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Les tutelles MNHN-CNRS-SU-EPHE-UA

L’Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité est une unité CNRS du Muséum national d’Histoire naturelle de Paris, ayant aussi pour tutelles l’Université Pierre et Marie Curie et l’Ecole Pratique des Hautes Etudes.

L’UMR 7205 a pour objectif de répondre aux questions concernant l’origine de la biodiversité, les modalités de diversification des espèces, la mise en place des communautés animales en lien avec l’évolution spatio-temporelle des taxons. L’unité est un des pôles européens de systématique et contribue de manière importante à la taxonomie et à la biologie de l’évolution. Les approches de systématique phylogénétique privilégiées par l’unité sont intégratives et ont amené la conception d’outils taxonomiques, moléculaires, génétiques, acoustiques, cytogénétiques, morphologiques et morphométriques.

L’Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité (ISYEB) succède à l’OSEB depuis le 1er Janvier 2014. Les laboratoires de l’Institut se trouvent au Jardin des Plantes dans des bâtiments situés rue Buffon et rue Cuvier (Entomologie, Mammifères et Oiseaux, Malacologie, Botanique, Reptiles-Amphibiens, Géologie).

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L’Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité
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Clio MARIDAKIS
Doctorant(e)
clio.maridakis [at] mnhn.fr
Exploration, Espèces et Evolution (3E)
Aurore AYMERIE DIT EYMERIC
Doctorant(e)
aurore.aymerie-dit-eymeric [at] mnhn.fr
Exploration, Espèces et Evolution (3E)
Eugénie KRECKELBERGH
Ingénieur(e) d'Etudes
eugenie.kreckelbergh [at] mnhn.fr
Exploration, Espèces et Evolution (3E)
Soukaina KAIDI
Post-doctorant(e)
Exploration, Espèces et Evolution (3E)
Allan RINGEVAL
Doctorant(e)
allan.ringeval [at] mnhn.fr
Exploration, Espèces et Evolution (3E)
Dero WANG
Doctorant(e)
dero.wang [at] mnhn.fr
Exploration, Espèces et Evolution (3E)
Soldano Henry, Santini Guillaume, Bouthinon Dominique, Bary Sophie & Lazega Emmanuel, 2018 — « Bi-Pattern Mining of Two Mode and Directed Networks » in WWW (Companion Volume).. , , p. 1287-1294
Soldano Henry, Bary Sophie, Santini Guillaume & Bouthinon Dominique, 2018 — « Core Stratification of Two-Mode Networks » in Complex networks (1).. vol. 812, , p. 130-142
Vences Miguel, Miralles Aurélien, Brouillet Sophie, Ducasse Jacques, Fedosov Alexander, Kharchev Vladimir, Kostadinov Ivaylo, Kumari Sangeeta, Patmanidis Stefanos, Scherz Mark, Puillandre Nicolas & Renner Susanne, juillet 2021 — iTaxoTools 0.1: Kickstarting a specimen-based software toolkit for taxonomists. While powerful and user-friendly software suites exist for phylogenetics, and an impressive cybertaxomic infrastructure of… Megataxa vol. 6, n° 2, p. 77-92 ISBN: 2703-3082 Publisher: Magnolia Press Type: 10.11646/MEGATAXA.6.2.1
ISSN
2703-3090, 2703-3082
https://dx.doi.org/10.11646/megataxa.6.2.1
Miralles Aurelien, Ducasse Jacques, Brouillet Sophie, Flouri Tomas, Fujisawa Tomochika, Kapli Paschalia, Knowles L. Lacey, Kumari Sangeeta, Stamatakis Alexandros, Sukumaran Jeet, Lutteropp Sarah, Vences Miguel & Puillandre Nicolas, 2022 — SPART : A versatile and standardized data exchange format for species partition information. Molecular Ecology Resources vol. 22, n° 1, p. 430-438
ISSN
1755-098X
https://dx.doi.org/10.1111/1755-0998.13470
Vences Miguel, Miralles Aurélien, Brouillet Sophie, Ducasse Jacques, Fedosov Alexander, Kharchev Vladimir, Kostadinov Ivaylo, Kumari Sangeeta, Patmanidis Stefanos, Scherz Mark, Puillandre Nicolas & Renner Susanne, 2021 — iTaxoTools 0.1: Kickstarting a specimen-based software toolkit for taxonomists. While powerful and user-friendly software suites exist for phylogenetics, and an impressive cybertaxomic infrastructure of… Megataxa vol. 6, n° 2, p. 77-92 ISBN: 2703-3082 Publisher: Magnolia Press Type: 10.11646/MEGATAXA.6.2.1
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03321424
