L’Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité est une unité CNRS du Muséum national d’Histoire naturelle de Paris, ayant aussi pour tutelles l’Université Pierre et Marie Curie et l’Ecole Pratique des Hautes Etudes.
L’UMR 7205 a pour objectif de répondre aux questions concernant l’origine de la biodiversité, les modalités de diversification des espèces, la mise en place des communautés animales en lien avec l’évolution spatio-temporelle des taxons. L’unité est un des pôles européens de systématique et contribue de manière importante à la taxonomie et à la biologie de l’évolution. Les approches de systématique phylogénétique privilégiées par l’unité sont intégratives et ont amené la conception d’outils taxonomiques, moléculaires, génétiques, acoustiques, cytogénétiques, morphologiques et morphométriques.
L’Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité (ISYEB) succède à l’OSEB depuis le 1er Janvier 2014. Les laboratoires de l’Institut se trouvent au Jardin des Plantes dans des bâtiments situés rue Buffon et rue Cuvier (Entomologie, Mammifères et Oiseaux, Malacologie, Botanique, Reptiles-Amphibiens, Géologie).
ISYEB
Tristan Cordier présente ses travaux portant sur l’ADN environnemental et sédimentaire, la biosurveillance et l’apprentissage automatique.
La génomique environnementale a permis aux biologistes d’étudier les relations entre la biodiversité et les écosystèmes à des échelles spatio-temporelles inédites. Il est désormais possible de caractériser la biodiversité à l’échelle de l’océan, mais aussi de reconstruire les communautés passées grâce aux archives sédimentaires. Cet engouement et les potentialités offertes a également ouvert la voie à l’application de ces méthodes haut-débit pour la surveillance d’écosystèmes anthropisés, dans le but de réduire notre empreinte sur l’environnement.
Ce séminaire couvrira des travaux réalisés à l’Université de Genève où je me suis intéressé à développer des approches combinant metabarcoding et apprentissage automatique pour la biosurveillance d’écosystèmes côtiers. J’aborderai notamment les aspects techniques mais aussi les problèmes qui se posent pour l’implémentation de ces approches dans un cadre réglementaire par nature contraignant. Je présenterai ensuite les travaux actuellement menés à Bergen, où je m’intéresse à développer l’ADN sédimentaire ancien comme proxy pour la reconstruction de la banquise en Arctique et de la pompe biologique au cours des 130 000 dernière années, afin de mieux appréhender les effets du changement climatique sur le fonctionnement de l’océan.
Flashy Plants Attract More Scientists Martino Adamo, Department of Life Sciences and Systems Biology, University of Torino, Italy
