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Les tutelles MNHN-CNRS-SU-EPHE-UA

L’Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité est une unité CNRS du Muséum national d’Histoire naturelle de Paris, ayant aussi pour tutelles l’Université Pierre et Marie Curie et l’Ecole Pratique des Hautes Etudes.

L’UMR 7205 a pour objectif de répondre aux questions concernant l’origine de la biodiversité, les modalités de diversification des espèces, la mise en place des communautés animales en lien avec l’évolution spatio-temporelle des taxons. L’unité est un des pôles européens de systématique et contribue de manière importante à la taxonomie et à la biologie de l’évolution. Les approches de systématique phylogénétique privilégiées par l’unité sont intégratives et ont amené la conception d’outils taxonomiques, moléculaires, génétiques, acoustiques, cytogénétiques, morphologiques et morphométriques.

L’Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité (ISYEB) succède à l’OSEB depuis le 1er Janvier 2014. Les laboratoires de l’Institut se trouvent au Jardin des Plantes dans des bâtiments situés rue Buffon et rue Cuvier (Entomologie, Mammifères et Oiseaux, Malacologie, Botanique, Reptiles-Amphibiens, Géologie).

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L’Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité
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Aurélie Lacoeuilhe, Denys Gaël P. J., Dupont Pascal, Archambeau Anne-Sophie, Bed’hom Bertrand, Bouix Thomas, Brisset Julien, Cammas Maxime, Dettaï Agnès, Dusoulier François, Gachon Claire M. M., Gargominy Olivier, Gaudeul Myriam, Haÿ Vincent, Hérard Katia et al., 2025 — Référentiel des séquences génétiques des espèces de France : note pour la mise en place d’un nouvel outil national. , , p. 35
https://hal.science/hal-04931482
Wootton Lara M., Boucher Florian C., Pouchon Charles, Roquet Cristina, Coissac Eric, Renaud Julien, Alsos Inger G., Valla Pierre G., Husson Laurent, Bernet Matthias, Perrier Christophe, Douzet Rolland, Rome Maxime, Valay Jean-Gabriel, Alberti Adriana et al., 2025 — The late rise of sky-island vegetation in the European Alps. Nature Plants , ,
ISSN
2055-0278
https://dx.doi.org/10.1038/s41477-025-02001-0
Campos P. E., Pruvost O., Boyer K., Chiroleu F., Cao T.T., Gaudeul M., Baider C., Utteridge T. M. A., Dominick S., Becker Nathalie, Rieux A. & Gagnevin L., 2023 — Herbarium Specimen Sequencing Allows Precise Datation of Xanthomonas citri pv. citri Diversification History. Over the past decade, the field of ancient genomics has triggered considerable progress in the study of various pathogens,… PREPRINT , , Type: 10.1101/2022.12.08.519547
https://dx.doi.org/10.1101/2022.12.08.519547
Campos Pe, Pruvost O., Boyer K., Chiroleu F., Cao Tt, Gaudeul M., Baider C., Utteridge Tma, Dominick S., Becker Nathalie, Rieux A. & Gagnevin L., 2023 — Herbarium Specimen Sequencing Allows Precise Datation of Xanthomonas citri pv. citri Diversification History. Over the past decade, the field of ancient genomics has triggered considerable progress in the study of various pathogens,… , , Type: 10.1101/2022.12.08.519547
https://hal.science/hal-03936158
Ringelberg Jens J., Koenen Erik J. M., Sauter Benjamin, Aebli Anahita, Rando Juliana G., Iganci Joao R., de Queiroz Luciano P., Murphy Daniel J., Gaudeul Myriam, Bruneau Anne, Luckow Melissa, Lewis Gwilym P., Miller Joseph T., Simon Marcelo F., Jordao Lucas S. B. et al., 2023 — Precipitation is the main axis of tropical plant phylogenetic turnover across space and time. Science advances vol. 9, n° 7, Number: eade4954 tex.orcid-numbers: Dexter, Kyle G/0000-0001-9232-5221 Iganci, João/0000-0002-5740-3666 Bruneau, Anne/0000-0001-5547-0796 Gastaldello Rando, Juliana/0000-0002-3714-8231 Ringelberg, Jens/0000-0003-0567-5210 Murphy, Daniel/0000-0002-8358-363
