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Les tutelles MNHN-CNRS-SU-EPHE-UA

L’Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité est une unité CNRS du Muséum national d’Histoire naturelle de Paris, ayant aussi pour tutelles l’Université Pierre et Marie Curie et l’Ecole Pratique des Hautes Etudes.

L’UMR 7205 a pour objectif de répondre aux questions concernant l’origine de la biodiversité, les modalités de diversification des espèces, la mise en place des communautés animales en lien avec l’évolution spatio-temporelle des taxons. L’unité est un des pôles européens de systématique et contribue de manière importante à la taxonomie et à la biologie de l’évolution. Les approches de systématique phylogénétique privilégiées par l’unité sont intégratives et ont amené la conception d’outils taxonomiques, moléculaires, génétiques, acoustiques, cytogénétiques, morphologiques et morphométriques.

L’Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité (ISYEB) succède à l’OSEB depuis le 1er Janvier 2014. Les laboratoires de l’Institut se trouvent au Jardin des Plantes dans des bâtiments situés rue Buffon et rue Cuvier (Entomologie, Mammifères et Oiseaux, Malacologie, Botanique, Reptiles-Amphibiens, Géologie).

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Curaudeau Manon, Besombes Camille, Nakouné Emmanuel, Fontanet Arnaud, Gessain Antoine & Hassanin Alexandre, mars 2023 — Identifying the Most Probable Mammal Reservoir Hosts for Monkeypox Virus Based on Ecological Niche Comparisons. Viruses vol. 15, n° 3, p. 727 Accession Number: 36992436 ISBN: 1999-4915 Publisher: MDPI Type: 10.3390/v15030727
ISSN
1999-4915
https://dx.doi.org/10.3390/v15030727
Sabroux Romain, Corbari Laure & Hassanin Alexandre, 2023 — Phylogeny of sea spiders (Arthropoda: Pycnogonida) inferred from mitochondrial genome and 18S ribosomal RNA gene sequences (vol 182, 107726, 2023). MOLECULAR PHYLOGENETICS AND EVOLUTION vol. 185, , Number: 107821 tex.earlyaccessdate: JUN 2023 tex.eissn: 1095-9513 tex.orcid-numbers: HASSANIN, Alexandre/0000-0002-4905-8540 tex.researcherid-numbers: HASSANIN, Alexandre/AAO-3327-2021 tex.unique-id: WOS:001057436000001
ISSN
1055-7903
https://dx.doi.org/10.1016/j.ympev.2023.107821
Curaudeau Manon, Besombes Camille, Nakouné Emmanuel, Fontanet Arnaud, Gessain Antoine & Hassanin Alexandre, 2023 — Identifying the Most Probable Mammal Reservoir Hosts for Monkeypox Virus Based on Ecological Niche Comparisons. Viruses vol. 15, n° 3, p. 727
https://dx.doi.org/https://doi.org/10.3390/v15030727
Sabroux Romain, Corbari Laure & Hassanin Alexandre, 2023 — Phylogeny of sea spiders (Arthropoda: Pycnogonida) inferred from mitochondrial genome and 18S ribosomal RNA gene sequences. Molecular Phylogenetics and Evolution vol. 182, , p. 107726 Number: 107726 tex.earlyaccessdate: FEB 2023 tex.eissn: 1095-9513 tex.orcid-numbers: HASSANIN, Alexandre/0000-0002-4905-8540 Hassanin, Alexandre/0000-0002-4905-8540 tex.researcherid-numbers: HASSANIN, Alexandre/AAO-3327-2021 Hassanin, Alexandre/AAP-8634-2
ISSN
10557903
https://dx.doi.org/10.1016/j.ympev.2023.107726
