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Les tutelles MNHN-CNRS-SU-EPHE-UA

L’Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité est une unité CNRS du Muséum national d’Histoire naturelle de Paris, ayant aussi pour tutelles l’Université Pierre et Marie Curie et l’Ecole Pratique des Hautes Etudes.

L’UMR 7205 a pour objectif de répondre aux questions concernant l’origine de la biodiversité, les modalités de diversification des espèces, la mise en place des communautés animales en lien avec l’évolution spatio-temporelle des taxons. L’unité est un des pôles européens de systématique et contribue de manière importante à la taxonomie et à la biologie de l’évolution. Les approches de systématique phylogénétique privilégiées par l’unité sont intégratives et ont amené la conception d’outils taxonomiques, moléculaires, génétiques, acoustiques, cytogénétiques, morphologiques et morphométriques.

L’Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité (ISYEB) succède à l’OSEB depuis le 1er Janvier 2014. Les laboratoires de l’Institut se trouvent au Jardin des Plantes dans des bâtiments situés rue Buffon et rue Cuvier (Entomologie, Mammifères et Oiseaux, Malacologie, Botanique, Reptiles-Amphibiens, Géologie).

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portrait Karen Salazar
Karen SALAZAR
Bénévole
karen.salazar [at] mnhn.fr
Atelier de bio-informatique (ABI)

