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Les tutelles MNHN-CNRS-SU-EPHE-UA

L’Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité est une unité CNRS du Muséum national d’Histoire naturelle de Paris, ayant aussi pour tutelles l’Université Pierre et Marie Curie et l’Ecole Pratique des Hautes Etudes.

L’UMR 7205 a pour objectif de répondre aux questions concernant l’origine de la biodiversité, les modalités de diversification des espèces, la mise en place des communautés animales en lien avec l’évolution spatio-temporelle des taxons. L’unité est un des pôles européens de systématique et contribue de manière importante à la taxonomie et à la biologie de l’évolution. Les approches de systématique phylogénétique privilégiées par l’unité sont intégratives et ont amené la conception d’outils taxonomiques, moléculaires, génétiques, acoustiques, cytogénétiques, morphologiques et morphométriques.

L’Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité (ISYEB) succède à l’OSEB depuis le 1er Janvier 2014. Les laboratoires de l’Institut se trouvent au Jardin des Plantes dans des bâtiments situés rue Buffon et rue Cuvier (Entomologie, Mammifères et Oiseaux, Malacologie, Botanique, Reptiles-Amphibiens, Géologie).

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L’Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité
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Henry SOLDANO
Bénévole
henry.soldano [at] mnhn.fr
henry.soldano [at] gmail.com
Atelier de bio-informatique (ABI)
Eric DUCHAUD
Bénévole
eric.duchaud [at] inrae.fr
Atelier de bio-informatique (ABI)
Guillaume SAPRIEL
Bénévole
guillaume.sapriel [at] uvsq.fr
Atelier de bio-informatique (ABI)
Soldano Henry, Santini Guillaume & Bouthinon Dominique, 2017 — Formal Concept Analysis in Social Network Analysis. , , p. 143-170
Soldano Henry, Santini Guillaume, Bouthinon Dominique & Lazega Emmanuel, novembre 2017 — « Hub-Authority Cores and Attributed Directed Network Mining » in IEEE 29th International Conference on Tools with Artificial Intelligence (ICTAI).. , , To–appear
Soldano Henry, Santini Guillaume, Bouthinon Dominique, Bary Sophie & Lazega Emmanuel, 2018 — « Bi-Pattern Mining of Two Mode and Directed Networks » in WWW (Companion Volume).. , , p. 1287-1294
Soldano Henry, Bary Sophie, Santini Guillaume & Bouthinon Dominique, 2018 — « Core Stratification of Two-Mode Networks » in Complex networks (1).. vol. 812, , p. 130-142
Soldano Henry, Santini Guillaume & Bouthinon Dominique, 2017 — « Formal Concept Analysis of Attributed Networks » in Formal Concept Analysis in Social Network Analysis.. vol. to appear, , dir. Springer in press
Bridel Sébastien, Olsen Anne-Berit, Nilsen Hanne, Bernardet Jean-François, Achaz Guillaume, Avendaño-Herrera Ruben & Duchaud Eric, 2018 — Comparative Genomics of Tenacibaculum dicentrarchi and "Tenacibaculum finnmarkense" Highlights Intricate Evolution of Fish-Pathogenic Species. Genome biology and evolution vol. 10, n° 2, p. 452-457
ISSN
1759-6653
https://dx.doi.org/10.1093/gbe/evy020
Rochat T., Pérez-Pascual D., Nilsen H., Carpentier M., Bridel S., Bernardet J.-F. & Duchaud E., 2019 — Identification of a novel elastin-degrading enzyme from the fish pathogen Flavobacterium psychrophilum. Applied and Environmental Microbiology , ,
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https://dx.doi.org/10.1128/AEM.02535-18
Veillon Lise-Marie, Bourgne Gauvain & Soldano Henry, 2017 — Effect of Network Topology on Neighbourhood-Aided Collective Learning. 9th International Conference on Computational Collective Intelligence (ICCCI), Nicosia, Cyprus. Springer , , p. 202-211
