Skip to main content
Institutional affiliations MNHN-CNRS-SU-EPHE-UA
MCAM is a laboratory under the dual supervision of the CNRS (INEE) and the National Museum of Natural History.
logo ISYEB
MNHN
CNRS
EPHE-PSL
en
  • Français
  • English
Search icon

Menu

  • Publications
  • Agenda
  • Annuaire des équipes
  • Axes transversaux et Ressources
    • Laboratoire commun de biologie moléculaire - BoEM
    • Secrétariat et Gestion de l'UMR
    • Cellule de macro-écologie
    • Dessin scientifique
    • Cellule 3D
    • Cellule Morphologie fonctionnelle, AI et reconnaissance des formes
    • Laboratoire de Biologie moléculaire (BOEM)
    • Laboratoire de Cytogénétique
    • Laboratoire photonique 2D/3D de la biodiversité
    • Pôle Évolution ABC
    • Salle Acoustique
  • Présentation
    • Présentation de l'ISYEB et de ses équipes
    • Contacts utiles
      • Nous écrire
      • Mentions légales et politique de confidentialité
    • Contacts utiles
    • Le Conseil d'Unité
    • Santé et Sécurité au travail
    • Règlement intérieur et livret d'accueil de l'ISYEB
  • Les équipes de recherche
    • Atelier de bio-informatique (ABI)
      • Liste du personnel de l'équipe A.B.I.
    • Biodiversité: Interactions, Adaptations, Spéciation
      • Liste du personnel de l'équipe Biodiversité, intéractions, adaptations et spéciation
    • Biologie de la mangrove
      • Liste du personnel de l'équipe biologie de la mangrove
    • Biologie intégrative des populations, Evolution moléculaire (BIPEM)
    • Evolution fonctionnelle et Taxonomie (EVOFONCT)
      • Liste du personnel de l'équipe E.V.O.F.O.N.C.T
    • Exploration, Espèces et Evolution (3E)
      • Liste du personnel de l'équipe 3.E
    • Homologies
      • Liste du personnel de l'équipe Homologies
    • Interactions et Évolution Végétale et Fongique (INEVEF)
      • Liste du personnel de l'équipe INEVEF
    • Laboratoire informatique et Systématique (LIS)
      • Liste du personnel de l'équipe L.I.S.
    • Morpho-Anatomie et Développement des Plantes (MADP)
      • Liste du personnel de l'équipe M.A.D.P.
    • Systématique, phylogéographie, évolution, conservation (SPEC)
      • Liste du personnel de l'équipe SPEC
  • Axes transversaux et ressources
    • Axe - Analyse des formes et Phénomique
    • Axe - Taxonomie
    • Axe - GPS "Génomique, Populations et Systématique"
  • Actualités
    • Séminaires de l'ISYEB
      • Prochains séminaires de l'ISYEB
      • Tout ce qu'il faut savoir sur les séminaires de l'ISYEB
      • Plan d'accès pour l'amphithéâtre Rouelle
    • Toutes les actualités de l'ISYEB
  • Vie scientifique
    • Publications - Collection HAL ISYEB
    • Thèses
      • Thèses en cours
      • Thèses soutenues
Home
L’Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité
UMR 7205