ISSN
2375-2548
https://dx.doi.org/10.1126/sciadv.ade4954
Campos Paola E., Pruvost Olivier, Boyer Karine, Chiroleu Frederic, Cao Thuy Trang, Gaudeul Myriam, Baider Claudia, Utteridge Timothy M. A., Becker Nathalie, Rieux Adrien & Gagnevin Lionel, 2023 — Herbarium specimen sequencing allows precise dating of Xanthomonas citri pv. citri diversification history. NATURE COMMUNICATIONS vol. 14, n° 1, Number: 4306 tex.eissn: 2041-1723 tex.orcid-numbers: Baider, Claudia/0000-0002-2203-2076 Gagnevin, Lionel/0000-0002-2943-0827 Pruvost, Olivier/0000-0002-3175-9795 Campos, Paola/0009-0009-5982-8287 Utteridge, Timothy/0000-0003-2823-0337 tex.researcherid-nu
https://dx.doi.org/10.1038/s41467-023-39950-z
Ringelberg Jens J., Koenen Erik J. M., Iganci Joao R., de Queiroz Luciano P., Murphy Daniel J., Gaudeul Myriam, Bruneau Anne, Luckow Melissa, Lewis Gwilym P. & Hughes Colin E., 2022 — Phylogenomic analysis of 997 nuclear genes reveals the need for extensive generic re-delimitation in Caesalpinioideae (Leguminosae). PHYTOKEYS , n° 205, p. 3-58 tex.eissn: 1314-2003 tex.orcid-numbers: Murphy, Daniel J/0000-0002-8358-363X Iganci, João/0000-0002-5740-3666 Ringelberg, Jens/0000-0003-0567-5210 tex.researcherid-numbers: Murphy, Daniel J/C-3781-2008 Iganci, João/K-7880-2018 tex.unique-id: WOS:000861258
ISSN
1314-2011
https://dx.doi.org/10.3897/phytokeys.205.85866
Bieker Vanessa C., Battlay Paul, Petersen Bent, Sun Xin, Wilson Jonathan, Brealey Jaelle C., Bretagnolle Francois, Nurkowski Kristin, Lee Chris, Barreiro Fatima Sanchez, Owens Gregory L., Lee Jacqueline Y., Kellner Fabian L., van Boheeman Lotte, Gopalakrishnan Shyam et al., 2022 — Uncovering the genomic basis of an extraordinary plant invasion. SCIENCE ADVANCES vol. 8, n° 34, Number: eabo5115 tex.orcid-numbers: Rieseberg, Loren H/0000-0002-2712-2417 Bieker, Vanessa/0000-0002-2061-9041 Gilbert, Marcus TP/0000-0002-5805-7195 Owens, Gregory/0000-0002-4019-5215 Brealey, Jaelle C./0000-0001-7068-2017 Petersen, Bent/0000-0002-2472-8
ISSN
2375-2548
https://dx.doi.org/10.1126/sciadv.abo5115
Campos Paola E, Groot Crego Clara, Boyer Karine, Gaudeul Myriam, Baider Claudia, Richard Damien, Pruvost Olivier, Roumagnac Philippe, Szurek Boris, Becker Nathalie, Gagnevin Lionel & Rieux Adrien, juillet 2021 — First historical genome of a crop bacterial pathogen from herbarium specimen: Insights into citrus canker emergence. Over the past decade, ancient genomics has been used in the study of various pathogens. In this context, herbarium specimens… PLoS Pathogens vol. 17, n° 7, e1009714 Publisher: Public Library of Science tex.hal_id: hal-03327718 tex.hal_version: v1
ISSN
1553-7374
https://dx.doi.org/10.1371/journal.ppat.1009714
Quiles Anita, R. Invernón Vanessa, Beck Lucile, Delque-Kolic Emmanuelle, Gaudeul Myriam, Muller Serge & Rouhan Germinal, juillet 2021 — « Préciser la courbe de calibration radiocarbone pour l’Égypte ancienne : le pari des herbiers » in Les collections naturalistes dans la science du XXIe siècle.. vol. CHAPITRE12, , p. 179-195 tex.hal_id: mnhn-03324334 tex.hal_version: v1
https://dx.doi.org/10.51926/ISTE.9049.ch12
