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Les tutelles MNHN-CNRS-SU-EPHE-UA

L’Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité est une unité CNRS du Muséum national d’Histoire naturelle de Paris, ayant aussi pour tutelles l’Université Pierre et Marie Curie et l’Ecole Pratique des Hautes Etudes.

L’UMR 7205 a pour objectif de répondre aux questions concernant l’origine de la biodiversité, les modalités de diversification des espèces, la mise en place des communautés animales en lien avec l’évolution spatio-temporelle des taxons. L’unité est un des pôles européens de systématique et contribue de manière importante à la taxonomie et à la biologie de l’évolution. Les approches de systématique phylogénétique privilégiées par l’unité sont intégratives et ont amené la conception d’outils taxonomiques, moléculaires, génétiques, acoustiques, cytogénétiques, morphologiques et morphométriques.

L’Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité (ISYEB) succède à l’OSEB depuis le 1er Janvier 2014. Les laboratoires de l’Institut se trouvent au Jardin des Plantes dans des bâtiments situés rue Buffon et rue Cuvier (Entomologie, Mammifères et Oiseaux, Malacologie, Botanique, Reptiles-Amphibiens, Géologie).

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L’Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité
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Voznica J., Zhukova A., Boskova V., Saulnier E., Lemoine F., Moslonka-Levebvre M. & Gascuel O., 2022 — Deep learning from phylogenies to uncover the epidemiological dynamics of outbreaks. Nature Communications , n° 3896,
https://dx.doi.org/https://doi.org/10.1038/s41467-022-31511-0
Villemereuil Pierre, Charmantier Anne, Arlt Debora, Bize Pierre, Brekke Patricia, Brouwer Lyanne, Cockburn A., Côté Steve D., Dobson F. Stephen, Evans Simon R., Festa-Bianchet Marco, Gamelon Marlène, Hamel Sandra, Hegelbach Johann, Jerstad Kurt et al., 2022 — Correction for de Villemereuil et al., Fluctuating optimum and temporally variable selection on breeding date in birds and mammals. Proceedings of the National Academy of Sciences vol. 119, n° 10,
https://dx.doi.org/https://doi.org/10.1073/pnas.2201407119
Maurel Marie-Christine, 2022 — Entre analogies et différences. En(Une)Quête d’Autres dis-semblables…. Arts et sciences vol. 6, Special, Publisher: ISTE OpenScience tex.hal_id: hal-03896281 tex.hal_version: v1
ISSN
25158767
https://dx.doi.org/10.21494/ISTE.OP.2022.0792
Merker Matthias, Rasigade Jean-Philippe, Barbier Maxime, Cox Helen, Feuerriegel Silke, Kohl Thomas A., Shitikov Egor, Klaos Kadri, Gaudin Cyril, Antoine Rudy, Diel Roland, Borrell Sonia, Gagneux Sebastien, Nikolayevskyy Vladyslav, Andres Sönke et al., 2022 — Transcontinental spread and evolution of Mycobacterium tuberculosis W148 European/Russian clade toward extensively drug resistant tuberculosis. Nature Communications vol. 13, n° 1, p. 5105
ISSN
2041-1723
https://dx.doi.org/10.1038/s41467-022-32455-1
Lesturgie Pierre, Planes Serge & Mona Stefano, 2022 — Coalescence times, life history traits and conservation concerns: An example from four coastal shark species from the IndoPacific. Molecular Ecology Resources vol. 22, n° 2, p. 554-566
ISSN
1755-098X, 1755-0998
https://dx.doi.org/10.1111/1755-0998.13487
