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Les tutelles MNHN-CNRS-SU-EPHE-UA

L’Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité est une unité CNRS du Muséum national d’Histoire naturelle de Paris, ayant aussi pour tutelles l’Université Pierre et Marie Curie et l’Ecole Pratique des Hautes Etudes.

L’UMR 7205 a pour objectif de répondre aux questions concernant l’origine de la biodiversité, les modalités de diversification des espèces, la mise en place des communautés animales en lien avec l’évolution spatio-temporelle des taxons. L’unité est un des pôles européens de systématique et contribue de manière importante à la taxonomie et à la biologie de l’évolution. Les approches de systématique phylogénétique privilégiées par l’unité sont intégratives et ont amené la conception d’outils taxonomiques, moléculaires, génétiques, acoustiques, cytogénétiques, morphologiques et morphométriques.

L’Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité (ISYEB) succède à l’OSEB depuis le 1er Janvier 2014. Les laboratoires de l’Institut se trouvent au Jardin des Plantes dans des bâtiments situés rue Buffon et rue Cuvier (Entomologie, Mammifères et Oiseaux, Malacologie, Botanique, Reptiles-Amphibiens, Géologie).

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Barbier Maxime, et Wirth Thierry. 2017. « The Evolutionary History, Demography, and Spread of the <span class=“nocase”>Mycobacterium tuberculosis</span> Complex ». In Tuberculosis and the Tubercle Bacillus, 453–473. ASM Press. http://doi.wiley.com/10.1128/9781555819569.ch20.
ISBN
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http://doi.wiley.com/10.1128/9781555819569.ch20
Barilar Ivan, Fernando Tatiana, Utpatel Christian, Abujate Cláudio, Madeira Carla Maria, José Benedita, Mutaquiha Claudia, et al. 2024. « Emergence of bedaquiline-resistant tuberculosis and of multidrug-resistant and extensively drug-resistant Mycobacterium tuberculosis strains with rpoB Ile491Phe mutation not detected by Xpert MTB/RIF in Mozambique: a retrospective observational study ». The Lancet Infectious Diseases 24 (janvier): 297–307. doi:10.1016/S1473-3099(23)00498-X.
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https://dx.doi.org/10.1016/S1473-3099(23)00498-X
Auganova Dana, Atavliyeva Sabina, Gharbi Nour, Zholdybayeva Elena, Skiba Yuri, Akisheva Akmaral, Tsepke Anna, et al. 2025. « Genomic characterization and epidemiology of Mycobacterium tuberculosis lineage 2 isolates from Kazakhstan ». Scientific Reports 15 (janvier): 37715. doi:10.1038/s41598-025-22485-2.
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Stegger M., Wirth T., Andersen P. S., Skov R. L., DeGrassi A., Simoes P. M., Tristan A., et al. 2014. « Origin and evolution of European community-acquired methicillin-resistant Staphylococcus aureus ». MBio 5 (janvier): e01044-. doi:10.1128/mBio.01044-14.
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Wielgoss S., Gilabert A., Meyer A., et Wirth T. 2014. « Introgressive hybridization and latitudinal admixture clines in North Atlantic eels ». BMC Evolutionary Biology 14 (janvier): 61. doi:10.1186/1471-2148-14-61.
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Lalis A., et Wirth T. 2017. « Des souris et des hommes: Histoire évolutive de la Fièvre de Lassa ». In Evolution and Biodiversity. ISTE Editions; ISTE Editions.
Lalis Aude, et Wirth Thierry. 2018. « Mice and Men: an Evolutionary History of Lassa Fever ». In Biodiversity and Evolution, 189–212. Elsevier; Elsevier. doi:10.1016/B978-1-78548-277-9.50011-5.
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Huber B., Whibley A., Poul Y. L., Navarro N., Martin A., Baxter S., Shah A., et al. 2015. « Conservatism and novelty in the genetic architecture of adaptation in Heliconius butterflies ». Heredity 114 (janvier): 515-24. doi:10.1038/hdy.2015.22.
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Merker Matthias, Blin Camille, Mona Stefano, Duforet-Frebourg Nicolas, Lecher Sophie, Willery Eve, Blum Michael G B, et al. 2015. « Evolutionary history and global spread of the Mycobacterium tuberculosis Beijing lineage ». Nature Genetics 47 (janvier): 242-49. doi:10.1038/ng.3195.
