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Voir le podcast du séminaire de Charles Bachy, GEOMAR "Co-occurrence spatiale des virus marins et de leurs hôtes"
Les algues vertes appartenant aux prasinophytes sont très répandues dans les écosystèmes marins. Parmi elles, le picoeucaryote marin Bathycoccus prasinos a été considéré comme une algue cosmopolite avec les études environnementales de métabarcoding (basées sur le marqueur moléculaire ARNr 18S), mais des études plus récentes basées sur le génome complet indiquent l'existence de deux écotypes, le clade BI (B. prasinos) et le clade BII. Les virus qui infectent B. prasinos sont connus (BpVs), mais pas ceux qui infectent les représentants du clade BII. Nous avons isolé trois prasinovirus dsDNA de la mer des Sargasses dans la gyre Atlantique Nord avec la souche RCC716 du Clade BII. Au cours de ce séminaire, je montrerai comment nous avons décrit de manière complète ces souches virales à l’aide de données phylogénétiques, génomiques, phénotypiques et écologiques afin d’étudier leur parenté avec les virus déjà connus, mais également pour souligner leur particularité. Les analyses du métagénome à l’échelle des océans du globe montrent que les abondances relatives des algues des clades BI et BII présentent une corrélation positive avec leurs virus respectifs. Cette biogéographie étroitement liée des clades d'hôtes et de virus de Bathycoccus observée soutient la spécificité de l'hôte au niveau de l'espèce, avec des variations des paramètres d'infection au niveau de la souche. En conséquence, avec l'appui du diagnostic moléculaire, nous avons nommé le clade BII Bathycoccus calidus sp. nov. et proposons que la diversité moléculaire au sein de cette nouvelle espèce soit liée en partie à la dynamique hôte-virus différenciée observée dans nos expériences.
