Affiliation entity
Systématique, Phylogéographie, Évolution, Conservation (SPEC)
Interdisplinary research theme
Biologie de l’Évolution de la Biodiversité
Speciality
Génétique et Génomique Evolutive - Mammifères

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E-mail
aude.lalis [at] mnhn.fr
Address(es)

57 rue Cuvier
CP51
75005 Paris

Responsibilities outside unit

Membre nommé du Comité de l’Environnement Polaire / Conseil scientifique de la Réserve naturelle nationale des Terres australes françaises (2023-2027)

Membre nommé du Groupe de Travail National Mammifère marins en détresse – Ministère MER (> 2023)

Membre du Comité de Pilotage du Réseau National Echouage des Mammifères Marins (2021-2026)

Vice-présidente du Comité National Français des Recherches Arctiques et Antarctiques

 

Collections

Presentation

MECANISMES DE REPONSE ET D’ADAPTATION DES ESPECES AUX CHANGEMENTS GLOBAUX : CONSEQUENCES SUR LA DIVERSITE GENETIQUE ET IMPLICATIONS TAXONOMIQUES

L’érosion de la biodiversité causée par les changements globaux doit être aujourd’hui une préoccupation majeure tant d’un point de vue politique, scientifique que sociétal. La rapidité et l’intensité de ces changements nous invitent à développer des approches permettant de mesurer, comprendre, et prévoir les réponses de la biodiversité au changement du climat et aux transformations des paysages par les activités humaines. Ma problématique de recherche vise à mieux comprendre l’impact des changements globaux (changements climatiques et activités humaines) sur la biodiversité en caractérisant les mécanismes de réponse et d’adaptation des espèces et en mesurant les conséquences de ces réponses sur la diversité génétique. Servir certaines grandes questions sociétales, économiques et environnementales constitue un enjeu fort qui nécessite donc une approche intégrative et une méthodologie originale et innovante que je développe au sein de l’équipe SPEC à travers différentes questions :

COMMENT SE STRUCTURENT LES VARIABILITES MORPHOLOGIQUE ET GENETIQUE DANS L’ESPACE ET DANS LE TEMPS?

  • au sein d’un ecosystème urbain: Projet ANR ARMAGUEDON 2021-2025 (Assessment of Rats Management Associated to a Genomics-Urban Ecology-Disease Occurrence Network in Paris / Approche interdisciplinaire en génomique, écologie urbaine et éco-épidémiologie pour une meilleure gestion des rats à Paris)
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  • au sein de complexes d’espèces: Histoire évolutive des populations de Rongeurs / Mastomys en Afrique de l’Ouest
Aude LALIS bandeau 2 © MNHN

 

QUELS SONT LES IMPACTS LOCAUX DES CHANGEMENTS GLOBAUX SUR L’EMERGENCE DE MALADIES INFECTIEUSES?

  • Emergence et Evolution de nouveaux hantavirus chez les musaraignes en Afrique de l’Ouest
  • Emergence et Evolution de nouveaux lyssavirus chez les chauves-souris en Guinée
  • Biodiversité microbienne / Microbiote chez les chauves-souris africaines
Aude LALIS bandeau 4 © MNHN

 

QUELLES SONT LES RELATIONS ENTRE HISTOIRE EVOLUTIVE ET INTERACTION HOTE / PATHOGENE?

  • Mastomys et la Fièvre de Lassa
Mastomys natalensis et la Fièvre de Lassa © MNHN

 

QUEL EST L’IMPACT DU CHANGEMENT CLIMATIQUE SUR LE POTENTIEL ADAPTATIF DES ESPECES?