Search

Breadcrumb

  • Home

Pagination

  • Page 1/2
  • Next page ››
  • Last page Last »
Bonnefous H., Teulière J., Lapointe F.J., Lopez P. & Bapteste E., 2024 — Most genetic roots of fungal and animal aging are hundreds of millions of years old according to phylostratigraphy analyses of aging networks.. GeroScience , ,
https://dx.doi.org/https://rdcu.be/dKFlV
Bonnefous H, Teulière J, Lapointe FJ, Lopez P & Bapteste E, 2024 — Most genetic roots of fungal and animal aging are hundreds of millions of years old according to phylostratigraphy analyses of aging networks.. GEROSCIENCE , ,
ISSN
2509-2715
https://dx.doi.org/10.1007/s11357-024-01234-9
Lannes Romain, Bapteste Éric & Lopez Philippe, November 2019 — Search for unknown environmental sequences of medical/biological interest using large sequence similarity networks, Recherche de séquences environnementales inconnues d’intérêt médical/biologique par l’utilisation de grands réseaux de similarité de séquen. The objective of this thesis was to identify as yet unknown microorganisms present in various environments and to characterize… , ,
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-02954131
Lemieux-Labonté Virginie, Vigliotti Chloé, Tadic Zoran, Wehrle Beck, Lopez Philippe, Bapteste Eric, Lapointe François-Joseph, German Donovan P. & Herrel Anthony, 2022 — Proximate Drivers of Population-Level Lizard Gut Microbial Diversity: Impacts of Diet, Insularity, and Local Environment. Microorganisms vol. 10, n° 8, p. 1550
ISSN
2076-2607
https://dx.doi.org/10.3390/microorganisms10081550
Denoeud France, Godfroy Olivier, Cruaud Corinne, Heesch Svenja, Nehr Zofia, Tadrent Nachida, Couloux Arnaud, Brillet-Guéguen Loraine, Delage Ludovic, Mckeown Dean, Motomura Taizo, Sussfeld Duncan, Fan Xiao, Mazéas Lisa, Terrapon Nicolas et al., 2024 — Evolutionary genomics of the emergence of brown algae as key components of coastal ecosystems. Brown seaweeds are keystone species of coastal ecosystems, often forming extensive underwater forests, and are under… Cell , , ISBN: 0092-8674 Type: 10.1016/j.cell.2024.10.049
https://hal.science/hal-04794231
Denoeud France, Godfroy Olivier, Cruaud Corinne, Heesch Svenja, Nehr Zofia, Tadrent Nachida, Couloux Arnaud, Brillet-Guéguen Loraine, Delage Ludovic, Mckeown Dean, Motomura Taizo, Sussfeld Duncan, Fan Xiao, Mazéas Lisa, Terrapon Nicolas et al., 2024 — Evolutionary genomics of the emergence of brown algae as key components of coastal ecosystems. Cell vol. 187, n° 24, 6943–6965.e39
ISSN
00928674
https://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2024.10.049
Bernard Charles, Li Yanyan, Lopez Philippe & Bapteste Eric, April 2023 — Large-Scale Identification of Known and Novel RRNPP Quorum-Sensing Systems by RRNPP_Detector Captures Novel Features of Bacterial, Plasmidic, and Viral Coevolution. Abstract Gram-positive Firmicutes bacteria and their mobile genetic elements (plasmids and bacteriophages) encode peptide-based… Molecular Biology and Evolution vol. 40, n° 4, ISBN: 0737-4038 Publisher: Oxford University Press (OUP) Type: 10.1093/molbev/msad062
https://hal.science/hal-04246120
Sussfeld Duncan, Lannes Romain, Corel Eduardo, Bernard Guillaume, Martin Pierre, Bapteste Eric, Pelletier Eric & Lopez Philippe, June 2025 — New groups of highly divergent proteins in families as old as cellular life with important biological functions in the ocean. Metagenomics has considerably broadened our knowledge of microbial diversity, unravelling fascinating adaptations and… Environmental Microbiome vol. 20, , p. 65 ISBN: 2524-6372 Type: 10.1186/s40793-025-00697-3
https://hal.science/hal-05347054
Gomez-Raya-Vilanova Miguel, Teulière Jérôme, Medvedeva Sofia, Dai Yuping, Corel Eduardo, Lopez Philippe, Lapointe François-Joseph, Bhattacharya Debashish, Haraoui Louis-Patrick, Turc Elodie, Monot Marc, Cvirkaite-Krupovic Virginija, Bapteste Eric & Krupovic Mart, July 2025 — Transcriptional landscape of the cell cycle in a model thermoacidophilic archaeon reveals similarities to eukaryotes. Similar to many eukaryotes, the thermoacidophilic archaeon Saccharolobus islandicus follows a defined cell cycle program, with… Nature Communications vol. 16, n° 1, p. 5697 Accession Number: 40593522 ISBN: 2041-1723 Type: 10.1038/s41467-025-60613-8
https://pasteur.hal.science/pasteur-05141107
Dai Yuping, Boussaguet Ni, Teulière Jérôme, Bonnefous Hugo, Budzinski Elphège, Lopez Philippe, Haraoui Louis-Patrick & Bapteste Eric, August 2025 — Interspecific interactions and aging: Prediction of gerogenic bacteria and critical human protein targets of microbial infections. Bacteria permeate every niche of the human body with major consequences on our health and senescence that have not been fully… Mechanisms of Ageing and Development vol. 226, , p. 112076 ISBN: 0047-6374 Type: 10.1016/j.mad.2025.112076
https://hal.science/hal-05347044
Evangelista Dominic, Thouze France, Kohli Manpreet Kaur, Lopez Philippe & Legendre Frederic, 2018 — Topological support and data quality can only be assessed through multiple tests in reviewing Blattodea phylogeny. Molecular Phylogenetics and Evolution vol. 128, , p. 112-122
ISSN
1055-7903
https://dx.doi.org/10.1016/j.ympev.2018.05.007
Lord Etienne, Pathmanathan Jananan S, Corel Eduardo, Makarenkov Vladimir, Lopez Philippe, Bouchard Frédéric, Bhattacharya Debashish, Antoine Pierre-Olivier, Guyader Hervé Le, Lapointe François-Joseph & Bapteste Eric, 2019 — Introducing trait networks to elucidate the fluidity of organismal evolution using palaeontological data. Genome Biology and Evolution vol. 11, n° 9, p. 2653-2665
ISSN
1759-6653
https://dx.doi.org/10.1093/gbe/evz182
Watson Andrew K., Lannes Romain, Pathmanathan Jananan S., Méheust Raphaël, Karkar Slim, Colson Philippe, Corel Eduardo, Lopez Philippe & Bapteste Eric, 2019 — « The Methodology Behind Network Thinking: Graphs to Analyze Microbial Complexity and Evolution » in Evolutionary Genomics.. vol. 1910, , dir. Springer New York p. 271-308
ISBN
978-1-4939-9073-3 978-1-4939-9074-0
https://dx.doi.org/10.1007/978-1-4939-9074-0_9
Lannes Romain, Olsson-Francis Karen, Lopez Philippe & Bapteste Eric, 2019 — Carbon Fixation by Marine Ultrasmall Prokaryotes. Highlighted in Contribution of Ultra-Small Microbes to Global Carbon Cycles.. Genome Biology and Evolution vol. 11, n° 4, p. 1166-1177
ISSN
1759-6653
https://dx.doi.org/10.1093/gbe/evz050
Bernard Charles, Lannes Romain, Li Yanyan, Bapteste Eric & Lopez Philippe, 2020 — Rich repertoire of quorum sensing protein coding sequences in CPR and DPANN associated with interspecies and interkingdom communication. msystems vol. 5, n° 5, e00414–20 tex.article-number: e00414-20 tex.orcid-numbers: Lannes, Romain/0000-0002-6672-1762 tex.unique-id: ISI:000579368300039
ISSN
2379-5077
https://dx.doi.org/10.1128/mSystems.00414-20
Bapteste Eric, Gérard Philippe, Larose Catherine, Blouin Manuel, Not Fabrice, Campos Liliane, Aïdan Géraldine, Selosse M. André, Adénis M. Sarah, Bouchard Frédéric, Dutreuil Sébastien, Corel Eduardo, Vigliotti Chloé, Huneman Philippe, Lapointe F. Joseph et al., 2021 — The Epistemic Revolution Induced by Microbiome Studies: An Interdisciplinary View. Biology vol. 10, n° 7, p. 651
ISSN
2079-7737
https://dx.doi.org/10.3390/biology10070651
Lannes Romain, Cavaud Louise, Lopez Philippe & Bapteste Eric, 2020 — Marine Ultrasmall Prokaryotes Likely Affect the Cycling of Carbon, Methane, Nitrogen, and Sulfur. Genome Biology and Evolution vol. 13, n° 1, evaa261
ISSN
1759-6653
https://dx.doi.org/10.1093/gbe/evaa261
Bernard Charles, Li Yanyan, Lopez Philippe & Bapteste Eric, 2021 — Beyond arbitrium: identification of a second communication system in Bacillus phage phi3T that may regulate host defense mechanisms. Isme Journal vol. 15, n° 2, p. 545-549
ISSN
1751-7362
https://dx.doi.org/10.1038/s41396-020-00795-9
Bernard Charles, Lopez Philippe & Bapteste Eric, 2020 — « Microbial Communication Networks: Sketching a Method for Analyzing the Communication of Bacteriophages Inside Environmental Communities » in Biocommunication of Phages.. , , dir. Springer International Publishing p. 163-181
ISBN
978-3-030-45884-3 978-3-030-45885-0
https://dx.doi.org/10.1007/978-3-030-45885-08
Bernard Guillaume, Teuliere Jerome, Lopez Philippe, Corel Eduardo, Lapointe Francois-Joseph & Bapteste Eric, 2022 — Aging at Evolutionary Crossroads: Longitudinal Gene Co-expression Network Analyses of Proximal and Ultimate Causes of Aging in Bats. Molecular Biology and Evolution vol. 39, n° 1, msab302
ISSN
0737-4038
https://dx.doi.org/10.1093/molbev/msab302
  • Refine the 31 results

