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Les tutelles MNHN-CNRS-SU-EPHE-UA

L’Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité est une unité CNRS du Muséum national d’Histoire naturelle de Paris, ayant aussi pour tutelles l’Université Pierre et Marie Curie et l’Ecole Pratique des Hautes Etudes.

L’UMR 7205 a pour objectif de répondre aux questions concernant l’origine de la biodiversité, les modalités de diversification des espèces, la mise en place des communautés animales en lien avec l’évolution spatio-temporelle des taxons. L’unité est un des pôles européens de systématique et contribue de manière importante à la taxonomie et à la biologie de l’évolution. Les approches de systématique phylogénétique privilégiées par l’unité sont intégratives et ont amené la conception d’outils taxonomiques, moléculaires, génétiques, acoustiques, cytogénétiques, morphologiques et morphométriques.

L’Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité (ISYEB) succède à l’OSEB depuis le 1er Janvier 2014. Les laboratoires de l’Institut se trouvent au Jardin des Plantes dans des bâtiments situés rue Buffon et rue Cuvier (Entomologie, Mammifères et Oiseaux, Malacologie, Botanique, Reptiles-Amphibiens, Géologie).

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Puillandre Nicolas, Brouillet Sophie & Achaz Guillaume, 2020 — ASAP : assemble species by automatic partitioning. Molecular Ecology Resources vol. 21, n° 2, 1755–0998.13281
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Marchet Camille, Lecompte Lolita, Limasset Antoine, Bittner Lucie & Peterlongo Pierre, mars 2020 — A resource-frugal probabilistic dictionary and applications in bioinformatics. Discrete Applied Mathematics vol. 274, , p. 92-102
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0166218X
https://dx.doi.org/10.1016/j.dam.2018.03.035
Bridel Sébastien, Bourgeon Frédéric, Marie Arnaud, Saulnier Denis, Pasek Sophie, Nicolas Pierre, Bernardet Jean-François & Duchaud Eric, 2020 — Genetic diversity and population structure of Tenacibaculum maritimum, a serious bacterial pathogen of marine fish: from genome comparisons to high throughput MALDI-TOF typing. Veterinary Research vol. 51, n° 1, p. 60
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Salazar Karen & Nattier Romain, 2020 — New Light on Historical Specimens Reveals a New Species of Ladybird (Coleoptera: Coccinellidae): Morphological, Museomic, and Phylogenetic Analyses. Insects vol. 11, n° 11, p. 766
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Auvinet Juliette, Dettai Agnès, Coriton Olivier, Ozouf-Costaz Catherine & Higuet Dominique, 2021 — « Identification of Interspecific Chromosomal Homologies: Chromosomal Microdissection and Chromosomal Painting in Antarctic Teleosts Nototheniidae » in Systematics and the Exploration of Life.. , , dir. Wiley p. 185-214
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Carpentier Mathilde & Chomilier Jacques, 2021 — « Impact of a Point Mutation in a Protein Structure » in Systematics and the Exploration of Life.. , , dir. Wiley p. 17-31
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978-1-119-47687-0
https://dx.doi.org/10.1002/9781119476870.ch2
Nattier Romain, Michel-Salzat Alice, Almeida Lucia M., Chifflet-Belle Pascaline, Magro Alexandra, Salazar Karen & Kergoat Gael J., 2021 — Phylogeny and divergence dating of the ladybird beetle tribe Coccinellini Latreille (Coleoptera: Coccinellidae: Coccinellinae). Systematic Entomology vol. 46, , p. 632-648
ISSN
0307-6970, 1365-3113
https://dx.doi.org/10.1111/syen.12480
Vences Miguel, Miralles Aurélien, Brouillet Sophie, Ducasse Jacques, Fedosov Alexander, Kharchev Vladimir, Kostadinov Ivaylo, Kumari Sangeeta, Patmanidis Stefanos, Scherz Mark, Puillandre Nicolas & Renner Susanne, juillet 2021 — iTaxoTools 0.1: Kickstarting a specimen-based software toolkit for taxonomists. While powerful and user-friendly software suites exist for phylogenetics, and an impressive cybertaxomic infrastructure of… Megataxa vol. 6, n° 2, p. 77-92 ISBN: 2703-3082 Publisher: Magnolia Press Type: 10.11646/MEGATAXA.6.2.1
ISSN
2703-3090, 2703-3082
https://dx.doi.org/10.11646/megataxa.6.2.1
Miralles Aurelien, Ducasse Jacques, Brouillet Sophie, Flouri Tomas, Fujisawa Tomochika, Kapli Paschalia, Knowles L. Lacey, Kumari Sangeeta, Stamatakis Alexandros, Sukumaran Jeet, Lutteropp Sarah, Vences Miguel & Puillandre Nicolas, 2022 — SPART : A versatile and standardized data exchange format for species partition information. Molecular Ecology Resources vol. 22, n° 1, p. 430-438