Vidovszky MZ, Kapitány S, Gellért A, Harrach B, Görföl T, Boldogh SA, Kohl C, Wibbelt G, Müehldorfer K, Kemenesi G, Gembu GC, Hassanin A, Tu VT, Estók P, Horváth A et al., 2023 — Detection and genetic characterization of circoviruses in more than 80 bat species from eight countries on four continents. Abstract Several bat-associated circoviruses and circular rep-encoding single-stranded DNA (CRESS DNA) viruses have been… VETERINARY RESEARCH COMMUNICATIONS vol. 47, n° 3, p. 1561-1573
ISSN
0165-7380
https://dx.doi.org/10.1007/s11259-023-10111-3
Veron Geraldine, Daniel Caroline, Pagani Paolo, San Emmanuel Do Linh, Kitchener Andrew C. & Hassanin Alexandre, 2023 — A tale of two African mongooses (Carnivora: Herpestidae): differing genetic diversity and geographical structure across a continent. Mammalian Biology vol. 103, n° 1, p. 37-52 tex.earlyaccessdate: OCT 2022 tex.eissn: 1618-1476 tex.orcid-numbers: Hassanin, Alexandre/0000-0002-4905-8540 Daniel, Caroline/0000-0002-7168-2411 Do Linh San, Emmanuel/0000-0002-6513-5665 tex.researcherid-numbers: Hassanin, Alexandre/AAP-8634-2020 tex.un
ISSN
1616-5047
https://dx.doi.org/10.1007/s42991-022-00321-8
Hassanin Alexandre & Rambaud Opale, 2023 — Retracing Phylogenetic, Host and Geographic Origins of Coronaviruses with Coloured Genomic Bootstrap Barcodes: SARS-CoV and SARS-CoV-2 as Case Studies. Phylogenetic trees of coronaviruses are difficult to interpret because they undergo frequent genomic recombination. Here, we… Viruses vol. 15, n° 2, p. 406
ISSN
1999-4915
https://dx.doi.org/10.3390/v15020406
Curaudeau Manon, Besombes Camille, Nakouné Emmanuel, Fontanet Arnaud, Gessain Antoine & Hassanin Alexandre, 2022 — Identifying the most probable mammal reservoir hosts for Monkeypox virus based on ecological niche comparisons. Abstract Background Previous human cases or epidemics have suggested that Monkeypox virus (MPXV) can be transmitted through… PREPRINT vol. BIORXIV, , PREPRINT
https://dx.doi.org/DOI: 10.1101/2022.12.06.519416
Curaudeau Manon, Besombes Camille, Nakouné Emmanuel, Fontanet Arnaud, Gessain Antoine & Hassanin Alexandre, 2022 — Identifying the most probable mammal reservoir hosts for Monkeypox virus based on ecological niche comparisons. Abstract Background Previous human cases or epidemics have suggested that Monkeypox virus (MPXV) can be transmitted through… PREPRINT vol. BIORXIV, , PREPRINT
https://dx.doi.org/10.1101/2022.12.06.519416
Hassanin Alexandre & Rambaud Opale, 2022 — Retracing Phylogenetic, Host and Geographic Origins of Coronaviruses with Coloured Genomic Bootstrap Barcodes: SARS-CoV and SARS-CoV-2 as Case Studies. Phylogenetic trees of coronaviruses are difficult to interpret because they undergo frequent ge-nomic recombination. Here, we… LIFE SCIENCES - PREPRINT , , PREPRINT
https://dx.doi.org/DOI: 10.20944/preprints202212.0232.v1
Zhu Feng, Duong Veasna, Lim Xiao Fang, Hul Vibol, Chawla Tanu, Keatts Lucy, Goldstein Tracey, Hassanin Alexandre, Tu Vuong Tan, Buchy Philippe, Sessions October M., Wang Lin-Fa, Dussart Philippe & Anderson Danielle E., 2022 — Presence of Recombinant Bat Coronavirus GCCDC1 in Cambodian Bats. Viruses vol. 14, n° 2, p. 176
ISSN
1999-4915
https://dx.doi.org/10.3390/v14020176