Categories

Category

By authors

  • Eric BAPTESTE
  • Hugo BONNEFOUS
  • Eduardo COREL
  • Yuping DAI
  • Line LE GALL
  • Frédéric LEGENDRE
  • (-) Philippe LOPEZ

Year

  • 2025
  • 2024
  • 2023
  • 2022
  • 2021
  • 2020
  • 2019
  • 2018

Affiliation entity

  • Adaptation, Intégration, Réticulation, Evolution (AIRE)
  • Evolution fonctionnelle et Taxonomie (EvoFoncT)
  • Exploration, Espèces et Evolution (3E)

Affiliation organism

  • -
  • CNRS
  • MNHN
  • Sorbonne Université

Status

Pagination

  • Page 1/2
  • Next page ››
  • Last page Last »
A research group
logo ISYEB
MNHN
CNRS
EPHE-PSL
  • Présentation de l'ISYEB
    • Contacts utiles
    • Nous écrire
    • Organigramme structurel ISYEB
  • Actualités
    • Chronique mensuelle : En direct des espèces
  • Vie scientifique
    • Bienvenue sur la collection des publications de l'ISYEB
    • Thèses
Follow us
  • Bluesky
  • Youtube
  • Legal notice
  • Sitemap
  • Credits
  • Politique de confidentialité
A website by MNHN logo