ISSN
1755-098X
https://dx.doi.org/10.1111/1755-0998.13470
Auvinet Juliette, Graca Paula, Belkady Laurent, Petit Laurence, dettaï Agnes, Ozouf-Costaz Catherine & Higuet Dominique, 2016 — Retrotransposable elements and chromosomal diversification in Antarctic notothenioid fishes. Chromosome Research vol. 24, n° 1, S32
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0967-3849
Auvinet J., Graça P., Belkadi L., Petit L., Bonnivard E., Dettaï A., Detrich W. H., Ozouf-Costaz C. & Higuet D., 2018 — Mobilization of retrotransposons as a cause of chromosomal diversification and rapid speciation: the case for the Antarctic teleost genus Trematomus. BMC genomics vol. 19, n° 1, p. 339
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https://dx.doi.org/10.1186/s12864-018-4714-x
Lescot Magali, Hingamp Pascal, Kojima Kenji K, Villar Emilie, Romac Sarah, Veluchamy Alaguraj, Boccara Martine, Jaillon Olivier, Iudicone Daniele, Bowler Chris, Wincker Patrick, Claverie Jean-Michel & Ogata Hiroyuki, mai 2016 — Reverse transcriptase genes are highly abundant and transcriptionally active in marine plankton assemblages. The ISME Journal vol. 10, n° 5, p. 1134-1146
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Boccara Martine, Fedala Yasmina, Bryan Catherine Venien, Bailly-Bechet Marc, Bowler Chris & Boccara Albert Claude, septembre 2016 — Full-field interferometry for counting and differentiating aquatic biotic nanoparticles: from laboratory to Tara Oceans. Biomedical Optics Express vol. 7, n° 9, p. 3736
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Loire Etienne, Higuet Dominique, Netter Pierre & Achaz Guillaume, février 2013 — Evolution of Coding Microsatellites in Primate Genomes. Genome Biology and Evolution vol. 5, n° 2, p. 283-295
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https://dx.doi.org/10.1093/gbe/evt003
Santini Guillaume, Soldano Henry & Pothier Joël, 2012 — Automatic classification of protein structures relying on similarities between alignments. BMC Bioinformatics vol. 13, n° 1, p. 233
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https://dx.doi.org/10.1186/1471-2105-13-233
Ishida Saeko, Picard Fabienne, Rudolf Gabrielle, Noé Eric, Achaz Guillaume, Thomas Pierre, Genton Pierre, Mundwiller Emeline, Wolff Markus, Marescaux Christian, Miles Richard, Baulac Michel, Hirsch Edouard, Leguern Eric & Baulac Stéphanie, mars 2013 — Mutations of DEPDC5 cause autosomal dominant focal epilepsies. Nature Genetics vol. 45, n° 5, p. 552-555
ISSN
1061-4036, 1546-1718
https://dx.doi.org/10.1038/ng.2601
Magellan Hervé, Boccara Martine, Drujon Thierry, Soulié Marie-Christine, Guillou Catherine, Dubois Joëlle & Becker Hubert F., septembre 2013 — Discovery of two new inhibitors of Botrytis cinerea chitin synthase by a chemical library screening. Bioorganic & Medicinal Chemistry vol. 21, n° 17, p. 4997-5003
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09680896
https://dx.doi.org/10.1016/j.bmc.2013.06.058
Achaz Guillaume, Rodriguez-Verdugo Alejandra, Gaut Brandon S. & Tenaillon Olivier, 2014 — « The Reproducibility of Adaptation in the Light of Experimental Evolution with Whole Genome Sequencing » in Ecological Genomics.. vol. 781, , dir. Springer Netherlands p. 211-231
ISBN
978-94-007-7346-2 978-94-007-7347-9
http://link.springer.com/10.1007/978-94-007-7347-9_11
Blanquart François, Achaz Guillaume, Bataillon Thomas & Tenaillon Olivier, décembre 2014 — Properties of selected mutations and genotypic landscapes under Fisher’s geometric model: GENOTYPIC LANDSCAPES UNDER FISHER’S MODEL. Evolution vol. 68, n° 12, p. 3537-3554
ISSN
00143820
https://dx.doi.org/10.1111/evo.12545
Gangloff Serge, Achaz Guillaume, Francesconi Stefania, Villain Adrien, Miled Samia, Denis Claire & Arcangioli Benoit, décembre 2017 — Quiescence unveils a novel mutational force in fission yeast. eLife vol. 6, ,
ISSN
2050-084X
https://dx.doi.org/10.7554/eLife.27469
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Organisme de rattachement

  • -
  • CNRS
  • EPHE-PSL
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Statut

  • Bénévole
  • Doctorant(e)
  • Ingénieur(e) d'Etudes
  • Maître de Conférences
  • Professeur(e) Emérite

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