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MCAM is a laboratory under the dual supervision of the CNRS (INEE) and the National Museum of Natural History.
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Hassanin Alexandre, Rambaud Opale & Klein Dylan, 2022 — Genomic Bootstrap Barcodes and Their Application to Study the Evolution of Sarbecoviruses. Viruses vol. 14, n° 2, p. 440
ISSN
1999-4915
https://dx.doi.org/10.3390/v14020440
Catanzaro Daniele, Frohn Martin, Gascuel Olivier & Pesenti Raffaele, July 2022 — A tutorial on the balanced minimum evolution problem. EUROPEAN JOURNAL OF OPERATIONAL RESEARCH vol. 300, n° 1, p. 1-19 tex.earlyaccessdate: FEB 2022 tex.eissn: 1872-6860 tex.orcid-numbers: Catanzaro, Daniele/0000-0001-9427-1562 Pesenti, Raffaele/0000-0001-5890-4238 GASCUEL, Olivier/0000-0002-9412-9723 Frohn, Martin/0000-0002-5002-4049 tex.researcherid-numbers: Frohn, Mart
ISSN
0377-2217
https://dx.doi.org/10.1016/j.ejor.2021.08.004
Amrane Samir, Jaubert Chloé, Bedrat Amina, Rundstadler Tiffany, Recordon-Pinson Patricia, Aknin Cindy, Guédin Aurore, De Rache Aurore, Bartolucci Laura, Diene Ibra, Lemoine Frédéric, Gascuel Olivier, Pratviel Geneviève, Mergny Jean-Louis & Andreola Marie-Line, 2022 — Deciphering RNA G-quadruplex function during the early steps of HIV-1 infection. Abstract G-quadruplexes (G4s) are four-stranded nucleic acid structures formed by the stacking of G-tetrads. Here we… Nucleic Acids Research vol. 50, n° 21, p. 12328-12343
ISSN
0305-1048, 1362-4962
https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkac1030
Danesh Gonché, Saulnier Emma, Gascuel Olivier, Choisy Marc & Alizon Samuel, 2022 — < span style="font-variant:small-caps;">TiPS</span> : Rapidly simulating trajectories and phylogenies from compartmental models. Methods in Ecology and Evolution , , 2041–210X.14038
ISSN
2041-210X, 2041-210X
https://dx.doi.org/10.1111/2041-210X.14038
Kawamura Kunio, Lambert Jean-François, Ter-Ovanessian Louis M. P., Vergne Jacques, Hervé Guy & Maurel Marie-Christine, 2022 — Life on Minerals: Binding Behaviors of Oligonucleotides on Zirconium Silicate and its Inhibitory Activity for the Self-Cleavage of Hammerhead Ribozyme. The role of minerals in the chemical evolution of RNA molecules is an important issue when considering the early stage of the… Life (Chicago, Ill. : 1978) vol. 12, n° 11, p. 1689
ISSN
2075-1729
https://dx.doi.org/10.3390/life12111689
Besombes Camille, Mbrenga Festus, Schaeffer Laura, Malaka Christian, Gonofio Ella, Landier Jordi, Vickos Ulrich, Konamna Xavier, Selekon Benjamin, Dankpea Joella Namsenei, Von Platen Cassandre, Houndjahoue Franck Gislain, Ouaïmon Daniel Sylver, Hassanin Alexandre, Berthet Nicolas et al., 2022 — National Monkeypox Surveillance, Central African Republic, 2001–2021. Emerging Infectious Diseases vol. 28, n° 12, p. 2435-2445
ISSN
1080-6040, 1080-6059
https://dx.doi.org/10.3201/eid2812.220897
Percot A., Maurel M.C., Lambert J.F. & Zins E.L., 2024 — New insights into the Surface Enhanced Raman Scattering (SERS) response of adenine using chemometrics. Spectrochimica Acta Part A: Molecular and Biomolecular Spectroscopy vol. 314, , p. 124177
ISSN
13861425
https://dx.doi.org/10.1016/j.saa.2024.124177
