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Les tutelles MNHN-CNRS-SU-EPHE-UA

L’Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité est une unité CNRS du Muséum national d’Histoire naturelle de Paris, ayant aussi pour tutelles l’Université Pierre et Marie Curie et l’Ecole Pratique des Hautes Etudes.

L’UMR 7205 a pour objectif de répondre aux questions concernant l’origine de la biodiversité, les modalités de diversification des espèces, la mise en place des communautés animales en lien avec l’évolution spatio-temporelle des taxons. L’unité est un des pôles européens de systématique et contribue de manière importante à la taxonomie et à la biologie de l’évolution. Les approches de systématique phylogénétique privilégiées par l’unité sont intégratives et ont amené la conception d’outils taxonomiques, moléculaires, génétiques, acoustiques, cytogénétiques, morphologiques et morphométriques.

L’Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité (ISYEB) succède à l’OSEB depuis le 1er Janvier 2014. Les laboratoires de l’Institut se trouvent au Jardin des Plantes dans des bâtiments situés rue Buffon et rue Cuvier (Entomologie, Mammifères et Oiseaux, Malacologie, Botanique, Reptiles-Amphibiens, Géologie).

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L’Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité
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Olivier Gascuel
Olivier GASCUEL
Directeur de Recherche émérite
olivier.gascuel [at] mnhn.fr
Phylogénomique, phylodynamique et interactions hôtes-pathogènes (PhyloPath)
Rice Gavin, David Jean, Kamimura Yoshitaka, Masly John, Mcgregor Alistair, Nagy Olga, Noselli Stéphane, Nunes Maria Daniela Santos, O’grady Patrick, Sánchez-Herrero Ernesto, Siegal Mark, Toda Masanori, Rebeiz Mark, Courtier-Orgogozo Virginie & Yassin Amir, août 2019 — A standardized nomenclature and atlas of the male terminalia of Drosophila melanogaster. Animal terminalia represent some of the most diverse and rapidly evolving structures in the animal kingdom, and for this reason… Fly vol. 13, 1-4, p. 1-14
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02338294
Bryant David & Gascuel Olivier, janvier 2017 — Special Issue: Mathematical and Computational Evolutionary Biology-2015. Systematic Biology vol. 66, n° 1, p. 1-2
ISSN
1063-5157
https://dx.doi.org/10.1093/sysbio/syw111
Xie Ruopeng, Adam Dillon, Hu Shu, Cowling Benjamin, Gascuel Olivier, Zhukova Anna & Dhanasekaran Vijaykrishna, juillet 2024 — Deep learning of SARS-CoV-2 outbreak phylodynamics with contact tracing data. Deep learning has emerged as a powerful tool for phylodynamic analysis, addressing common computational limitations affecting… , , Type: 10.1101/2024.06.10.24308687
https://pasteur.hal.science/pasteur-04638422
Maurel M.C. & Grandcolas Philippe, 2018 — Biodiversity and Evolution. , , dir. ISTE Publishing
ISBN
978-1-78548-277-9
http://www.iste.co.uk/book.php?id=1309
Gibert P., Hill M., Pascual M., Plantamp C., Terblanche J. S., Yassin A. & Sgro C. M., avril 2016 — Drosophila as models to understand the adaptive process during invasion. Biological Invasions vol. 18, n° 4, p. 1089-1103
ISSN
1387-3547
https://dx.doi.org/10.1007/s10530-016-1087-4
David Jean R, Yassin Amir, Gidaszewski Nelly & Debat Vincent, 2014 — Drosophilids (Diptera) from Mayotte island: an annotated list of species collected in 2013 and comments on the colonisation of Indian Ocean Islands. Annales de la Société Entomologique de France (NS) vol. 50, , p. 336-342
ISSN
0037-9271
Yassin Amir, Debat Vincent, Bastide Héloïse, Gidaszewski Nelly, David Jean R. & Pool John E., 2016 — Recurrent specialization on a toxic fruit in an island Drosophila population. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America vol. 113, n° 17, p. 4771-4776
ISSN
0027-8424, 1091-6490
https://dx.doi.org/10.1073/pnas.1522559113
Yassin Amir, Bastide Héloïse, Chung Henry, Veuille Michel, David Jean R. & Pool John E., 2016 — Ancient balancing selection at tan underlies female colour dimorphism in Drosophila erecta. Nature Communications vol. 7, , p. 10400
