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Les tutelles MNHN-CNRS-SU-EPHE-UA

L’Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité est une unité CNRS du Muséum national d’Histoire naturelle de Paris, ayant aussi pour tutelles l’Université Pierre et Marie Curie et l’Ecole Pratique des Hautes Etudes.

L’UMR 7205 a pour objectif de répondre aux questions concernant l’origine de la biodiversité, les modalités de diversification des espèces, la mise en place des communautés animales en lien avec l’évolution spatio-temporelle des taxons. L’unité est un des pôles européens de systématique et contribue de manière importante à la taxonomie et à la biologie de l’évolution. Les approches de systématique phylogénétique privilégiées par l’unité sont intégratives et ont amené la conception d’outils taxonomiques, moléculaires, génétiques, acoustiques, cytogénétiques, morphologiques et morphométriques.

L’Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité (ISYEB) succède à l’OSEB depuis le 1er Janvier 2014. Les laboratoires de l’Institut se trouvent au Jardin des Plantes dans des bâtiments situés rue Buffon et rue Cuvier (Entomologie, Mammifères et Oiseaux, Malacologie, Botanique, Reptiles-Amphibiens, Géologie).

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Bastide Héloïse, López-Villavicencio Manuela, Ogereau David, Lledo Joanna, Dutrillaux Anne-Marie, Debat Vincent & Llaurens Violaine, 2023 — Genome assembly of 3 Amazonian Morpho butterfly species reveals Z-chromosome rearrangements between closely related species living in sympatry. The genomic processes enabling speciation and species coexistence in sympatry are still largely unknown. Here we describe the… GigaScience vol. 12, , ISBN: 2047-217X Type: 10.1093/gigascience/giad033
https://doi.org/10.1093/gigascience/giad033
Bastide Héloïse, López-Villavicencio Manuela, Ogereau David, Lledo Joanna, Dutrillaux Anne-Marie, Debat Vincent & Llaurens Violaine, 2023 — Genome assembly of 3 Amazonian Morpho butterfly species reveals Z-chromosome rearrangements between closely related species living in sympatry. The genomic processes enabling speciation and species coexistence in sympatry are still largely unknown. Here we describe the… GigaScience vol. 12, , ISBN: 2047-217X Type: 10.1093/gigascience/giad033
ISSN
2047-217X
https://dx.doi.org/10.1093/gigascience/giad033
Seudre O, Namias A, Gardena O, Da Silva G, Gouyon PH & López-Villavicencio M, 2018 — Why outcross? The abandon-ship hypothesis in a facultative outcrossing/selfing fungal species. FUNGAL GENETICS AND BIOLOGY vol. 120, , p. 1-8
ISSN
1087-1845
https://dx.doi.org/10.1016/j.fgb.2018.08.005
Ropars J, López-Villavicencio M, Snirc A, Lacoste S & Giraud T, 2017 — Blue cheese-making has shaped the population genetic structure of the mould Penicillium roqueforti. PLOS ONE vol. 12, n° 3, e0171387
ISSN
1932-6203
https://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0171387
Ropars J, Lo YC, Dumas E, Snirc A, Begerow D, Rollnik T, Lacoste S, Dupont J, Giraud T & López-Villavicencio M, 2016 — Fertility depression among cheese-making Penicillium roqueforti strains suggests degeneration during domestication. EVOLUTION vol. 70, n° 9, p. 2099-2109
ISSN
0014-3820
https://dx.doi.org/10.1111/evo.13015
Ropars J, de la Vega RCR, López-Villavicencio M, Dupont J, Swennen D, Dumas E, Giraud T & Branca A, 2016 — « Diversity and mechanisms of genomic adaptation in Penicillium » in Aspergillus and Penicillium in the Post-Genomic Era.. , , dir. Caister Academic Press p. 27-42 Pages: 42
ISBN
978-1-910190-39-5
Gillot G, Jany JL, Coton M, Le Floch G, Debaets S, Ropars J, López-Villavicencio M, Dupont J, Branca A, Giraud T & Coton E, 2015 — Insights into Penicillium roqueforti Morphological and Genetic Diversity. PLOS ONE vol. 10, n° 6, e0129849 WOS:000356835000067
ISSN
1932-6203
https://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0129849
