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Les tutelles MNHN-CNRS-SU-EPHE-UA

L’Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité est une unité CNRS du Muséum national d’Histoire naturelle de Paris, ayant aussi pour tutelles l’Université Pierre et Marie Curie et l’Ecole Pratique des Hautes Etudes.

L’UMR 7205 a pour objectif de répondre aux questions concernant l’origine de la biodiversité, les modalités de diversification des espèces, la mise en place des communautés animales en lien avec l’évolution spatio-temporelle des taxons. L’unité est un des pôles européens de systématique et contribue de manière importante à la taxonomie et à la biologie de l’évolution. Les approches de systématique phylogénétique privilégiées par l’unité sont intégratives et ont amené la conception d’outils taxonomiques, moléculaires, génétiques, acoustiques, cytogénétiques, morphologiques et morphométriques.

L’Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité (ISYEB) succède à l’OSEB depuis le 1er Janvier 2014. Les laboratoires de l’Institut se trouvent au Jardin des Plantes dans des bâtiments situés rue Buffon et rue Cuvier (Entomologie, Mammifères et Oiseaux, Malacologie, Botanique, Reptiles-Amphibiens, Géologie).

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L’Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité
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Denoël Mathieu & Dufresnes Christophe, 2025 — The alien marsh frog cocktail: Distribution, causes and pathways of a global amphibian invasion. Biological Conservation vol. 306, , p. 111120
ISSN
00063207
https://dx.doi.org/10.1016/j.biocon.2025.111120
Ambu Johanna, Caballero-Díaz Carlos, Sánchez-Montes Gregorio, Nicieza Alfredo G, Velo-Antón Guillermo, Hernandez Axel, Delmas Claudine, Trochet Audrey, Wielstra Ben, Crochet Pierre-André, Martínez-Solano Ĺñigo & Dufresnes Christophe, 2025 — Genome-wide patterns of diversity in the European midwife toad complex: phylogeographic and conservation prospects. Conservation Genetics vol. 26, , p. 361-379 Publisher: Springer Verlag tex.hal_id: hal-05006788 tex.hal_version: v1
https://dx.doi.org/10.1007/s10592-025-01673-7
Dufresnes Christophe, Lukanov Simeon, Gippner Sven, Ambu Johanna, Strachinis Ilias, Arsovski Dragan, Monod-Broca Benjamin, Cayuela Hugo, Lymberakis Petros, Canestrelli Daniele, Cogălniceanu Dan, Poyarkov Nikolay A, Litvinchuk Spartak N, Suchan Tomasz, Denoël Mathieu et al., 2025 — Historical biogeography and systematics of yellow-bellied toads (Bombina variegata), with the description of a new subspecies from the Balkans. Vertebrate Zoology vol. 75, , p. 1-30 tex.hal_id: hal-04995210 tex.hal_version: v1
https://dx.doi.org/10.3897/vz.75.e138687
Ambu Johanna, Litvinchuk Spartak N, Caballero-Díaz Carlos, Nicieza Alfredo, Velo-Antón Guillermo, Gonçalves Helena, Martínez-freiría Fernando, Martí-Gil Helena, Beltrán Juan Francisco, Donaire-Barroso David, Hernandez Axel, Suchan Tomasz, Crochet Pierre-André, Martínez-solano Iñigo & Dufresnes Christophe, 2025 — Genomic, phenotypic and environmental correlates of speciation in the midwife toads (Alytes). Molecular Ecology , , Publisher: Wiley tex.hal_id: hal-05006746 tex.hal_version: v1
https://dx.doi.org/10.1111/mec.17736
Dufresnes Christophe, Jablonski Daniel, Ambu Johanna, Prasad Vishal Kumar, Bala Gautam Kumudani, Kamei Rachunliu G, Mahony Stephen, Hofmann Sylvia, Masroor Rafaqat, Alard Bérénice, Crottini Angelica, Edmonds Devin, Ohler Annemarie, Jiang Jianping, Khatiwada Janak R et al., 2025 — Speciation and historical invasions of the Asian black-spined toad (Duttaphrynus melanostictus). Nature Communications vol. 16, n° 1, p. 298 Publisher: Nature Publishing Group tex.hal_id: hal-04886291 tex.hal_version: v1
ISSN
2041-1723
https://dx.doi.org/10.1038/s41467-024-54933-4
Dubey Sylvain, Pellaud Sébastien, Furrer Samuel & Dufresnes Christophe, 2025 — Unsuspected diversity and multiple origins of the frog legs imported to Switzerland for human consumption, as determined by DNA barcoding and morphology.. The Science of Nature Naturwissenschaften vol. 112, n° 2, p. 17 Publisher: Springer Verlag tex.hal_id: hal-05006814 tex.hal_version: v1
https://dx.doi.org/10.1007/s00114-025-01968-2
Borzée Amaël, Jang Yikweon, Othman Siti, Groffen Jordy, Maslova Irina, Purevdorj Zoljargal, Yasumiba Kiyomi, Shimada Tomohiko, Yi Yoonjung, Schepina Natalya Alekseevna, Andersen Desiree, Bae Yoonhyuk, Miura Ikuo & Dufresnes Christophe, 2025 — Integrating phylogeographic and phenotypic evidence to delimit deep evolutionary lineages in the Dryophytes japonicus species complex, with an assessment of their conservation needs. Herpetozoa vol. 38, , p. 25-42 Publisher: Austrian Herpetological Society (ÖGH) tex.hal_id: hal-05006829 tex.hal_version: v1
https://dx.doi.org/10.3897/herpetozoa.38.e137747
Aidek Ahmad E., Jablonski Daniel, Dufresnes Christophe, Salimeh Mudar & Omran Yaman, 2025 — « The Composition, Distribution, and Endangerment of the Amphibian Fauna of Syria » in Status of Decline and Conservation of Amphibians of the Middle East: Amphibian Biology, Volume 11, Part 8 Status of Conservation and Decline of Amphibians: Eastern Hemisphere.. , , p. 1-36
ISBN
978-3-031-68985-7
https://dx.doi.org/10.1007/978-3-031-68985-7_1
Bragin Andrey, Litvinchuk Spartak, Borkin Leo, Melnikov Daniel, Skorinov Dmitriy, Jablonski Daniel, Masroor Rafaqat, Lalremsanga Hmar Tlawmte, Mirza Zeeshan, Dufresnes Christophe & Poyarkov Nikolay, décembre 2024 — Hidden on the Roof of the World: Mitochondrial Data Reveals Exceptional Genetic Diversity of Himalayan Ablepharine Skinks (Reptilia: Scincidae). Snake-eyed, or ablepharine skinks, are common residents of the highest mountain ranges on Earth, including the Himalayas, the… Russian Journal of Herpetology vol. 31, n° 6, p. 351-368 ISBN: 1026-2296 Type: 10.30906/1026-2296-2024-31-6-351-368
https://hal.science/hal-04886301
Gorin Vladislav, Orlov Nikolai, Bragin Andrey, Pawangkhanant Parinya, Milto Konstantin, Le Dac Xuan, Nguyen Tan Van, Dufresnes Christophe, Suwannapoom Chatmongkon & Poyarkov Nikolay, décembre 2024 — Phylogeographic pattern and taxonomic revision of the Kaloula baleata species complex (Amphibia, Anura, Microhylidae) with description of two new species from Indochina. Despite increased attention by molecular taxonomists, the herpetofauna of Southeast Asia still hides many undescribed species… Herpetozoa vol. 37, , p. 391-420 ISBN: 1013-4425 Publisher: Austrian Herpetological Society (ÖGH) Type: 10.3897/herpetozoa.37.e137394
https://hal.science/hal-04886307
Gaczorek Tomek, Dudek Katarzyna, Fritz Uwe, Bahri-Sfar Lilia, Baird Stuart Je, Bonhomme François, Dufresnes Christophe, Gvoždík Václav, Irwin Darren, Kotlík Petr, Marková Silvia, Mcginnity Philip, Migalska Magdalena, Moravec Jiří, Natola Libby et al., septembre 2024 — Widespread adaptive introgression of major histocompatibility complex genes across vertebrate hybrid zones. Interspecific introgression is a potentially important source of novel variation of adaptive significance. Although multiple… Molecular Biology and Evolution vol. 41, n° 10, msae201 ISBN: 0737-4038 Publisher: Oxford University Press (OUP) Type: 10.1093/molbev/msae201
https://hal.umontpellier.fr/hal-04824354
Dufresnes Christophe, Ghielmi Samuele, Halpern Bálint, Martínez-Freiría Fernando, Mebert Konrad, Jelić Dusan, Crnobrnja-Isailović Jelka, Gippner Sven, Jablonski Daniel, Joger Ulrich, Laddaga Lorenzo, Petrovan Silviu, Tomović Ljiljana, Vörös Judit, İğci Naşit et al., août 2024 — Phylogenomic insights into the diversity and evolution of Palearctic vipers.