ISSN
2041-1723
https://dx.doi.org/10.1038/ncomms10400
Grandcolas Philippe, Nattier Romain & Trewick Steve, 2014 — Relict species: a relict concept?. Trends in Ecology & Evolution vol. 29, n° 12, p. 655-663
ISSN
01695347
https://dx.doi.org/http://dx.doi.org/10.1016/j.tree.2014.10.002
Nattier Romain, Grandcolas Philippe, Pellens Roseli, Jourdan Hervé, Couloux Arnaud, Poulain Simon & Robillard Tony, 2013 — Climate and Soil Type Together Explain the Distribution of Microendemic Species in a Biodiversity Hotspot. PLoS One vol. 8, n° 12, e80811
ISSN
1932-6203
https://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0080811
Yassin Amir, 2017 — Drosophila yakuba mayottensis, a new model for the study of incipient ecological speciation. FLY vol. 11, n° 1, p. 37-45
ISSN
1933-6934
https://dx.doi.org/10.1080/19336934.2016.1221550
Grandcolas P., Nattier R., Pellens R. & Legendre F., 2014 — « Diversity and Distribution of the Genus Rothisilpha (Dictyoptera, Blattidae) in New Caledonia : Evidence from New Microendemic Species » in Zoologia Neocaledonica. 8. Biodiversity Studies in New Caledonia. Mémoires Du Muséum National d’Histoire Naturelle Vol. 206.. vol. 206, , p. 301-310
ISBN
978-2-85653-707-7
Grandcolas P, Nattier R., Legendre F. & Pellens R., 2010 — Mapping extrinsic traits such as extinction risks or modelled bioclimatic niches on phylogenies: does it make sense at all?. Cladistics vol. 26, , p. 1-5
Yassin Amir, Suwalski Arnaud & Raveloson Ravaomanarivo Lala, juin 2019 — Resolving the synonymy and polyphyly of the ‘Drosophila bakoue species complex’ (Diptera: Drosophilidae: ‘D. montium species group’) with descriptions of two new species from Madagascar. European Journal of Taxonomy vol. 532, n° 532, p. 1-26 ISBN: 2118-9773 Publisher: Consortium of European Natural History Museums Type: 10.5852/ejt.2019.532
ISSN
2118-9773
https://dx.doi.org/10.5852/ejt.2019.532
Voznica J., Zhukova A., Boskova V., Saulnier E., Lemoine F., Moslonka-Levebvre M. & Gascuel O., 2022 — Deep learning from phylogenies to uncover the epidemiological dynamics of outbreaks. Nature Communications , n° 3896,
https://dx.doi.org/https://doi.org/10.1038/s41467-022-31511-0
Nattier Romain, Pellens Roseli, Robillard Tony, Jourdan Hervé, Legendre Frederic, Caesar Maram, Nel Andre & Grandcolas Philippe, 2017 — Updating the Phylogenetic Dating of New Caledonian Biodiversity with a Meta-analysis of the Available Evidence. Scientific Reports vol. 7, n° 1, p. 3705
ISSN
2045-2322
https://dx.doi.org/10.1038/s41598-017-02964-x
Maurel M. C. & Grandcolas P., 2015 — « The quest for the origins in evolutionary biology » in Origins – Studies in Biological and Cultural Evolution. Workshops "Origins".. , , dir. BIO Web of Conferences, volume 4, EDP Sciences, www.bio-conferences.org 0001–p 1–5
Maurel M.C. & Grandcolas Philippe, 2015 — The quest for the origins in evolutionary biology. BIO web of conferences vol. 4, , p. 00001
https://dx.doi.org/10.1051/bioconf/20150400001
Hassani I.M., Behrman E.L., Prigent S.R., Gidaszewski N., Raveloson Ravaomanarivo L.H., Suwalski A., Debat V., David J.R. & Yassin A., 2020 — First occurrence of the pest Drosophila suzukii (Diptera: Drosophilidae) in the Comoros Archipelago (Western Indian Ocean). African Entomology vol. 28, n° 1, p. 78-83
https://dx.doi.org/10.4001/003.028.0078
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  • Didier AURELLE
  • Vincent DEBAT
  • Olivier GASCUEL
  • GERBAULT-SEUREAU Michèle
  • Philippe GRANDCOLAS
  • Alexandre HASSANIN
  • Frédéric LEGENDRE
  • Marie-Christine MAUREL
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  • Evolution fonctionnelle et Taxonomie (EvoFoncT)
  • Exploration, Espèces et Evolution (3E)
  • Interactions et Evolution Végétale et Fongique (INEVEF)
  • (-) Phylogénomique, phylodynamique et interactions hôtes-pathogènes (PhyloPath)
  • Systématique, Phylogéographie, Évolution, Conservation (SPEC)

Organisme de rattachement

  • EPHE-PSL
  • MNHN
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