Rouhan Germinal & Gaudeul Myriam, mars 2021 — « Exploration and Origins of Biodiversity in Madagascar: The Message of Ferns » in Systematics and the Exploration of Life.. Systematics and the Exploration of Life , , dir. Wiley p. 135-146
ISBN
978-1-119-47687-0
https://dx.doi.org/10.1002/9781119476870.ch7
Rouhan Germinal & Gaudeul Myriam, mars 2021 — « Diversité et origines de la biodiversité à Madagascar : le message des fougères » in Systématique et exploration du vivant.. , , tex.hal_id: mnhn-03324058 tex.hal_version: v1
https://hal-mnhn.archives-ouvertes.fr/mnhn-03324058
Quiles Anita, Invernon Vanessa, Beck Lucile, Delque-Kolic Emmanuelle, Gaudeul Myriam, Muller S. & Rouhan Germinal, 2021 — « Préciser la courbe de calibration radiocarbone pour l’Égypte ancienne : le pari des herbiers » in Les collections naturalistes dans la science du XXIe siècle.. vol. chapitre 12, , dir. ISTE Editions
https://www.istegroup.com/fr/produit/les-collections-naturalistes-dans-la-science-du-xxie-siecle/
Gagnevin Lionel, Rieux Adrien, Lett Jean-Michel, Roumagnac Philippe, Szurek Boris, Campos Paola, Baider Claudia, Gaudeul Myriam & Becker Nathalie, 2021 — « Les herbiers, une fenêtre ouverte sur l’histoire évolutive des agents pathogènes des cultures » in Les collections naturalistes dans la science du XXIe siècle.. vol. chapitre 13, , dir. ISTE Editions
https://www.istegroup.com/fr/produit/les-collections-naturalistes-dans-la-science-du-xxie-siecle/
Rieux Adrien, Campos Paola, Duvermy Arnaud, Scussel Sarah, Martin Darren, Gaudeul Myriam, Lefeuvre Pierre, Becker Nathalie & Lett Jean-Michel, 2021 — Contribution of historical herbarium small RNAs to the reconstruction of a cassava mosaic geminivirus evolutionary history. Scientific Reports vol. 11, n° 1, p. 21280
ISSN
2045-2322
https://dx.doi.org/10.1038/s41598-021-00518-w
Haevermans Thomas, Tressou Jessica, Kwon Joon, Pellens Roseli, Dubéarnès Anne, Veron Simon, Bel Liliane, Dervaux Stéphane, Dibie-Barthelemy Juliette, Gaudeul Myriam, Govaerts Rafaël, Le Bras Gwenaël, Muller Serge, Rouhan Germinal, Sarthou Corinne et al., 2021 — Global Plant Extinction Risk Assessment Inform Novel Biodiversity Hotspots. Plant Biology vol. Préprint, ,
https://dx.doi.org/10.1101/2021.10.08.463027
Rouhan Germinal & Gaudeul Myriam, 2021 — « Plant Taxonomy: A Historical Perspective, Current Challenges, and Perspectives » in Molecular Plant Taxonomy.. vol. 2222, , dir. Springer US p. 1-38 Series Title: Methods in Molecular Biology
ISBN
978-1-07-160996-5 978-1-07-160997-2
https://dx.doi.org/10.1007/978-1-0716-0997-21
Rouhan Germinal & Gaudeul Myriam, 2021 — « Plant Taxonomy: A Historical Perspective, Current Challenges, and Perspectives » in Molecular Plant Taxonomy.. vol. 2222, , p. 1-38
ISBN
978-1-07-160996-5 978-1-07-160997-2
https://dx.doi.org/10.1007/978-1-0716-0997-2_1
Quiles A., Invernon V., Beck L., Delque-Kolic E., Gaudeul M., Muller S. & Rouhan G., 2020 — « Préciser la courbe de calibration radiocarbone pour l’Égypte ancienne : le pari des herbiers. » in Utilisations innovantes des collections dans la recherche scientifique. In Press... , , dir. ISTE Editions
Robène Isabelle, Maillot-Lebon Véronique, Chabirand Aude, Moreau Aurélie, Becker Nathalie, Moumène Amal, Rieux Adrien, Campos Paola, Gagnevin Lionel, Gaudeul Myriam, Baider Claudia, Chiroleu Fréderic & Pruvost Olivier, 2020 — Development and comparative validation of genomic-driven PCR-based assays to detect Xanthomonas citri pv. citri in citrus plants. BMC Microbiology vol. 20, n° 1, p. 296
ISSN
1471-2180
https://dx.doi.org/10.1186/s12866-020-01972-8
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