Prediger Carolina, Ferreira Erina, Zorzato Samara, Hua-Van Aurélie, Klasson Lisa, Miller Wolfgang, Yassin Amir & Madi-Ravazzi Lilian, 2024 — Saltational Episodes of Reticulate Evolution in the Drosophila saltans Species Group. Phylogenomics reveals reticulate evolution to be widespread across taxa, but whether reticulation is due to low statistical… Molecular Biology and Evolution vol. 41, n° 12, msae250 Accession Number: 39661651 ISBN: 0737-4038 Publisher: Oxford University Press (OUP) Type: 10.1093/molbev/msae250
https://hal.science/hal-04910623
Percot Aline, Mahieddine Farah, Yano Hajime, Hasegawa Sunao, Tabata Makoto, Yamagishi Akihiko, Mita Hajime, Paredes-Arriaga Alejandro, Maurel Marie-Christine, Lambert Jean-François, Baklouti Donia & Zins Emilie-Laure, April 2024 — Surface-Enhanced Raman Spectroscopy (SERS) for Identifying Traces of Adenine in Organic-Bearing Extraterrestrial Dust Analogs Captured in the Tanpopo Aerogel after Hypervelocity Impacts. Raman spectroscopy is a non-destructive analytical technique for characterizing organic and inorganic materials with spatial… Gels vol. 10, n° 4, p. 249 ISBN: 2310-2861 Publisher: MDPI Type: 10.3390/gels10040249
https://dx.doi.org/10.3390/gels10040249
Xie Ruopeng, Adam Dillon C, Hu Shu, Cowling Benjamin J, Gascuel Olivier, Zhukova Anna & Dhanasekaran Vijaykrishna, 2024 — Integrating contact tracing data to enhance outbreak phylodynamic inference: a deep learning approach. Molecular Biology and Evolution , , msae232
ISSN
0737-4038, 1537-1719
https://dx.doi.org/10.1093/molbev/msae232
Morel Marie, Zhukova Anna, Lemoine Frédéric & Gascuel Olivier, 2024 — Accurate Detection of Convergent Mutations in Large Protein Alignments with ConDor. Abstract Evolutionary convergences are observed at all levels, from phenotype to DNA and protein sequences, and changes at… Genome Biology and Evolution vol. 16, n° 4, evae040
ISSN
1759-6653
https://dx.doi.org/10.1093/gbe/evae040
Gascuel O. & Lemoine F., 2024 — « Measures of Branch Support in Phylogenetics » in Models and Methods for Biological Evolution.. , , p. 213-234
ISBN
978-1-78945-069-9
https://www.iste.co.uk/book.php?id=2117
Lemoine Frédéric & Gascuel Olivier, 2024 — The Bayesian Phylogenetic Bootstrap, Application to Short Trees and Branches. Molecular Biology and Evolution , , msae238
ISSN
0737-4038, 1537-1719
https://dx.doi.org/10.1093/molbev/msae238
Ferreira Erina, Moore Cathy, Ogereau David, Suwalski Arnaud, Prigent Stéphane, Rogers Rebekah & Yassin Amir, 2024 — Genomic islands of divergence between Drosophila yakuba subspecies are predominantly driven by chromosomal inversions and the recombination landscape. During the early stages of local adaptation and speciation, genetic differences tend to accumulate at certain regions of the… Molecular Ecology vol. 34, n° 3, ISBN: 0962-1083 Publisher: Wiley Type: 10.1111/mec.17627
https://hal.science/hal-04910597
Chantepie Stéphane, Charmantier Anne, Delahaie Boris, Adriaensen Frank, Matthysen Erik, Visser Marcel, Álvarez Elena, Barba Emilio, Orell Markku, Sheldon Ben, Ivankina Elena, Kerimov Anvar, Lavergne Sébastien & Teplitsky Céline, 2024 — Divergence in evolutionary potential of life history traits among wild populations is predicted by differences in climatic conditions. Evolution Letters vol. 8, n° 1, p. 29-42 Publisher: Wiley Open Access tex.hal_id: hal-04548215 tex.hal_version: v1