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Veillon Lise-Marie, Bourgne Gauvain & Soldano Henry, 2018 — Better Collective Learning with Consistency Guarantees. Principles and Practice of Multi-Agent Systems. Springer vol. 11224, , p. 671-679
Vences Miguel, Miralles Aurélien, Brouillet Sophie, Ducasse Jacques, Fedosov Alexander, Kharchev Vladimir, Kostadinov Ivaylo, Kumari Sangeeta, Patmanidis Stefanos, Scherz Mark, Puillandre Nicolas & Renner Susanne, juillet 2021 — iTaxoTools 0.1: Kickstarting a specimen-based software toolkit for taxonomists. While powerful and user-friendly software suites exist for phylogenetics, and an impressive cybertaxomic infrastructure of… Megataxa vol. 6, n° 2, p. 77-92 ISBN: 2703-3082 Publisher: Magnolia Press Type: 10.11646/MEGATAXA.6.2.1
ISSN
2703-3090, 2703-3082
https://dx.doi.org/10.11646/megataxa.6.2.1
Miralles Aurelien, Ducasse Jacques, Brouillet Sophie, Flouri Tomas, Fujisawa Tomochika, Kapli Paschalia, Knowles L. Lacey, Kumari Sangeeta, Stamatakis Alexandros, Sukumaran Jeet, Lutteropp Sarah, Vences Miguel & Puillandre Nicolas, 2022 — SPART : A versatile and standardized data exchange format for species partition information. Molecular Ecology Resources vol. 22, n° 1, p. 430-438
ISSN
1755-098X
https://dx.doi.org/10.1111/1755-0998.13470
Coutant Anthony, Roper Katherine, Trejo-Banos Daniel, Bouthinon Dominique, Carpenter Martin, Grzebyta Jacek, Santini Guillaume, Soldano Henry, Elati Mohamed, Ramon Jan, Rouveirol Céline, Soldatova Larisa & King Ross, 2019 — Closed-loop cycles of experiment design, execution, and learning accelerate systems biology model development in yeast. One of the most challenging tasks in modern science is the development of systems biology models: Existing models are often… Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America vol. 116, n° 36, p. 18142-18147 Accession Number: 31420515 ISBN: 0027-8424 Publisher: National Academy of Sciences Type: 10.1073/pnas.1900548116
ISSN
0027-8424, 1091-6490
https://dx.doi.org/10.1073/pnas.1900548116
Vences Miguel, Miralles Aurélien, Brouillet Sophie, Ducasse Jacques, Fedosov Alexander, Kharchev Vladimir, Kostadinov Ivaylo, Kumari Sangeeta, Patmanidis Stefanos, Scherz Mark, Puillandre Nicolas & Renner Susanne, 2021 — iTaxoTools 0.1: Kickstarting a specimen-based software toolkit for taxonomists. While powerful and user-friendly software suites exist for phylogenetics, and an impressive cybertaxomic infrastructure of… Megataxa vol. 6, n° 2, p. 77-92 ISBN: 2703-3082 Publisher: Magnolia Press Type: 10.11646/MEGATAXA.6.2.1
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03321424
Le Gall Line, Corbari Laure, Aurelle D., Bay-Nouailhat Anne, Bay-Nouailhat Wilfried, de Bettignies Thibaut, Duchaud Éric, Marani Gilberto & Bouchet Philippe, janvier 2024 — Bilan scientifiqueLA PLANÈTE REVISITÉE EN CORSE, Volet marin 2019-2021. Le projet La Planète Revisitée en Corse est mené par le Muséum national d’Histoire naturelle (MNHN), la Collectivité de Corse … , , p. 189
https://mnhn.hal.science/mnhn-04552677
Le Gall Line, Corbari Laure, Aurelle Didier, Bay-Nouailhat Anne, Bay-Nouailhat Wilfried, De Bettignies Thibaut, Duchaud Éric, Marani Gilberto & Bouchet Philippe, 2024 — A PLANÈTE REVISITÉE EN CORSE : Volet marin 2019-2021. , , p. 189
Puillandre Nicolas, Miralles Aurélien, Brouillet Sophie, Fedosov Alexander, Fischell Frank, Patmanidis Stefanos & Vences Miguel, 2024 — « Species Delimitation and Exploration of Species Partitions with ASAP and LIMES » in DNA Barcoding.. vol. 2744, , p. 313-334 Series Title: Methods in Molecular Biology
ISBN
978-1-07-163580-3 978-1-07-163581-0
https://dx.doi.org/10.1007/978-1-0716-3581-0_20
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