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Nous avons le plaisir de vous inviter à la soutenance de la thèse d’Hugo Bonnefous, intitulée :

« Etude de l’évolution des interactions moléculaires chez les Eucaryotes par des méthodes de comparaison de réseaux dans le but d’identifier des processus ancestraux partagés associés au vieillissement. »

Cette thèse s’est déroulée principalement au MNHN dans l’UMR ISYEB, puis dans l’UMR CQSB de Sorbonne-Université.

 

La soutenance se déroulera en anglais et aura lieu le mardi 11 mars 2025 à 13h30 à Sorbonne Université, Campus Jussieu, Bâtiment C, Pièce C404, devant un jury composé de :

- M. BAPTESTE Eric (Directeur de recherche, Sorbonne Université SIM)           Direction de thèse

- M. LEMAITRE Jean-François (Directeur de recherche, Université Lyon 1)           Rapporteur

- Mme TOUZET Hélène (Directrice de recherche, Université de Lille)                    Rapporteur

- Mme DAGAN Tal (Professor, Christian-Albrechts University of Kiel)                    Examinateur

- Mme O’CONNELL Mary (Professor, University of Nottingham)                             Examinateur

- M. LECLERE Lucas (Chargé de recherche, Sorbonne Université)                         Examinateur

- M. LAPOINTE François-Joseph (Professeur, Université de Montréal)                 CoDirection de thèse

 

Vous pourrez assister à la soutenance à distance grâce au lien suivant :

https://zoom.us/j/93409812603?pwd=KEkiQ27HtnQafFXBRJJrhC1CUgrRzJ.1

ID de réunion: 934 0981 2603

Code secret: 757499

 

Eric Bapteste & François-Joseph Lapointe

Résumé de la thèse:

Chez les Eucaryotes, et plus particulièrement chez les Opisthocontes, le vieillissement est associé au déclin fonctionnel de nombreux systèmes physiologiques, à une baisse de la fertilité, à une susceptibilité accrue au développement de certaines pathologies chroniques, et à une probabilité plus élevée de mortalité avec l’âge. Les recherches en génétique du vieillissement ont révélé l’existence de réseaux d’interaction impliquant de nombreuses voies de signalisation et de nombreuses protéines, ce qui fait du vieillissement un processus multifactoriel complexe. Pour espérer en proposer une vision intégrée, il est donc aujourd’hui nécessaire de s’appuyer sur des approches intégratives, fondées sur la biologie des systèmes et l’étude des réseaux d’interaction (incluant les réseaux de coexpression génique, les réseaux de régulation génique et les réseaux d’interaction protéine-protéine). Bien que l’étude de tels réseaux d’interaction soit commune en biologie, celle-ci n’a que rarement été menée dans une perspective évolutive visant à comprendre l’origine des processus, et en particulier l’origine des interactions associées au vieillissement. L’objectif de ce projet de thèse est d’analyser la topologie et l’évolution de ces réseaux d’interaction au sein de la lignée des Eucaryotes, de manière à retracer la chronologie de mise en place des processus cellulaires sous-jacents au vieillissement depuis près de deux milliards d’années. Des approches bioinformatiques de comparaison et d’analyse de réseaux seront combinées pour inférer les réseaux d’interaction ancestraux des grands groupes eucaryotes et expliciter leur évolution, ce qui permettra de reconstituer l’histoire et l’origine évolutive des nombreux processus cellulaires qui sous-tendent le vieillissement chez les organismes eucaryotes.

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  • English version

We are pleased to invite you to Hugo Bonnefous’s thesis defence entitled: 

Study of the evolution of molecular interactions in eukaryotes using network comparison methods to identify shared ancestral processes associated with aging.

This thesis was mainly carried out at the UMR ISYEB (MNHN), then at the UMR CQSB at Sorbonne-Université.

The defence will be in English and will take place on Tuesday, March 11th at 1:30 pm in Sorbonne Université, Jussieu Campus, C Building, Room C404, in front of the following jury:

 

 - M. BAPTESTE Eric (Research Director, Sorbonne Université SIM)                   Supervision

- M. LEMAITRE Jean-François (Research Director, Université Lyon 1)                Referee

- Mme TOUZET Hélène (Research Director, Université de Lille)                           Referee

- Mme DAGAN Tal (Professor, Christian-Albrechts University of Kiel)                  Examiner

- Mme O’CONNELL Mary (Professor, University of Nottingham)                          Examiner

- M. LECLERE Lucas (Researcher, Sorbonne Université)                                       Examiner

- M. LAPOINTE François-Joseph (Professor, Université de Montréal)                Cosupervisor

 

You can follow the thesis defence online with this following link:

https://zoom.us/j/93409812603?pwd=KEkiQ27HtnQafFXBRJJrhC1CUgrRzJ.1

ID de réunion: 934 0981 2603

Secrete code: 757499

 

Eric Bapteste & François-Joseph Lapointe

 

Summary:

In Eukaryotes, and more particularly in Opisthokonta, ageing is linked to functional decline of numerous physiological systems, decreased fertility, increased susceptibility to chronic diseases, and a higher probability of mortality with age. Research in the genetics of ageing has revealed the existence of interaction networks involving numerous signaling pathways and proteins, making aging a complex multifactorial process. In order to reach an integrated vision, it is therefore necessary to rely on integrative approaches, based on systems biology and the study of interaction networks (including gene coexpression networks, gene regulation networks and protein-protein interaction networks). Although the study of such interaction networks is common in biology, it has rarely been conducted from an evolutionary perspective to understand the origin of processes, and in particular the origin of interactions associated with ageing. The objective of this PhD project is to analyze the topology and evolution of these interaction networks within the eukaryotic lineage, in order to trace the chronology of the establishment of cellular processes underlying ageing for nearly two billion years. Bioinformatics approaches of comparison and network analysis will be combined to infer the ancestral interaction networks of the major eukaryotic groups, thus reconstructing the history and evolutionary origin of the many cellular processes underlying ageing in eukaryotic organisms.


 

 

 

Publié le : 05/03/2025 08:25 - Mis à jour le : 05/03/2025 08:45

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