  • Le renard arctique (Vulpes lagopus), espèces sentinelle de l’écosystème arctique - Projet FLOCON (en collaboration avec l’UQAR - Chaire de Recherche du Canada en Conservation des Écosystèmes Nordiques)
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  • Analyse spatio-temporelle du régime alimentaire du lièvre arctique (Lepus arcticus) dans le haut arctique canadien par une approche de metabarcoding ADN (en collaboration avec l’UQAR - Chaire de Recherche du Canada en Conservation des Écosystèmes Nordiques)

 

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  • Expertise scientifique / Terrains de Recherche
  • * Missions - Biodiversité africaine (Micromammifères: Rongeurs & Chauves-souris) : Guinée Conakry, Libéria, Sierra Léone, Mali, Mauritanie, Niger, Burkina Faso, Bénin, Togo, Cameroun
    * Missions - Biodiversité urbaine (Micromammifères)
    * Missions - Biodiversité Arctique (Mammifères marins, Faune arctique…)
    * Expertises - Études d’impact/  Santé Publique (BENIN 2018 Ministère de la Santé République du Bénin, « Mastomys & Fièvre de Lassa »; LIBERIA 2013 EGIS Liberia Nimba «Expertise micromammifères », GUINEE & LIBERIA 2011-2012 SNC Lavalin-Vale BSGR « Expertise micromammifères »)
    * Conférencière / Scientifique embarquée - Navire Expédition (Arctique - Antarctique - Afrique de l’Ouest)
    * Conseillère scientifique - Expositions (Commissaire scientifique de l›Exposition DESERTS, MNHN - Les Champions de la Nature, MNHN -Odyssée Sensorielle, RATTUS Musée des égouts de Bruxelles…)
  • voir la vidéo -> ARTE 28 minutes, Invitée du Samedi, Expo Déserts? https://www.youtube.com/watch?v=Rz5ZhVSedKM&t=2386s
  • voir la vidéo -> Retours d’exploration | Évasion au grand Nord / Odyssée Sensorielle https://youtu.be/cjnlY3I8hsY?si=FuINWhc2MjxYIHwk

 

  • Collection Mammifères Marins

      Chargée de conservation de collection / Curator of Marine mammals - MNHN Paris

      Responsable de la Cellule Échouage / MNHN

 

bandeau collections Aude Lalis

 

 

