Résumé :
La très petite faune des récifs coralliens est peu connue mais est cependant un indicateur précieux de la biodiversité et de sa dynamique. Ma thèse s'attache à explorer cette diversité dans les Mascareignes à travers des approches de métabarcoding et de barcoding moléculaire sur des structures artificielles standardisées, les ARMS (Autonomous Reef Monitoring Structures). Pour le métabarcoding, les biais d'amplification, de séquençage, mais également les méthodes d'assemblage, de clustering, et d'assignation montrent une très importante influence sur les résultats. Très peu de séquences sont finalement assignées, et la spécificité de la faune marine à La Réunion et Rodrigues nécessite la mise en place d'un référentiel barcode pour une meilleure interprétation des résultats du métabarcoding.
Je peux répondre à vos question à l'adresse : marion.couedel@univ-reunion.fr
