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MCAM is a laboratory under the dual supervision of the CNRS (INEE) and the National Museum of Natural History.
EPHE-PSL
L’Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité
Institutional affiliations MNHN-CNRS-SU-EPHE-UA
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Blassel Luc, Zhukova Anna, Villabona-Arenas Christian J, Atkins Katherine E, Hué Stéphane & Gascuel Olivier, 2021 — Drug resistance mutations in HIV: new bioinformatics approaches and challenges. Current Opinion in Virology vol. 51, , p. 56-64
ISSN
18796257
https://dx.doi.org/10.1016/j.coviro.2021.09.009
Blassel L., Tostevin A., Villabona-Arenas C.J., Peeters M., Hué S. & Gascuel O., 2021 — Using machine learning and big data to explore the drug resistance landscape in HIV. Plos Computational Biology vol. 17, n° 8, p. 1008873
https://dx.doi.org/https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1008873
Lemoine Frederic & Gascuel Olivier, September 2021 — Gotree/Goalign: toolkit and Go API to facilitate the development of phylogenetic workflows.. NAR genomics and bioinformatics vol. 3, n° 3, lqab075–lqab075 MEDLINE:34396097
https://dx.doi.org/10.1093/nargab/lqab075
Blassel L., Tostevin A., Villabona-Arenas C.J., Peeters M., Hué S. & Gascuel O., August 2021 — Using machine learning and big data to explore the drug resistance landscape in HIV.. Plos Computational Biology vol. 17, n° 8, p. 1008873 MEDLINE:34437532
https://dx.doi.org/10.1371/journal.pcbi.1008873
Zhukova Anna, Voznica Jakub, Davila Felipe Miraine, To Thu-Hien, Perez Lissette, Martinez Yenisleidys, Pintos Yanet, Mendez Melissa, Gascuel Olivier & Kouri Vivian, August 2021 — Cuban history of CRF19 recombinant subtype of HIV-1. Plos Pathogens vol. 17, n° 8, e1009786 WOS:000685263600004
ISSN
1553-7366
https://dx.doi.org/10.1371/journal.ppat.1009786
Lemoine Frédéric, Blassel Luc, Voznica Jakub & Gascuel Olivier, 2021 — COVID -Align: accurate online alignment of hCoV-19 genomes using a profile HMM. Bioinformatics (Oxford, England) vol. 37, n° 12, p. 1761-1762 MEDLINE:33045068
ISSN
1367-4803, 1460-2059
https://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/btaa871
Zhukova Anna, Blassel Luc, Lemoine Frederic, Morel Marie, Voznica Jakub & Gascuel Olivier, 2021 — Origin, evolution and global spread of SARS-CoV-2. Comptes Rendus Biologies vol. 344, n° 1, p. 57-75 WOS:000667242200006
ISSN
1631-0691
https://dx.doi.org/10.5802/crbiol.29
Morel Marie, Lemoine Frédéric & Gascuel Olivier, November 2021 — Sensitive Detection of Site-wise Convergent Evolution in Large Protein Alignments with ConDor. Evolutionary convergences are observed at all levels, from phenotype to DNA and protein sequences, and the changes observed at… , , Type: 10.1101/2021.06.30.450558
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03428682
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Category

By authors

  • (-) Olivier GASCUEL

Year

  • (-) 2021

Affiliation entity

  • (-) Phylogénomique, phylodynamique et interactions hôtes-pathogènes (PhyloPath)

Affiliation organism

  • CNRS

Status

A research group
EPHE-PSL
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