Lesturgie Pierre, Lainé Hugo, Suwalski Arnaud, Chifflet-Belle Pascaline, Maisano Delser Pierpaolo, Clua Eric, Jaquemet Sébastien, Magalon Hélène & Mona Stefano, 2022 — Ecological and biogeographic features shaped the complex evolutionary history of an iconic apex predator (Galeocerdo cuvier). Abstract Background The tiger shark ( Galeocerdo cuvier ) is a large iconic marine predator inhabiting worldwide tropical and… BMC Ecology and Evolution vol. 22, n° 1, p. 147
ISSN
2730-7182
https://dx.doi.org/10.1186/s12862-022-02100-y
Lesturgie Pierre, Braun Camrin, Clua Eric, Kiszka Jeremy, Mourier Johann, Thorrold Simon, Vignaud Thomas, Planes Serge & Mona Stefano, 2022 — Like a rolling stone: colonization and migration dynamics of the grey reef shark (Carcharhinus amblyrhynchos). Designing appropriate management plans requires knowledge of both the dispersal ability and what has shaped the current… Preprint , ,
https://dx.doi.org/10.22541/au.166512605.59030859/v1
Oury Nicolas, Noël Cyril, Mona Stefano, Aurelle Didier & Magalon Helene, 2022 — From Genomics to Integrative Taxonomy? The Case Study of Pocillopora Corals. Abstract With the advent of genomics, sequencing thousands of loci from hundreds of individuals now appears feasible at… bioRxiv PREPRINT , , PREPRINT
https://dx.doi.org/DOI: 10.1101/2022.10.04.510617
Maurel M.C., Menez B. & Nedelec A., 2022 — A La Recherche des Origines : Les Origines de La Vie. , , tex.hal_id: hal-03896288 tex.hal_version: v1
https://hal.science/hal-03896288
Ter-Ovanessian Louis M. P., Lambert Jean-François & Maurel Marie-Christine, 2022 — Building the uracil skeleton in primitive ponds at the origins of life: carbamoylation of aspartic acid. Abstract A large set of nucleobases and amino acids is found in meteorites, implying that several chemical reservoirs are… Scientific Reports vol. 12, n° 1, p. 19178
ISSN
2045-2322
https://dx.doi.org/10.1038/s41598-022-21272-7
Voznica J., Zhukova A., Boskova V., Saulnier E., Lemoine F., Moslonka-Lefebvre M. & Gascuel O., décembre 2022 — Deep learning from phylogenies to uncover the epidemiological dynamics of outbreaks. Nature Communications vol. 13, n° 1, p. 3896
ISSN
2041-1723
https://dx.doi.org/10.1038/s41467-022-31511-0
Seabra Sofia G, Libin Pieter J K, Theys Kristof, Zhukova Anna, Potter Barney I, Nebenzahl-Guimaraes Hanna, Gorbalenya Alexander E, Sidorov Igor A, Pimentel Victor, Pingarilho Marta, de Vasconcelos Ana T R, Dellicour Simon, Khouri Ricardo, Gascuel Olivier, Vandamme Anne-Mieke et al., 2022 — Genome-wide diversity of Zika virus: Exploring spatio-temporal dynamics to guide a new nomenclature proposal. Virus Evolution vol. 8, n° 1, veac029
ISSN
2057-1577
https://dx.doi.org/10.1093/ve/veac029
Zhu Feng, Duong Veasna, Lim Xiao Fang, Hul Vibol, Chawla Tanu, Keatts Lucy, Goldstein Tracey, Hassanin Alexandre, Tu Vuong Tan, Buchy Philippe, Sessions October M., Wang Lin-Fa, Dussart Philippe & Anderson Danielle E., 2022 — Presence of Recombinant Bat Coronavirus GCCDC1 in Cambodian Bats. Viruses vol. 14, n° 2, p. 176
ISSN
1999-4915
https://dx.doi.org/10.3390/v14020176
Sassi Mohamed, Bronsard Julie, Pascreau Gaetan, Emily Mathieu, Donnio Pierre-Yves, Revest Matthieu, Felden Brice, Wirth Thierry & Augagneur Yoann, 2022 — Forecasting Staphylococcus aureus Infections Using Genome-Wide Association Studies, Machine Learning, and Transcriptomic Approaches. mSystems , , e00378–22
ISSN
2379-5077
https://dx.doi.org/10.1128/msystems.00378-22