57 rue Cuvier
CP43
75005 Paris

Gaspart RHIM
Doctorant(e)
gaspard.rhim [at] mnhn.fr
Atelier de bio-informatique (ABI)
Jérémy ROUSSEAU
Doctorant(e)
jeremy.rousseau [at] mnhn.fr
Atelier de bio-informatique (ABI)
Nattier Romain & Salazar Karen, octobre 2019 — B Next-generation sequencing yields mitochondrial genome of Coccidophilus cariba Gordon (Coleoptera: Coccinellidae) from museum specimen. We assembled and annotated the first complete mitochondrial genome of a species from the subfamily Microweiseinae,… Mitochondrial DNA Part B Resources vol. 4, n° 2, p. 3780-3781
https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-02363704
Soldano Henry, Santini Guillaume, Bouthinon Dominique, Bary Sophie & Lazega Emmanuel, 2018 — « Bi-Pattern Mining of Two Mode and Directed Networks » in WWW (Companion Volume).. , , p. 1287-1294
Soldano Henry, Bary Sophie, Santini Guillaume & Bouthinon Dominique, 2018 — « Core Stratification of Two-Mode Networks » in Complex networks (1).. vol. 812, , p. 130-142
Régnier Claire, Achaz Guillaume, Lambert Amaury, Cowie Robert H., Bouchet Philippe & Fontaine Benoît, 2015 — Mass extinction in poorly known taxa. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America vol. 112, n° 25, p. 7761-7766
ISSN
0027-8424, 1091-6490
https://dx.doi.org/10.1073/pnas.1502350112
Puillandre Nicolas, Lambert A., Brouillet S. & Achaz G., avril 2012 — ABGD , Automatic Barcode Gap Discovery for primary species delimitation: ABGD, AUTOMATIC BARCODE GAP DISCOVERY. Molecular Ecology vol. 21, n° 8, p. 1864-1877
ISSN
09621083
https://dx.doi.org/10.1111/j.1365-294X.2011.05239.x
Dettaï Agnes, Gallut Cyril, Brouillet Sophie, Pothier Joel, Lecointre Guillaume & Debruyne Régis, 2012 — Conveniently Pre-Tagged and Pre-Packaged: Extended Molecular Identification and Metagenomics Using Complete Metazoan Mitochondrial Genomes. PLos One vol. 7, n° 12, e51263
ISSN
1932-6203
https://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0051263
Auvinet Juliette, Graça Paula, Dettai Agnès, Amores Angel, Postlethwait John H., Detrich H. William, Ozouf-Costaz Catherine, Coriton Olivier & Higuet Dominique, 2020 — Multiple independent chromosomal fusions accompanied the radiation of the Antarctic teleost genus Trematomus (Notothenioidei:Nototheniidae). BMC Evolutionary Biology vol. 20, n° 1, p. 39
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1471-2148
https://dx.doi.org/10.1186/s12862-020-1600-3
Auvinet Juliette, Graça Paula, Ghigliotti Laura, Pisano Eva, Dettai Agnès, Ozouf-Costaz Catherine & Higuet Dominique, 2019 — Insertion Hot Spots of DIRS1 Retrotransposon and Chromosomal Diversifications among the Antarctic Teleosts Nototheniidae. International Journal of Molecular Sciences vol. 20, n° 3, p. 701
ISSN
1422-0067
https://dx.doi.org/10.3390/ijms20030701
Moreau Camille, Danis Bruno, Jossart Quentin, Eleaume Marc, Sands Chester, Achaz Guillaume, Agüera Antonio & Saucède Thomas, 2019 — Is reproductive strategy a key factor in understanding the evolutionary history of Southern Ocean Asteroidea (Echinodermata)?. Ecology and Evolution vol. 9, n° 15, p. 8465-8478
ISSN
2045-7758, 2045-7758
https://dx.doi.org/10.1002/ece3.5280
Puillandre Nicolas, Brouillet Sophie & Achaz Guillaume, 2020 — ASAP : assemble species by automatic partitioning. Molecular Ecology Resources vol. 21, n° 2, 1755–0998.13281
ISSN
1755-098X, 1755-0998
https://dx.doi.org/10.1111/1755-0998.13281
Salazar Karen & Nattier Romain, 2020 — New Light on Historical Specimens Reveals a New Species of Ladybird (Coleoptera: Coccinellidae): Morphological, Museomic, and Phylogenetic Analyses. Insects vol. 11, n° 11, p. 766
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2075-4450
https://dx.doi.org/10.3390/insects11110766
Auvinet Juliette, Dettai Agnès, Coriton Olivier, Ozouf-Costaz Catherine & Higuet Dominique, 2021 — « Identification of Interspecific Chromosomal Homologies: Chromosomal Microdissection and Chromosomal Painting in Antarctic Teleosts Nototheniidae » in Systematics and the Exploration of Life.. , , dir. Wiley p. 185-214
ISBN
978-1-119-47687-0
https://dx.doi.org/10.1002/9781119476870.ch10
Nattier Romain, Michel-Salzat Alice, Almeida Lucia M., Chifflet-Belle Pascaline, Magro Alexandra, Salazar Karen & Kergoat Gael J., 2021 — Phylogeny and divergence dating of the ladybird beetle tribe Coccinellini Latreille (Coleoptera: Coccinellidae: Coccinellinae). Systematic Entomology vol. 46, , p. 632-648
ISSN
0307-6970, 1365-3113
https://dx.doi.org/10.1111/syen.12480
Vences Miguel, Miralles Aurélien, Brouillet Sophie, Ducasse Jacques, Fedosov Alexander, Kharchev Vladimir, Kostadinov Ivaylo, Kumari Sangeeta, Patmanidis Stefanos, Scherz Mark, Puillandre Nicolas & Renner Susanne, juillet 2021 — iTaxoTools 0.1: Kickstarting a specimen-based software toolkit for taxonomists. While powerful and user-friendly software suites exist for phylogenetics, and an impressive cybertaxomic infrastructure of… Megataxa vol. 6, n° 2, p. 77-92 ISBN: 2703-3082 Publisher: Magnolia Press Type: 10.11646/MEGATAXA.6.2.1
ISSN
2703-3090, 2703-3082
https://dx.doi.org/10.11646/megataxa.6.2.1
Miralles Aurelien, Ducasse Jacques, Brouillet Sophie, Flouri Tomas, Fujisawa Tomochika, Kapli Paschalia, Knowles L. Lacey, Kumari Sangeeta, Stamatakis Alexandros, Sukumaran Jeet, Lutteropp Sarah, Vences Miguel & Puillandre Nicolas, 2022 — SPART : A versatile and standardized data exchange format for species partition information. Molecular Ecology Resources vol. 22, n° 1, p. 430-438
ISSN
1755-098X
https://dx.doi.org/10.1111/1755-0998.13470
Auvinet Juliette, Graca Paula, Belkady Laurent, Petit Laurence, dettaï Agnes, Ozouf-Costaz Catherine & Higuet Dominique, 2016 — Retrotransposable elements and chromosomal diversification in Antarctic notothenioid fishes. Chromosome Research vol. 24, n° 1, S32
ISSN
0967-3849
Auvinet J., Graça P., Belkadi L., Petit L., Bonnivard E., Dettaï A., Detrich W. H., Ozouf-Costaz C. & Higuet D., 2018 — Mobilization of retrotransposons as a cause of chromosomal diversification and rapid speciation: the case for the Antarctic teleost genus Trematomus. BMC genomics vol. 19, n° 1, p. 339
ISSN
1471-2164
https://dx.doi.org/10.1186/s12864-018-4714-x
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