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Les tutelles MNHN-CNRS-SU-EPHE-UA

L’Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité est une unité CNRS du Muséum national d’Histoire naturelle de Paris, ayant aussi pour tutelles l’Université Pierre et Marie Curie et l’Ecole Pratique des Hautes Etudes.

L’UMR 7205 a pour objectif de répondre aux questions concernant l’origine de la biodiversité, les modalités de diversification des espèces, la mise en place des communautés animales en lien avec l’évolution spatio-temporelle des taxons. L’unité est un des pôles européens de systématique et contribue de manière importante à la taxonomie et à la biologie de l’évolution. Les approches de systématique phylogénétique privilégiées par l’unité sont intégratives et ont amené la conception d’outils taxonomiques, moléculaires, génétiques, acoustiques, cytogénétiques, morphologiques et morphométriques.

L’Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité (ISYEB) succède à l’OSEB depuis le 1er Janvier 2014. Les laboratoires de l’Institut se trouvent au Jardin des Plantes dans des bâtiments situés rue Buffon et rue Cuvier (Entomologie, Mammifères et Oiseaux, Malacologie, Botanique, Reptiles-Amphibiens, Géologie).

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L’Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité
UMR 7205

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Xie Ruopeng, Adam Dillon, Hu Shu, Cowling Benjamin, Gascuel Olivier, Zhukova Anna & Dhanasekaran Vijaykrishna, juillet 2024 — Deep learning of SARS-CoV-2 outbreak phylodynamics with contact tracing data. Deep learning has emerged as a powerful tool for phylodynamic analysis, addressing common computational limitations affecting… , , Type: 10.1101/2024.06.10.24308687
https://pasteur.hal.science/pasteur-04638422
Morel Marie, Zhukova Anna, Lemoine Frédéric & Gascuel Olivier, 2024 — Accurate Detection of Convergent Mutations in Large Protein Alignments with ConDor. Abstract Evolutionary convergences are observed at all levels, from phenotype to DNA and protein sequences, and changes at… Genome Biology and Evolution vol. 16, n° 4, evae040
ISSN
1759-6653
https://dx.doi.org/10.1093/gbe/evae040
Prediger Carolina, Ferreira Erina, Zorzato Samara, Hua-Van Aurélie, Klasson Lisa, Miller Wolfgang, Yassin Amir & Madi-Ravazzi Lilian, 2024 — Saltational Episodes of Reticulate Evolution in the Drosophila saltans Species Group. Phylogenomics reveals reticulate evolution to be widespread across taxa, but whether reticulation is due to low statistical… Molecular Biology and Evolution vol. 41, n° 12, msae250 Accession Number: 39661651 ISBN: 0737-4038 Publisher: Oxford University Press (OUP) Type: 10.1093/molbev/msae250
https://hal.science/hal-04910623
Lemoine Frédéric & Gascuel Olivier, 2024 — The Bayesian Phylogenetic Bootstrap, Application to Short Trees and Branches. Molecular Biology and Evolution , , msae238
ISSN
0737-4038, 1537-1719
https://dx.doi.org/10.1093/molbev/msae238
Xie Ruopeng, Adam Dillon C, Hu Shu, Cowling Benjamin J, Gascuel Olivier, Zhukova Anna & Dhanasekaran Vijaykrishna, 2024 — Integrating contact tracing data to enhance outbreak phylodynamic inference: a deep learning approach. Molecular Biology and Evolution , , msae232
ISSN
0737-4038, 1537-1719
https://dx.doi.org/10.1093/molbev/msae232
Gascuel O. & Lemoine F., 2024 — « Measures of Branch Support in Phylogenetics » in Models and Methods for Biological Evolution.. , , p. 213-234
ISBN
978-1-78945-069-9
https://www.iste.co.uk/book.php?id=2117
Bastide Héloïse, Legout Hélène, Dogbo Noé, Ogereau David, Prediger Carolina, Carcaud Julie, Filée Jonathan, Garnery Lionel, Gilbert Clément, Marion-Poll Frédéric, Requier Fabrice, Sandoz Jean-Christophe & Yassin Amir, février 2024 — The genome of the blind bee louse fly reveals deep convergences with its social host and illuminates Drosophila origins. Social insects nests harbor intruders known as inquilines,1 which are usually related to their host.2,3 However, distant non… Current Biology - CB vol. 34, n° 5, 1122–1132.e5 ISBN: 0960-9822 Publisher: Elsevier Type: 10.1016/j.cub.2024.01.034
https://hal.science/hal-04452751
Ferreira Erina, Moore Cathy, Ogereau David, Suwalski Arnaud, Prigent Stéphane, Rogers Rebekah & Yassin Amir, 2024 — Genomic islands of divergence between Drosophila yakuba subspecies are predominantly driven by chromosomal inversions and the recombination landscape. During the early stages of local adaptation and speciation, genetic differences tend to accumulate at certain regions of the… Molecular Ecology vol. 34, n° 3, ISBN: 0962-1083 Publisher: Wiley Type: 10.1111/mec.17627
https://hal.science/hal-04910597
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Catégories

Catégorie

Par auteurs

  • Olivier GASCUEL
  • Amir YASSIN

Année

  • (-) 2024

Entité de rattachement

  • (-) Phylogénomique, phylodynamique et interactions hôtes-pathogènes (PhyloPath)

Organisme de rattachement

  • (-) CNRS

Statut

Une UMR
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CNRS
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