Régine VIGNES-LEBBE

• Enseignement et encadrement

J’enseigne actuellement principalement en master, mais aussi en licence : orientation et insertion professionnelle / statistiques / bureautique / modélisation / bases de données / Programmation web / méthodes d’identification taxonomiques / Bases de la taxonomie et phylogénie

Encadrement de nombreux stages de master 1 et master 2 (1 à 3 par an).

• Encadrement doctoraux :

• TROUDET Julien (dir F. Legendre et R. Vignes Lebbe). « Gradients de diversité terrestre : Le message de la systématique à travers les bases de données de biodiversité ». Bourse ED 227. Sept 2014-2017
• DELAUNAY Mathilde (dir R. Nattier et R. Vignes Lebbe). « Approche innovante sur les insectes aquatiques du Bassin parisien; co-construction d’une base de connaissances et d’une clé d’identification numérique ». Bourse PICRI de la Région Ile-de-France.(Mai 2015-…)
• GRAND Anaïs (co-dir. : R. Vignes Lebbe et R. Zaragüeta). Bourse ED MNHN. Approche modèle théorétique pour caractériser les objets et concepts pour la description de la biodiversité actuelle et fossile. Soutenue en novembre 2013.
• KERNER Adeline (dir. : R Vignes Lebbe et P. Janvier). ED MNHN, bourse CNRS. Utilisation d’un système de gestion de bases de connaissances et d’ontologies pour la révision et l’analyse des archéocyathes. Soutenue en octobre 2013.
• RIVIERE-UNG Visothéary (dir R. Zaragueta, R. Vignes Lebbe et D. Williams). Approche
• intégrative de la dimension temporelle en biogéographie historique couplée à une étude empirique sur le sud-est asiatique. Soutenue en décembre 2013.
• ROUSSE Guillaume – (Co-dir. R. Vignes-Lebbe UPMC; N. Conruyt, Univ. de la Réunion). Bases de données objet et ontologie de la systématique. Soutenue le : 10/11/2003.
• BOSSY Robert – . Dir. R. Vignes-Lebbe. Edition coopérative de bases de données scientifiques. Soutenue le 25/04/2002.
• Participation à l’encadrement de thèse de Laurent GUEGUEN . Partitionnement maximalement prédictif sous contrainte d’ordre total. Applications aux séquences génétiques..

• Projets et soutiens

  Au niveau local (MNHN - SU)

• 2018 - SU-ITE Institut de la transition environnementale. Projet Xper-ease «Combiner l’humain et l’automatique dans la reconnaissance des espèces » (1500euros)
• 2017 ATM : Clé d’identification morphologique et écologique des larves d’Odonates d’Ile-de-France (soutenu. 5000 euros)
• 2016 et 2014 ATM Formes :collaboration avec P. Bearez (USM 303/UMR 7209), P. Pruvost (UMR 5178), N. Bailly (Fishbase) et équipe G. Lecointre (UMR 7138). Encadrement master. Production base de données et site web (http://www.mnhn.fr/osteo/osteobase),
• 2014 SU - Obtention d’une ANR Convergence (Sorbonne Universités) « Transmission Sémantique des connaissances de la Systématique vers l’Ecologie » (avril 2014- septembre 2015), budget obtenu 98000 euros

         Au niveau national

• Collaboration au programme PIA e-Recolnat sur les collections

• Participation à des programmes européens :

• ViBRANT Virtual Biodiversity Research and Access Network for Taxonomy (FP7– 2010-2013, Contribution au WP4 et WP5 sur les ontologies et webservices d’identification).
• EDIT European Distributed Institute of Taxonomy (2007-2010, Responsable du WP5.6 « Descriptive tools »),
• BioCASE Biological Collection Access Service (2000-2004, Responsable de 2 WP) voir www.biocase.org
• BioCise Biological Collection Information Service in Europe (1998-1999),
• MLT Machine Learning Toolbox (Contrat ESPRIT II 1989-1993),
• Species 2000 (2001-2005)

• Au niveau international (non européen) :

• Contrat avec la PAHO et Institut Pasteur (identification assistée par ordinateur des phlébotomes de Guyane Française, 1985-1987). Puis contrat USAID 1990-1996.