Lucie BITTNER
Professeur(e)
Affiliation entity
Atelier de bio-informatique (ABI)
Researches
Accreditation to supervise research
Contact
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E-mail
lucie.bittner [at] mnhn.fr
Address(es)
45 rue Buffon
CP50
75005 Paris
Responsibilities inside unit
- Responsable de l’équipe ABI avec Mathilde Carpentier
- Co-animation des séminaires de l’ISYEB
- Co-responsable de l’Axe Approches Omiques pour la biodiversité avec Pierre de Villemereuil
Presentation
Lucie Bittner est enseignante en bioinformatique, évolution moléculaire et microbiologie, et chercheuse en génomique évolutive et environnementale.
En 2009, elle a obtenu un doctorat en Systématique et Evolution, au Muséum National d’Histoire Naturelle à Paris. Après des contrats post-doctoraux en France et en Allemagne, elle a rejoint l’Université Pierre et Marie Curie (désormais Sorbonne Université) en tant que Maître de conférences en 2013.
Elle est coresponsable de l’équipe Atelier de BioInformatique depuis 2019, et est membre junior de l’Institut Universitaire de France depuis 2020.
Elle s’intéresse à la diversité, l’évolution et à l’adaptation des organismes non-modèles et plus particulièrement des micro-organismes dans leur environnement. Elle étudie les communautés planctoniques et leur interactions et impacts dans les écosystèmes en utilisant des méthodes de biologie des systèmes. Membre de l’expédition Tara Océans (2009-2013), elle travaille, entre autre, depuis 2010 sur des données à l’interface entre la biologie moléculaire, la bioinformatique et l’océanographie.
Publications
2025
- , July 2025 — Omics to Study and Manage Aquatic Environments: A Snapshot From the A qua E c O mics Meeting (EvianlesBains, 2025). The AquaEcOmics meeting brought together 280 scientists applying omics tools to aquatic research in March 2025 (Evian‐les‐Bains… Molecular Ecology vol. 34, n° 17, Accession Number: 40698877 ISBN: 0962-1083 Type: 10.1111/mec.70041
- , June 2025 — « Trait-based approach coupled to metatranscriptomic-derived sequence similarity network: towards the depiction of the functional diversity of freshwater microbial eukaryotes » in 16th International Congress of Protistology (ICOP/ISOP — 2025).. Microbial eukaryotes play a crucial role in biochemical cycles and aquatic trophic food webs. The recent advances in sequencing… , , tex.hal_id: hal-05134808 tex.hal_version: v1
- , April 2025 — Transcriptomic analyses reveal sexual cues in reproductive life stages of uncultivated Acantharia (Radiolaria). The ability to reproduce is a key process for the perpetuation of organisms. Along the evolution of protist reproductive… Protist vol. 177, , p. 126102 Accession Number: 40347573 ISBN: 1434-4610 Type: 10.1016/j.protis.2025.126102
- , March 2025 — AquaEcOmics meeting: exploring aquatic ecology through omics. March 17-20, 2025. Program and abstracts booklet. A meeting to explore aquatic ecosystems biodiversity, functionning and monitoring with eDNA and multi-Omics methods , , Pages: 135 p. Publication Title: AquaEcomics 2025 Type: 10.57745/VBSHUO
- , February 2025 — « Metatranscriptomes-based sequence similarity networks uncover genetic signatures within parasitic freshwater microbial eukaryotes » in AquaEcOmics.. Microbial eukaryotes play a crucial role in biochemical cycles and aquatic trophic food webs. Their taxonomic and functional… Microbiome vol. 13, n° 1, p. 43 Type: 10.1186/s40168-024-02027-0
- , 2025 — Ancient Microbiomes as Mirrored by DNA Extracted From CenturyOld Herbarium Plants and Associated Soil. Molecular Ecology Resources , , e14122ISSN1755-098X, 1755-0998
- , 2025 — FiveYear Time Series Reveals ShortTerm Blooms of Planktonic Fungi in a Coastal Mediterranean Site. Environmental Microbiology Reports vol. 17, n° 4, e70154ISSN1758-2229, 1758-2229
- , 2025 — Metatranscriptomes-based sequence similarity networks uncover genetic signatures within parasitic freshwater microbial eukaryotes. Microbiome vol. 13, n° 1, p. 43 tex.hal_id: hal-04984439 tex.hal_version: v1
- , 2025 — Do trophic strategies shape biogeography and environmental niches? Marine dinoflagellates as a case study. Abstract Marine unicellular eukaryotes (protists) exhibit a wide spectrum of trophic strategies ranging from specialists … ISME Communications vol. 5, n° 1, ycaf153ISSN2730-6151
- , 2025 — Omics to Study and Manage Aquatic Environments: A Snapshot From the <span style="font-variant:small-caps;">A</span> qua <span style="font-variant:small-caps;">E</span> c <span style="font-variant:small-caps;">O</span> mics Meeting (EvianlesBains, 2025). The AquaEcOmics meeting brought together 280 scientists applying omics tools to aquatic research in March 2025 (Evian‐les‐Bains… Molecular Ecology vol. 34, n° 17, e70041 Accession Number: 40698877 ISBN: 0962-1083 Type: 10.1111/mec.70041ISSN0962-1083, 1365-294X