Seo Tae-Kun, Gascuel Olivier & Thorne Jeffrey L, 2022 — Measuring Phylogenetic Information of Incomplete Sequence Data. Abstract Widely used approaches for extracting phylogenetic information from aligned sets of molecular sequences rely upon… Systematic Biology vol. 71, n° 3, p. 630-648
ISSN
1063-5157, 1076-836X
https://dx.doi.org/10.1093/sysbio/syab073
Porrelli Stefano, Gerbault-Seureau Michele, Rozzi Roberto, Chikhi Rayan, Curaudeau Manon, Ropiquet Anne & Hassanin Alexandre, 2022 — Draft genome of the lowland anoa (Bubalus depressicornis) and comparison with buffalo genome assemblies (Bovidae, Bubalina). G3-GENES GENOMES GENETICS vol. 12, n° 11, tex.earlyaccessdate: SEP 2022 tex.orcid-numbers: Ropiquet, Anne/0000-0003-3755-5467 Hassanin, Alexandre/0000-0002-4905-8540 Curaudeau, Manon/0000-0003-3356-0701 Porrelli, Stefano/0000-0003-3878-7745 tex.researcherid-numbers: Ropiquet, Anne/E-6154-2011 Has
ISSN
2160-1836
https://dx.doi.org/10.1093/g3journal/jkac234
Sabroux Romain, Hassanin Alexandre & Corbari Laure, 2022 — Sea spiders (Arthropoda: Pycnogonida) collected during the Madibenthos Expedition from Martinique shallow waters. This study presents the inventory of sea spiders (Pycnogonida) sampled during the Madibenthos Expedition in Martinique (West… European Journal of Taxonomy vol. 851, , p. 1-141 Publisher: Muséum National d’Histoire Naturelle (MNHN) tex.hal_id: hal-03957149 tex.hal_version: v1
ISSN
2118-9773
https://dx.doi.org/10.5852/ejt.2022.851.1999
Kawamura Kunio, Ogawa Mari, Konagaya Noriko, Maruoka Yoshimi, Lambert Jean-François, Ter-Ovanessian Louis M. P., Vergne Jacques, Hervé Guy & Maurel Marie-Christine, 2022 — A High-Pressure, High-Temperature Flow Reactor Simulating the Hadean Earth Environment, with Application to the Pressure Dependence of the Cleavage of Avocado Viroid Hammerhead Ribozyme. Life (Chicago, Ill. : 1978) vol. 12, n° 8,
ISSN
2075-1729
https://dx.doi.org/10.3390/life12081224
Dreyer Viola, Mandal Ayan, Dev Prachi, Merker Matthias, Barilar Ivan, Utpatel Christian, Nilgiriwala Kayzad, Rodrigues Camilla, Crook Derrick W., the CRyPTIC Consortium and Crook Derrick W., Peto Timothy E. A., Walker A. Sarah, Hoosdally Sarah J., Gibertoni Cruz Ana L., Carter Joshua et al., 2022 — High fluoroquinolone resistance proportions among multidrug-resistant tuberculosis driven by dominant L2 Mycobacterium tuberculosis clones in the Mumbai Metropolitan Region. Genome Medicine vol. 14, n° 1, p. 95
ISSN
1756-994X
https://dx.doi.org/10.1186/s13073-022-01076-0
Hassanin Alexandre, 2022 — Variation in synonymous nucleotide composition among genomes of sarbecoviruses and consequences for the origin of COVID-19. Gene vol. 835, , p. 146641
ISSN
03781119
https://dx.doi.org/10.1016/j.gene.2022.146641
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Catégories

Catégorie

Par auteurs

  • Didier AURELLE
  • Pascaline CHIFFLET-BELLE
  • Laure CORBARI
  • Pierre de VILLEMEREUIL
  • Olivier GASCUEL
  • GERBAULT-SEUREAU Michèle
  • Alexandre HASSANIN
  • Marie-Christine MAUREL
  • Stefano MONA
  • Stefan NIEMANN
  • Thierry WIRTH

Année

  • (-) 2022

Entité de rattachement

  • Exploration, Espèces et Evolution (3E)
  • (-) Phylogénomique, phylodynamique et interactions hôtes-pathogènes (PhyloPath)
  • Systématique, Phylogéographie, Évolution, Conservation (SPEC)

Organisme de rattachement

  • CNRS
  • EPHE-PSL
  • MNHN
  • Sorbonne Université

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