https://dx.doi.org/10.1093/evlett/qrad067
Barilar Ivan, Fernando Tatiana, Utpatel Christian, Abujate Cláudio, Madeira Carla Maria, José Benedita, Mutaquiha Claudia, Kranzer Katharina, Niemann Tanja, Ismael Nalia, De Araujo Leonardo, Wirth Thierry, Niemann Stefan & Viegas Sofia, 2024 — Emergence of bedaquiline-resistant tuberculosis and of multidrug-resistant and extensively drug-resistant Mycobacterium tuberculosis strains with rpoB Ile491Phe mutation not detected by Xpert MTB/RIF in Mozambique: a retrospective observational study. The Lancet Infectious Diseases vol. 24, n° 3, p. 297-307
ISSN
14733099
https://dx.doi.org/10.1016/S1473-3099(23)00498-X
Bastide Héloïse, Legout Hélène, Dogbo Noé, Ogereau David, Prediger Carolina, Carcaud Julie, Filée Jonathan, Garnery Lionel, Gilbert Clément, Marion-Poll Frédéric, Requier Fabrice, Sandoz Jean-Christophe & Yassin Amir, February 2024 — The genome of the blind bee louse fly reveals deep convergences with its social host and illuminates Drosophila origins. Social insects nests harbor intruders known as inquilines,1 which are usually related to their host.2,3 However, distant non… Current Biology - CB vol. 34, n° 5, 1122–1132.e5 ISBN: 0960-9822 Publisher: Elsevier Type: 10.1016/j.cub.2024.01.034
https://hal.science/hal-04452751
Zhukova Anna, Hecht Frédéric, Maday Yvon & Gascuel Olivier, 2023 — Fast and Accurate Maximum-Likelihood Estimation of Multi-Type Birth-Death Epidemiological Models from Phylogenetic Trees. Abstract Multi-type birth-death (MTBD) models are phylodynamic analogies of compartmental models in classical epidemiology… Systematic Biology , , syad059
ISSN
1063-5157, 1076-836X
https://dx.doi.org/10.1093/sysbio/syad059
Sabroux Romain, Corbari Laure & Hassanin Alexandre, 2023 — Phylogeny of sea spiders (Arthropoda: Pycnogonida) inferred from mitochondrial genome and 18S ribosomal RNA gene sequences. Molecular Phylogenetics and Evolution vol. 182, , p. 107726 Number: 107726 tex.earlyaccessdate: FEB 2023 tex.eissn: 1095-9513 tex.orcid-numbers: HASSANIN, Alexandre/0000-0002-4905-8540 Hassanin, Alexandre/0000-0002-4905-8540 tex.researcherid-numbers: HASSANIN, Alexandre/AAO-3327-2021 Hassanin, Alexandre/AAP-8634-2
ISSN
10557903
https://dx.doi.org/10.1016/j.ympev.2023.107726
Ter-Ovanessian Louis M. P., Lambert Jean-François & Maurel Marie-Christine, 2023 — Ringclosure on the Rocks in a Prebiotic Environment.. Chembiochem : a European journal of chemical biology vol. 24, n° 10, e202300143
ISSN
1439-4227, 1439-7633
https://dx.doi.org/10.1002/cbic.202300143
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  • Atelier de bio-informatique (ABI)
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  • Evolution fonctionnelle et Taxonomie (EvoFoncT)
  • Exploration, Espèces et Evolution (3E)
  • Interactions et Evolution Végétale et Fongique (INEVEF)
  • Laboratoire informatique et Systématique (LIS-C)
  • (-) Phylogénomique, phylodynamique et interactions hôtes-pathogènes (PhyloPath)
  • Systématique, Phylogéographie, Évolution, Conservation (SPEC)

Affiliation organism

  • CNRS
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Status

  • Maître de Conférences
  • Professeur émérite

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