Porrelli Stefano, Gerbault-Seureau Michele, Rozzi Roberto, Chikhi Rayan, Curaudeau Manon, Ropiquet Anne & Hassanin Alexandre, 2022 — Draft genome of the lowland anoa (Bubalus depressicornis) and comparison with buffalo genome assemblies (Bovidae, Bubalina). G3-GENES GENOMES GENETICS vol. 12, n° 11, tex.earlyaccessdate: SEP 2022 tex.orcid-numbers: Ropiquet, Anne/0000-0003-3755-5467 Hassanin, Alexandre/0000-0002-4905-8540 Curaudeau, Manon/0000-0003-3356-0701 Porrelli, Stefano/0000-0003-3878-7745 tex.researcherid-numbers: Ropiquet, Anne/E-6154-2011 Has
ISSN
2160-1836
https://dx.doi.org/10.1093/g3journal/jkac234
Sabroux Romain, Hassanin Alexandre & Corbari Laure, 2022 — Sea spiders (Arthropoda: Pycnogonida) collected during the Madibenthos Expedition from Martinique shallow waters. This study presents the inventory of sea spiders (Pycnogonida) sampled during the Madibenthos Expedition in Martinique (West… European Journal of Taxonomy vol. 851, , p. 1-141 Publisher: Muséum National d’Histoire Naturelle (MNHN) tex.hal_id: hal-03957149 tex.hal_version: v1
ISSN
2118-9773
https://dx.doi.org/10.5852/ejt.2022.851.1999
Hassanin Alexandre, 2022 — Variation in synonymous nucleotide composition among genomes of sarbecoviruses and consequences for the origin of COVID-19. Gene vol. 835, , p. 146641
ISSN
03781119
https://dx.doi.org/10.1016/j.gene.2022.146641
Hassanin Alexandre, Rambaud Opale & Klein Dylan, 2022 — Genomic Bootstrap Barcodes and Their Application to Study the Evolution of Sarbecoviruses. Viruses vol. 14, n° 2, p. 440
ISSN
1999-4915
https://dx.doi.org/10.3390/v14020440
Besombes Camille, Mbrenga Festus, Schaeffer Laura, Malaka Christian, Gonofio Ella, Landier Jordi, Vickos Ulrich, Konamna Xavier, Selekon Benjamin, Dankpea Joella Namsenei, Von Platen Cassandre, Houndjahoue Franck Gislain, Ouaïmon Daniel Sylver, Hassanin Alexandre, Berthet Nicolas et al., 2022 — National Monkeypox Surveillance, Central African Republic, 2001–2021. Emerging Infectious Diseases vol. 28, n° 12, p. 2435-2445
ISSN
1080-6040, 1080-6059
https://dx.doi.org/10.3201/eid2812.220897
Hassanin Alexandre, Veron Geraldine, Ropiquet Anne, vanVuuren Bettine Jansen, Lecu Alexis, Goodman Steven M., Haider Jibran & Trung Thanh Nguyen, février 2021 — Evolutionary history of Carnivora (Mammalia, Laurasiatheria) inferred from mitochondrial genomes. PLoS ONE vol. 16, n° 2, e0240770
ISSN
1932-6203
https://dx.doi.org/e0240770 10.1371/journal.pone.0240770
Hassanin Alexandre, 2021 — « La mystérieuse origine du SARS-CoV-2 en partie résolue » in Sorbonnavirus.. , ,
ISBN
979-10-231-0705-0
https://sup.sorbonne-universite.fr/catalogue/poche/les-essais-de-la-sorbonne/sorbonnavirus
Hassanin Alexandre, Tu Vuong Tan, Curaudeau Manon & Csorba Gabor, 2021 — Inferring the ecological niche of bat viruses closely related to SARS-CoV-2 using phylogeographic analyses of Rhinolophus species. Abstract The Severe Acute Respiratory Syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) is the causal agent of the coronavirus disease 2019 … Scientific Reports vol. 11, n° 1, p. 14276
ISSN
2045-2322
https://dx.doi.org/10.1038/s41598-021-93738-z
Hassanin Alexandre, Grandcolas Philippe & Veron Géraldine, janvier 2021 — Covid-19: natural or anthropic origin?. Mammalia vol. 85, n° 1, p. 1-7 ISBN: 0025-1461 Publisher: De Gruyter
ISSN
1864-1547, 0025-1461
https://dx.doi.org/10.1515/mammalia-2020-0044
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