Le Gall Line, Corbari Laure, Aurelle D., Bay-Nouailhat Anne, Bay-Nouailhat Wilfried, de Bettignies Thibaut, Duchaud Éric, Marani Gilberto & Bouchet Philippe, janvier 2024 — Bilan scientifiqueLA PLANÈTE REVISITÉE EN CORSE, Volet marin 2019-2021. Le projet La Planète Revisitée en Corse est mené par le Muséum national d’Histoire naturelle (MNHN), la Collectivité de Corse … , , p. 189
https://mnhn.hal.science/mnhn-04552677
Le Gall Line, Corbari Laure, Aurelle Didier, Bay-Nouailhat Anne, Bay-Nouailhat Wilfried, De Bettignies Thibaut, Duchaud Éric, Marani Gilberto & Bouchet Philippe, 2024 — A PLANÈTE REVISITÉE EN CORSE : Volet marin 2019-2021. , , p. 189
Puillandre Nicolas, Miralles Aurélien, Brouillet Sophie, Fedosov Alexander, Fischell Frank, Patmanidis Stefanos & Vences Miguel, 2024 — « Species Delimitation and Exploration of Species Partitions with ASAP and LIMES » in DNA Barcoding.. vol. 2744, , p. 313-334 Series Title: Methods in Molecular Biology
ISBN
978-1-07-163580-3 978-1-07-163581-0
https://dx.doi.org/10.1007/978-1-0716-3581-0_20
Vences Miguel, Patmanidis Stefanos, Fedosov Alexander, Miralles Aurélien & Puillandre Nicolas, 2024 — « iTaxoTools 1.0: Improved DNA Barcode Exploration with TaxI2 » in DNA Barcoding.. vol. 2744, , p. 281-296 Series Title: Methods in Molecular Biology
ISBN
978-1-07-163580-3 978-1-07-163581-0
https://dx.doi.org/10.1007/978-1-0716-3581-0_18
Ringeval Allan, Farhat Sarah, Fedosov Alexander, Gerdol Marco, Greco Samuele, Mary Lou, Modica Maria & Puillandre Nicolas, mars 2024 — DeTox: a pipeline for the detection of toxins in venomous organisms. Venomous organisms have independently evolved the ability to produce toxins 101 times during their evolutionary history,… Briefings in Bioinformatics vol. 25, n° 2, bbae094 ISBN: 1467-5463 Publisher: Oxford University Press (OUP) Type: 10.1093/bib/bbae094
ISSN
1477-4054
https://dx.doi.org/10.1093/bib/bbae094
Fedosov Alexander, Puillandre Nicolas, Fischell Frank, Patmanidis Stefanos, Miralles Aurélien & Vences Miguel, 2024 — « DNA Barcode-Based Species Diagnosis with MolD » in DNA Barcoding.. vol. 2744, , p. 297-311 Series Title: Methods in Molecular Biology
ISBN
978-1-07-163580-3 978-1-07-163581-0
https://dx.doi.org/10.1007/978-1-0716-3581-0_19
Le Gall Line, Corbari Laure, Aurelle D., Bay-Nouailhat Anne, Bay-Nouailhat Wilfried, de Bettignies Thibaut, Duchaud Éric, Marani Gilberto & Bouchet Philippe, janvier 2024 — Bilan scientifiqueLA PLANÈTE REVISITÉE EN CORSE. , , p. 189 tex.hal_id: mnhn-04552677 tex.hal_version: v1
https://mnhn.hal.science/mnhn-04552677
Denoeud France, Godfroy Olivier, Cruaud Corinne, Heesch Svenja, Nehr Zofia, Tadrent Nachida, Couloux Arnaud, Brillet-Guéguen Loraine, Delage Ludovic, Mckeown Dean, Motomura Taizo, Sussfeld Duncan, Fan Xiao, Mazéas Lisa, Terrapon Nicolas et al., 2024 — Evolutionary genomics of the emergence of brown algae as key components of coastal ecosystems. Brown seaweeds are keystone species of coastal ecosystems, often forming extensive underwater forests, and are under… Cell , , ISBN: 0092-8674 Publisher: Elsevier Type: 10.1016/j.cell.2024.10.049
https://hal.science/hal-04794231
Denoeud France, Godfroy Olivier, Cruaud Corinne, Heesch Svenja, Nehr Zofia, Tadrent Nachida, Couloux Arnaud, Brillet-Guéguen Loraine, Delage Ludovic, Mckeown Dean, Motomura Taizo, Sussfeld Duncan, Fan Xiao, Mazéas Lisa, Terrapon Nicolas et al., 2024 — Evolutionary genomics of the emergence of brown algae as key components of coastal ecosystems. Cell vol. 187, n° 24, 6943–6965.e39
ISSN
00928674
https://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2024.10.049
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Entité de rattachement

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  • Diversification et adaptation aux échelles micro et macro-évolutives (DIVA)
  • Evolution fonctionnelle et Taxonomie (EvoFoncT)
  • (-) Exploration, Espèces et Evolution (3E)
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  • Laboratoire informatique et Systématique (LIS-C)
  • Systématique, Phylogéographie, Évolution, Conservation (SPEC)

Organisme de rattachement

  • CNRS
  • MNHN
  • Sorbonne Université
  • (-) -

Statut

  • Doctorant(e)
  • Ingénieur(e) d'Etudes
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