   Rapport de candidature Prix François Sommer 2021 (pdf)

   

@MNHN - Web série sur la nature des plantes en 5 épisodes (2021)

• Des feuilles parapluie (Ces plantes tropicales aux feuilles atypiques)
• Les secrets des épines (Les plantes savent se défendre)
• Des plantes parasites ( Le plantes épiphytes : d’étonnantes stratégies de survie)
• Des feuilles rouges ( Ces plantes qui survivent dans l’ombre de la canopée)
• Manger sur un arbre (Orchidées et fougères : leur drôle d’alimentation)

LIVRES - Dernières parutions

• Aux éditions Actes sud - “Nature et préjugés - Convier l’humanité dans l’histoire naturelle” -  Préface d’ Eric Orsenna. (2024).
• Aux éditions Actes Sud - L’origine du monde. Illustrations Arnaud Rafaélian. (2021). 
• Aux éditions Actes Sud - Petites histoires naturelles. Préface Mathieu Vidard (2021).
• Aux éditions Darguaud “SOUS TERRE” - Dessins Mathieu Burniat(2021).

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