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Institutional affiliations MNHN-CNRS-SU-EPHE-UA
MCAM is a laboratory under the dual supervision of the CNRS (INEE) and the National Museum of Natural History.
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Bonnefous H., Teulière J., Lapointe F.J., Lopez P. & Bapteste E., 2024 — Most genetic roots of fungal and animal aging are hundreds of millions of years old according to phylostratigraphy analyses of aging networks.. GeroScience , ,
https://dx.doi.org/https://rdcu.be/dKFlV
Bernard Charles, Li Yanyan, Lopez Philippe & Bapteste Eric, April 2023 — Large-Scale Identification of Known and Novel RRNPP Quorum-Sensing Systems by RRNPP_Detector Captures Novel Features of Bacterial, Plasmidic, and Viral Coevolution. Abstract Gram-positive Firmicutes bacteria and their mobile genetic elements (plasmids and bacteriophages) encode peptide-based… Molecular Biology and Evolution vol. 40, n° 4, ISBN: 0737-4038 Publisher: Oxford University Press (OUP) Type: 10.1093/molbev/msad062
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Lannes Romain, Bapteste Éric & Lopez Philippe, November 2019 — Search for unknown environmental sequences of medical/biological interest using large sequence similarity networks, Recherche de séquences environnementales inconnues d’intérêt médical/biologique par l’utilisation de grands réseaux de similarité de séquen. The objective of this thesis was to identify as yet unknown microorganisms present in various environments and to characterize… , ,
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-02954131
Zielezinski Andrzej, Girgis Hani Z., Bernard Guillaume, Leimeister Chris-Andre, Tang Kujin, Dencker Thomas, Lau Anna Katharina, Röhling Sophie, Choi Jae Jin, Waterman Michael S., Comin Matteo, Kim Sung-Hou, Vinga Susana, Almeida Jonas S., Chan Cheong Xin et al., 2019 — Benchmarking of alignment-free sequence comparison methods. Genome Biology vol. 20, n° 1, p. 144
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https://dx.doi.org/10.1186/s13059-019-1755-7
Lemieux-Labonté Virginie, Vigliotti Chloé, Tadic Zoran, Wehrle Beck, Lopez Philippe, Bapteste Eric, Lapointe François-Joseph, German Donovan P. & Herrel Anthony, 2022 — Proximate Drivers of Population-Level Lizard Gut Microbial Diversity: Impacts of Diet, Insularity, and Local Environment. Microorganisms vol. 10, n° 8, p. 1550
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Lord Etienne, Pathmanathan Jananan S, Corel Eduardo, Makarenkov Vladimir, Lopez Philippe, Bouchard Frédéric, Bhattacharya Debashish, Antoine Pierre-Olivier, Guyader Hervé Le, Lapointe François-Joseph & Bapteste Eric, 2019 — Introducing trait networks to elucidate the fluidity of organismal evolution using palaeontological data. Genome Biology and Evolution vol. 11, n° 9, p. 2653-2665
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https://dx.doi.org/10.1093/gbe/evz182
Watson Andrew K., Lannes Romain, Pathmanathan Jananan S., Méheust Raphaël, Karkar Slim, Colson Philippe, Corel Eduardo, Lopez Philippe & Bapteste Eric, 2019 — « The Methodology Behind Network Thinking: Graphs to Analyze Microbial Complexity and Evolution » in Evolutionary Genomics.. vol. 1910, , dir. Springer New York p. 271-308
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https://dx.doi.org/10.1007/978-1-4939-9074-0_9
Watson A.K., Habib M. & Bapteste E., 2019 — Phylosystemics: Merging Phylogenomics, Systems Biology, and Ecology to Study Evolution. Trends in Microbiology vol. 28, n° 3, p. 176-190
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Papale Francois, Saget Jordane & Bapteste Eric, April 2019 — Networks Consolidate the Core Concepts of Evolution by Natural Selection. Trends in Microbiology vol. 28, n° 4, p. 254-265 tex.eissn: 1878-4380 tex.unique-id: ISI:000519578400005
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Teulière Jérôme, Bernard Guillaume & Bapteste Eric, 2020 — The Distribution of Genes Associated With Regulated Cell Death Is Decoupled From the Mitochondrial Phenotypes Within Unicellular Eukaryotic Hosts. Frontiers in Cell and Developmental Biology vol. 8, , p. 536389 tex.article-number: 536389 tex.unique-id: ISI:000575619800001
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Bernard Charles, Lannes Romain, Li Yanyan, Bapteste Eric & Lopez Philippe, 2020 — Rich repertoire of quorum sensing protein coding sequences in CPR and DPANN associated with interspecies and interkingdom communication. msystems vol. 5, n° 5, e00414–20 tex.article-number: e00414-20 tex.orcid-numbers: Lannes, Romain/0000-0002-6672-1762 tex.unique-id: ISI:000579368300039
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Teulière Jérôme, Bernard Charles & Bapteste Eric, September 2021 — Interspecific interactions that affect ageing: Age-distorters manipulate host ageing to their own evolutionary benefits. Ageing Research Reviews vol. 70, , p. 101375
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Evangelista Dominic, Thouze France, Kohli Manpreet Kaur, Lopez Philippe & Legendre Frederic, 2018 — Topological support and data quality can only be assessed through multiple tests in reviewing Blattodea phylogeny. Molecular Phylogenetics and Evolution vol. 128, , p. 112-122
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Bapteste Eric, Gérard Philippe, Larose Catherine, Blouin Manuel, Not Fabrice, Campos Liliane, Aïdan Géraldine, Selosse M. André, Adénis M. Sarah, Bouchard Frédéric, Dutreuil Sébastien, Corel Eduardo, Vigliotti Chloé, Huneman Philippe, Lapointe F. Joseph et al., 2021 — The Epistemic Revolution Induced by Microbiome Studies: An Interdisciplinary View. Biology vol. 10, n° 7, p. 651
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Bapteste Eric & Papale François, 2020 — Modeling the evolution of interconnected processes: It is the song and the singers. BioEssays , , p. 2000077 ISBN: 0265-9247 Publisher: Wiley-VCH Verlag Type: 10.1002/bies.202000077
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Lannes Romain, Cavaud Louise, Lopez Philippe & Bapteste Eric, 2020 — Marine Ultrasmall Prokaryotes Likely Affect the Cycling of Carbon, Methane, Nitrogen, and Sulfur. Genome Biology and Evolution vol. 13, n° 1, evaa261
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1759-6653
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Bernard Charles, Li Yanyan, Lopez Philippe & Bapteste Eric, 2021 — Beyond arbitrium: identification of a second communication system in Bacillus phage phi3T that may regulate host defense mechanisms. Isme Journal vol. 15, n° 2, p. 545-549
ISSN
1751-7362
https://dx.doi.org/10.1038/s41396-020-00795-9
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By authors

  • Eric BAPTESTE
  • Hugo BONNEFOUS
  • Eduardo COREL
  • Line LE GALL
  • Frédéric LEGENDRE
  • Philippe LOPEZ
  • Duncan SUSSFELD

Year

  • 2024
  • 2023
  • 2022
  • 2021
  • 2020
  • 2019
  • 2018

Affiliation entity

  • (-) Adaptation, Intégration, Réticulation, Evolution (AIRE)
  • Evolution fonctionnelle et Taxonomie (EvoFoncT)
  • Exploration, Espèces et Evolution (3E)

Affiliation organism

  • -
  • CNRS
  • MNHN
  • Sorbonne Université

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