Projects

Publications

2026
  • Pellerin Marie, Kwasiborski Aurélia, Lattard Virginie, Pisanu Benoit, Sauvage Virginie, Habold Caroline, Hourde Veronique, Lefebvre Sébastien, Daouda Soro Sionfoungo, Caro Valérie, Castel Guillaume, Temmam Sarah, Manuguerra Jean-Claude, Lalis Aude, Monchatre-Leroy Elodie et al., April 2026 — « Étude de la circulation du virus de l’hépatite E du rat (Rocahepevirus ratti) dans des populations de rats bruns (Rattus norvegicus) de 8 grandes villes françaises, de 2021 à 2023. » in XXVIIIes journées francophones de virologie.. vol. 30, , p. 184 Number: 2 tex.hal_id: hal-05612187 tex.hal_version: v1
  • Voet Inessa, Delapre Arnaud, Denys Christiane, Lalis Aude, Cornette Raphaël & Nicolas Violaine, February 2026 — Integrative taxonomy resolves a new West African Crocidura (Mammalia: Soricidae) species, cryptic to Crocidura grandiceps in color, but distinct in size. High species richness in tropical West Africa has been demonstrated for many species groups, among which shrews are no… European Journal of Taxonomy vol. 1039, , p. 297-322 tex.hal_id: hal-05515101 tex.hal_version: v1
    ISSN
    2118-9773
2025
  • Denys Christiane, Missoup Alain D., Nicolas Violaine, Sylla Morlaye, Douno Mory, Kadjo Blaise, Lalis Aude & Monadjem Ara, 2025 — Annotated checklist of rodents from a biodiversity hotspot, Mount Nimba (West Africa). Zoosystema. Publications Scientifiques du Muséum national d’Histoire naturelle vol. 47, n° 27, p. 619-689
  • Luo Dong-Sheng, Harazim Markéta, Maufrais Corinne, Bonas Simon, Martinkova Natalia, Lalis Aude, Nakouné Emmanuel, Adjogoua Edgard Valéry, Douno Mory, Kadjo Blaise, López-Roig Marc, Pikula Jiri, Shi Zheng-Li, Bourhy Hervé, Serra-Cobo Jordi et al., 2025 — Broad geographical circulation of a novel vesiculovirus in bats in the Mediterranean region. PLOS Neglected Tropical Diseases vol. 19, n° 6, e0013172
    ISSN
    1935-2735
2024
  • Battesti Vincent, Crépy Ma??l, Herrel Anthony, Lalis Aude & Larpin Denis, October 2024 — Déserts. Vivre en milieu extrême. De l’emblématique Sahara aux déserts polaires, en passant par les déserts de Sonora, d’Atacama ou de Gobi, ce catalogue invite… , , Pages: 164
    ISBN
    978-2-38279-031-1
  • Mostafavi Ehsan, Mohammadpour Roya, Esmaeili Saber, Mahmoudi Ahmad, Salehi-Vaziri Mostafa, Ghasemi Ahmad, Rohani Mahdi, Mohammadi Ali, Eybpoosh Sana, Baseri Neda, Denys Christiane, Maurin Max, Nicolas Violaine, Lalis Aude & Hugot Jean-Pierre, August 2024 — The Epidemiological Investigation of Yersinia pestis , Francisella tularensis , and Arenavirus Infections in Small Mammals in Northwestern Iran. Vector Borne and Zoonotic Diseases vol. 24, n° 8, p. 489-498 ISBN: 1530-3667 Type: 10.1089/vbz.2023.0089
  • Denys Christiane, Gabriel Nadine, Lalis Aude & Jenkins Paulina, July 2024 — Subfossil rodents and tenrecs of Children’s Cave, Madagascar. Journal of Natural History vol. 58, 25-28, p. 796-839 tex.hal_id: hal-04668866 tex.hal_version: v1
    ISSN
    0022-2933, 1464-5262
  • Luo Dong-Sheng, Harazim Markéta, Maufrais Corinne, Bonas Simon, Martinkova Natalia, Lalis Aude, Nakouné Emmanuel, Adjogoua Edgard Valéry, Douno Mory, Kadjo Blaise, López-Roig Marc, Pikula Jiri, Shi Zheng-Li, Bourhy Hervé, Serra-Cobo Jordi et al., April 2024 — Large circulation of a novel vesiculovirus in bats in the Mediterranean region. Abstract Bats are the natural reservoirs of a variety of emerging or re-emerging viruses. Among them, rabies virus (genus… BioRxiv , , Type: 10.1101/2024.04.24.590417
  • Luo Dong-Sheng, Harazim Markéta, Maufrais Corinne, Bonas Simon, Martinkova Natalia, Lalis Aude, Nakouné Emmanuel, Adjogoua Edgard Valéry, Douno Mory, Kadjo Blaise, López-Roig Marc, Pikula Jiri, Shi Zheng-Li, Bourhy Hervé, Serra-Cobo Jordi et al., April 2024 — Large circulation of a novel vesiculovirus in bats in the Mediterranean region. bioRxiv : the preprint server for biology , , tex.hal_id: hal-04668863 tex.hal_version: v1
  • Mostafavi Ehsan, Mohammadpour Roya, Esmaeili Saber, Mahmoudi Ahmad, Salehi-Vaziri Mostafa, Ghasemi Ahmad, Rohani Mahdi, Mohammadi Ali, Eybpoosh Sana, Baseri Neda, Denys Christiane, Maurin Max, Nicolas Violaine, Lalis Aude & Hugot Jean-Pierre, 2024 — The Epidemiological Investigation of Yersinia pestis, Francisella tularensis, and Arenavirus Infections in Small Mammals in Northwestern Iran. Vector-Borne and Zoonotic Diseases , ,
    ISSN
    1530-3667