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Les tutelles MNHN-CNRS-SU-EPHE-UA

L’Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité est une unité CNRS du Muséum national d’Histoire naturelle de Paris, ayant aussi pour tutelles l’Université Pierre et Marie Curie et l’Ecole Pratique des Hautes Etudes.

L’UMR 7205 a pour objectif de répondre aux questions concernant l’origine de la biodiversité, les modalités de diversification des espèces, la mise en place des communautés animales en lien avec l’évolution spatio-temporelle des taxons. L’unité est un des pôles européens de systématique et contribue de manière importante à la taxonomie et à la biologie de l’évolution. Les approches de systématique phylogénétique privilégiées par l’unité sont intégratives et ont amené la conception d’outils taxonomiques, moléculaires, génétiques, acoustiques, cytogénétiques, morphologiques et morphométriques.

L’Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité (ISYEB) succède à l’OSEB depuis le 1er Janvier 2014. Les laboratoires de l’Institut se trouvent au Jardin des Plantes dans des bâtiments situés rue Buffon et rue Cuvier (Entomologie, Mammifères et Oiseaux, Malacologie, Botanique, Reptiles-Amphibiens, Géologie).

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L’Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité
UMR 7205

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Bonnefous H., Teulière J., Lapointe F.J., Lopez P. & Bapteste E., 2024 — Most genetic roots of fungal and animal aging are hundreds of millions of years old according to phylostratigraphy analyses of aging networks.. GeroScience , ,
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https://dx.doi.org/10.12705/665.4
Bridel Sébastien, Olsen Anne-Berit, Nilsen Hanne, Bernardet Jean-François, Achaz Guillaume, Avendaño-Herrera Ruben & Duchaud Eric, 2018 — Comparative Genomics of Tenacibaculum dicentrarchi and "Tenacibaculum finnmarkense" Highlights Intricate Evolution of Fish-Pathogenic Species. Genome biology and evolution vol. 10, n° 2, p. 452-457
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Rochat T., Pérez-Pascual D., Nilsen H., Carpentier M., Bridel S., Bernardet J.-F. & Duchaud E., 2019 — Identification of a novel elastin-degrading enzyme from the fish pathogen Flavobacterium psychrophilum. Applied and Environmental Microbiology , ,
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https://dx.doi.org/10.1128/AEM.02535-18
Vences Miguel, Miralles Aurélien, Brouillet Sophie, Ducasse Jacques, Fedosov Alexander, Kharchev Vladimir, Kostadinov Ivaylo, Kumari Sangeeta, Patmanidis Stefanos, Scherz Mark, Puillandre Nicolas & Renner Susanne, juillet 2021 — iTaxoTools 0.1: Kickstarting a specimen-based software toolkit for taxonomists. While powerful and user-friendly software suites exist for phylogenetics, and an impressive cybertaxomic infrastructure of… Megataxa vol. 6, n° 2, p. 77-92 ISBN: 2703-3082 Publisher: Magnolia Press Type: 10.11646/MEGATAXA.6.2.1
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https://dx.doi.org/10.11646/megataxa.6.2.1
Miralles Aurelien, Ducasse Jacques, Brouillet Sophie, Flouri Tomas, Fujisawa Tomochika, Kapli Paschalia, Knowles L. Lacey, Kumari Sangeeta, Stamatakis Alexandros, Sukumaran Jeet, Lutteropp Sarah, Vences Miguel & Puillandre Nicolas, 2022 — SPART : A versatile and standardized data exchange format for species partition information. Molecular Ecology Resources vol. 22, n° 1, p. 430-438
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1755-098X
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Vences Miguel, Miralles Aurélien, Brouillet Sophie, Ducasse Jacques, Fedosov Alexander, Kharchev Vladimir, Kostadinov Ivaylo, Kumari Sangeeta, Patmanidis Stefanos, Scherz Mark, Puillandre Nicolas & Renner Susanne, 2021 — iTaxoTools 0.1: Kickstarting a specimen-based software toolkit for taxonomists. While powerful and user-friendly software suites exist for phylogenetics, and an impressive cybertaxomic infrastructure of… Megataxa vol. 6, n° 2, p. 77-92 ISBN: 2703-3082 Publisher: Magnolia Press Type: 10.11646/MEGATAXA.6.2.1
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03321424
Teulière J, Bernard C, Bonnefous H, Martens J, Lopez P & Bapteste E, 2023 — Interactomics: dozens of viruses, co-evolving with humans, including the influenza A virus, may actively distort human ageing. Abstract Some viruses (e.g. HIV-1, SARS-CoV-2) have been experimentally proposed to accelerate features of human ageing and of… MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION vol. 40, n° 2, msad012
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https://dx.doi.org/10.1093/molbev/msad012
Rizos Iris, Debeljak Pavla, Finet Thomas, Klein Dylan, Ayata Sakina-Dorothée, Not Fabrice & Bittner Lucie, 2023 — Beyond the limits of the unassigned protist microbiome: inferring large-scale spatio-temporal patterns of Syndiniales marine parasites. Abstract Marine protists are major components of the oceanic microbiome that remain largely unrepresented in culture… ISME Communications vol. 3, n° 1, p. 16