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Wirth Thierry. 2015. « Massive lineage replacements and cryptic outbreaks of Salmonella Typhi in eastern and southern Africa ». Nature Genetics 47 (janvier): 565-67. doi:10.1038/ng.3318.
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Glaser Philippe, Martins-Simões Patrícia, Villain Adrien, Barbier Maxime, Tristan Anne, Bouchier Christiane, Ma Laurence, et al. 2016. « Demography and intercontinental spread of the USA300 community-acquired methicillin-resistant Staphylococcus aureus lineage ». mBio 7 (janvier): e02183-. doi:10.1128/mBio.02183-15.
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Sapriel G., Konjek J., Orgeur M., Bouri L., Frezal L., Roux A. L., Dumas E., et al. 2016. « Genome-wide mosaicism within Mycobacterium abscessus: evolutionary and epidemiological implications ». BMC Genomics 17 (janvier): 118. doi:10.1186/s12864-016-2448-1.
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Alhaj Hussen K., Vu Manh T. P., Guimiot F., Nelson E., Chabaane E., Delord M., Barbier M., et al. 2017. « Molecular and Functional Characterization of Lymphoid Progenitor Subsets Reveals a Bipartite Architecture of Human Lymphopoiesis ». Immunity 47 (janvier): 680–696 e8. doi:10.1016/j.immuni.2017.09.009.
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1097-4180 (Electronic) 1074-7613 (Linking)
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Rasigade Jean-Philippe, Barbier Maxime, Dumitrescu Oana, Pichat Catherine, Carret Gérard, Ronnaux-Baron Anne-Sophie, Blasquez Ghislaine, et al. 2017. « Strain-specific estimation of epidemic success provides insights into the transmission dynamics of tuberculosis ». Scientific Reports 7 (janvier): 45326. doi:10.1038/srep45326.
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Barbier M., Dumitrescu O., Pichat C., Carret G., Ronnaux-Baron A. S., Blasquez G., Godin-Benhaim C., et al. 2018. « Changing patterns of human migrations shaped the global population structure of Mycobacterium tuberculosis in France ». Scientific reports 8 (janvier): 5855. doi:10.1038/s41598-018-24034-6.
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2045-2322 (Electronic) 2045-2322 (Linking)
https://dx.doi.org/10.1038/s41598-018-24034-6
Gustave C. A., Tristan A., Martins-Simoes P., Stegger M., Benito Y., Andersen P. S., Bes M., et al. 2018. « Demographic fluctuation of community-acquired antibiotic-resistant Staphylococcus aureus lineages: potential role of flimsy antibiotic exposure ». Isme Journal 12 (janvier): 1879–1894. doi:10.1038/s41396-018-0110-4.
ISSN
1751-7370 (Electronic) 1751-7362 (Linking)
https://dx.doi.org/10.1038/s41396-018-0110-4
Kramer R., Sabatier M., Wirth T., Pichon M., Lina B., Schuffenecker I., et Josset L. 2018. « Molecular diversity and biennial circulation of enterovirus D68: a systematic screening study in Lyon, France, 2010 to 2016 ». Eurosurveillance 23 (janvier). doi:10.2807/1560-7917.ES.2018.23.37.1700711.
ISSN
1560-7917 (Electronic) 1025-496X (Linking)
https://dx.doi.org/10.2807/1560-7917.ES.2018.23.37.1700711
Merker M., Barbier M., Cox H., Rasigade J. P., Feuerriegel S., Kohl T. A., Diel R., et al. 2018. « Compensatory evolution drives multidrug-resistant tuberculosis in Central Asia ». eLife 7 (octobre). doi:10.7554/eLife.38200.
ISSN
2050-084X (Electronic) 2050-084X (Linking)
https://dx.doi.org/10.7554/eLife.38200
Quarrell S. R., Arabi J., Suwalski A., Veuille M., Wirth T., et Allen G. R. 2018. « The invasion biology of the invasive earwig, Forficula auricularia in Australasian ecosystems ». Biological Invasions 20 (janvier): 1553–1565.
Rasigade J. P., Hollandt F., et Wirth T. 2018. « Genes under positive selection in the core genome of pathogenic Bacillus cereus group members ». Infection, genetics and evolution : journal of molecular epidemiology and evolutionary genetics in infectious diseases 65 (janvier): 55–64. doi:10.1016/j.meegid.2018.07.009.
ISSN
1567-7257 (Electronic) 1567-1348 (Linking)
https://dx.doi.org/10.1016/j.meegid.2018.07.009
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