Ropars J, de la Vega RCR, López-Villavicencio M, Gouzy J, Sallet E, Dumas E, Lacoste S, Debuchy R, Dupont J, Branca A & Giraud T, 2015 — Adaptive Horizontal Gene Transfers between Multiple Cheese-Associated Fungi. CURRENT BIOLOGY vol. 25, n° 19, p. 2562-2569
ISSN
0960-9822
https://dx.doi.org/10.1016/j.cub.2015.08.025
Ropars J, López-Villavicencio M, Dupont J, Snirc A, Gillot G, Coton M, Jany JL, Coton E & Giraud T, 2014 — Induction of sexual reproduction and genetic diversity in the cheese fungus Penicillium roqueforti. EVOLUTIONARY APPLICATIONS vol. 7, n° 4, p. 433-441
ISSN
1752-4571
https://dx.doi.org/10.1111/eva.12140
Buono L, López-Villavicencio M, Shykoff JA, Snirc A & Giraud T, 2014 — Influence of Multiple Infection and Relatedness on Virulence: Disease Dynamics in an Experimental Plant Population and Its Castrating Parasite. PLOS ONE vol. 9, n° 6, e98526 WOS:000336911400062
ISSN
1932-6203
https://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0098526
de Vienne D. M., Refrégier G., López-Villavicencio M., Tellier A., Hood M. E. & Giraud T., 2013 — Cospeciation vs host-shift speciation: methods for testing, evidence from natural associations and relation to coevolution. New Phytologist vol. 198, n° 2, p. 347-385
ISSN
0028646X
https://dx.doi.org/10.1111/nph.12150
López-Villavicencio M., Debets A. J. M., Slakhorst M., Giraud T. & Schoustra S. E., 2013 — Deleterious effects of recombination and possible nonrecombinatorial advantages of sex in a fungal model. Journal of Evolutionary Biology vol. 26, n° 9, p. 1968-1978
ISSN
1010-061X
https://dx.doi.org/10.1111/jeb.12196
Ropars J, Dupont J, Fontanillas E, de la Vega RCR, Malagnac F, Coton M, Giraud T & López-Villavicencio M, 2012 — Sex in Cheese: Evidence for Sexuality in the Fungus Penicillium roqueforti. PLOS ONE vol. 7, n° 11, e49665
ISSN
1932-6203
https://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0049665
Billiard S., LóPez-Villavicencio M., Hood M. E. & Giraud T., 2012 — Sex, outcrossing and mating types: unsolved questions in fungi and beyond: Sexy fungi. Journal of Evolutionary Biology vol. 25, n° 6, p. 1020-1038
ISSN
1010061X
https://dx.doi.org/10.1111/j.1420-9101.2012.02495.x
Billiard S, López-Villavicencio M, Devier B, Hood ME, Fairhead C & Giraud T, 2011 — Having sex, yes, but with whom? Inferences from fungi on the evolution of anisogamy and mating types. BIOLOGICAL REVIEWS vol. 86, n° 2, p. 421-442
ISSN
1464-7931
https://dx.doi.org/10.1111/j.1469-185X.2010.00153.x
López-Villavicencio M., Aguileta G., Giraud T., de Vienne D.M., Lacoste S., Couloux A. & Dupont J., 2010 — Sex in Penicillium: Combined phylogenetic and experimental approaches. Fungal Genetics and Biology vol. 47, n° 8, p. 693-706
ISSN
10871845
https://dx.doi.org/10.1016/j.fgb.2010.05.002
Marthey S, Aguileta G, Rodolphe F, Gendrault A, Giraud T, Fournier E, Lopez-Villavicencio M, Gautier A, Lebrun MH & Chiapello H, 2008 — Funybase: a Fungal phylogenomic database. BMC BIOINFORMATICS vol. 9, n° 1, p. 456
ISSN
1471-2105
https://dx.doi.org/10.1186/1471-2105-9-456
Giraud T, Yockteng R, López-Villavicencio M, Refregier G & Hood ME, 2008 — Mating System of the Anther Smut Fungus Microbotryum violaceum : Selfing under Heterothallism. EUKARYOTIC CELL vol. 7, n° 5, p. 765-775
ISSN
1535-9778
https://dx.doi.org/10.1128/EC.00440-07
Giraud T., Yockteng R., Marthey S., Chiapello H., Jonot O., López-Villavicencio M., De Vienne D. M., Hood M. E., Refregier G., Gendrault-Jacquemard A., Wincker P. & Dossat C., 2008 — Permanent Genetic Resources: Isolation of 60 polymorphic microsatellite loci in EST libraries of four sibling species of the phytopathogenic fungal complex Microbotryum: Permanent Genetic Resources. Molecular Ecology Resources vol. 8, n° 2, p. 387-392
ISSN
1755098X
https://dx.doi.org/10.1111/j.1471-8286.2007.01967.x
López-Villavicencio M, Jonot O, Coantic A, Hood ME, Enjalbert J & Giraud T, 2007 — Multiple Infections by the Anther Smut Pathogen Are Frequent and Involve Related Strains. PLOS PATHOGENS vol. 3, n° 11, p. 1710-1715
ISSN
1553-7366
https://dx.doi.org/10.1371/journal.ppat.0030176
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