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2730-6151
https://dx.doi.org/10.1038/s43705-022-00203-7
Denoeud France, Godfroy Olivier, Cruaud Corinne, Heesch Svenja, Nehr Zofia, Tadrent Nachida, Couloux Arnaud, Brillet-Guéguen Loraine, Delage Ludovic, Mckeown Dean, Motomura Taizo, Sussfeld Duncan, Fan Xiao, Mazéas Lisa, Terrapon Nicolas et al., 2024 — Evolutionary genomics of the emergence of brown algae as key components of coastal ecosystems. Cell vol. 187, n° 24, 6943–6965.e39
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https://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2024.10.049
Graziosi Simone, Deloche Lara, Januario Mélanie, Selosse Marc-André, Deveau Aurélie, Bach Cyrille, Chen Zhixiao, Murat Claude, Iotti Mirco, Rech Philippe & Zambonelli Alessandra, mai 2025 — Newly Designed Fluorescence In Situ Hybridization Probes Reveal Previously Unknown Endophytic Abilities of Tuber magnatum in Herbaceous Plants. Microbial Ecology vol. 88, n° 1, p. 42
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https://dx.doi.org/10.1007/s00248-025-02542-z
Puillandre Nicolas, Miralles Aurélien, Brouillet Sophie, Fedosov Alexander, Fischell Frank, Patmanidis Stefanos & Vences Miguel, 2024 — « Species Delimitation and Exploration of Species Partitions with ASAP and LIMES » in DNA Barcoding.. vol. 2744, , p. 313-334 Series Title: Methods in Molecular Biology
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https://dx.doi.org/10.1007/978-1-0716-3581-0_20
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https://dx.doi.org/10.5121/csit.2024.140605
Nainia Ayoub, Vignes-Lebbe Régine, Chenin Eric, Sahraoui Maya, Mousannif Hajar & Zahir Jihad, août 2024 — FloraNER: A new dataset for species and morphological terms named entity recognition in French botanical text. FloraNER is a distantly supervised named entity recognition dataset (NER). The dataset is built from botanical French… Data in Brief vol. 56, , p. 110824 ISBN: 2352-3409 Publisher: Elsevier Type: 10.1016/j.dib.2024.110824
https://hal.science/hal-04692857
Zhao Yanan, Boucheron-Dubuisson Elodie, Rouhan Germinal, Iwatsuki Kunio, Ebihara Atsushi, Hennequin Sabine & Dubuisson Jean-Yves, 2024 — Updated diversity and taxonomy of the fern genus Abrodictyum C. Presl (Hymenophyllaceae, Polypodiidae) in Asia, Australasia and Oceania. Botany Letters , , p. 1-24 ISBN: 2381-8107 Publisher: Taylor & Francis Type: 10.1080/23818107.2024.2417245
https://mnhn.hal.science/mnhn-04806966
Dubuisson Jean-yves, Nivart Adèle, Bidault Ehoarn, Droissart Vincent, Deblauwe Vincent, Guy Kamdem Narcisse, Rouhan Germinal, Ebihara Atsushi & Le Péchon Timothée, février 2024 — Diversity, taxonomy, and history of the tropical fern genus Didymoglossum Desv. (Hymenophyllaceae, Polypodiidae) in Africa. Journal of Systematics and Evolution vol. 62, n° 1, p. 84-101 tex.hal_id: mnhn-04082532 tex.hal_local_reference: SYSTE tex.hal_version: v1
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https://dx.doi.org/10.1111/jse.12951
Deroin Thierry, Dejonghe Quentin & Le Disquet Isabel, 2024 — The Raymond Benoist microslide library of woods of French Guiana at the Herbarium of Paris (P): restoration and comments. Adansonia - Publications scientifiques du Muséum vol. 46, n° 9, p. 79-87
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Denoeud France, Godfroy Olivier, Cruaud Corinne, Heesch Svenja, Nehr Zofia, Tadrent Nachida, Couloux Arnaud, Brillet-Guéguen Loraine, Delage Ludovic, Mckeown Dean, Motomura Taizo, Sussfeld Duncan, Fan Xiao, Mazéas Lisa, Terrapon Nicolas et al., 2024 — Evolutionary genomics of the emergence of brown algae as key components of coastal ecosystems. Brown seaweeds are keystone species of coastal ecosystems, often forming extensive underwater forests, and are under… Cell , , ISBN: 0092-8674 Publisher: Elsevier Type: 10.1016/j.cell.2024.10.049
https://hal.science/hal-04794231
Boucheron-Dubuisson Elodie, Zhao Yanan, Rouhan Germinal, Ebihara Atsushi, Iwatsuki Kunio, Darnaedi Dedy & Dubuisson Jean-Yves, janvier 2024 — The first record of Trichomanes s.s. (Hymenophyllaceae) in Asia and establishment of the new subgenus Asiatrichomanes. Phytotaxa vol. 633, n° 3, p. 215-229 Publisher: Magnolia Press tex.hal_id: hal-04445213 tex.hal_version: v1
ISSN
1179-3155
https://dx.doi.org/10.11646/phytotaxa.633.3.2
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  • 172
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  • Atelier de bio-informatique (ABI)
  • Exploration, Espèces et Evolution (3E)
  • Homologies
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  • Laboratoire informatique et Systématique (LIS-C)
  • Morpho-Anatomie et Développement des Plantes (MADP)

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