Je présenterai dans cet exposé nos travaux sur la reconstruction du passé biologique et ses limites. Comment l’information sur les origines s’érode avec le temps, en fonction des taux de spéciation et de mutation. Pourquoi et dans quelle mesure il est plus facile de reconstruire les événements récents. Pourquoi on ne peut généralement pas prétendre reconstruire à la fois le « pattern » et le « process », ce qui est conceptuellement analogue au principe d’incertitude d’Heisenberg en physique. Je montrerai finalement des exemples de reconstruction ancestrale sur les virus, le VIH en particulier.
Références :
A Darwinian Uncertainty Principle, Syst Biol 2020,
https://doi.org/10.1093/sysbio/syz054
A Fast Likelihood Method to Reconstruct and Visualize Ancestral Scenarios, MBE 2019,
https://doi.org/10.1093/molbev/msz131