Despite decades of molecular research, phylogenetic relationships in Palearctic vipers (genus Vipera) still essentially… Molecular Phylogenetics and Evolution vol. 197, , p. 108095 ISBN: 1055-7903 Publisher: Elsevier Type: 10.1016/j.ympev.2024.108095

https://hal.science/hal-04886392
Jiménez-Mejías Pedro, Manzano Saúl, Gowda Vinita, Krell Frank-Thorsten, Lin Mei-Ying, Martín-Bravo Santiago, Martín-Torrijos Laura, Nieto Feliner Gonzalo, Mosyakin Sergei, Naczi Robert, Acedo Carmen, Álvarez Inés, Crisci Jorge, Luceño Garcés Modesto, Manning John et al., juin 2024 — Protecting stable biological nomenclatural systems enables universal communication: A collective international appeal. Abstract The fundamental value of universal nomenclatural systems in biology is that they enable unambiguous scientific… Bioscience , biae043, biae043 Publisher: Oxford University Press (OUP) tex.hal_id: hal-04662116 tex.hal_version: v1
ISSN
0006-3568, 1525-3244
https://dx.doi.org/10.1093/biosci/biae043
Ambu Johanna, Martínez-Solano Íñigo & Dufresnes Christophe, mai 2024 — A new subspecies of midwife toad (Anura, Alytidae, Alytes Wagler, 1829) supported by genomic taxonomy. The mapping, delimiting and naming of biodiversity forge the links between academic research, conservation efforts and… Alytes vol. 41, 1-4, p. 18-39 ISBN: 0753-4973 Publisher: International Society for the Study and Conservation of Amphibians
https://hal.science/hal-04886694
Kazilas Christos, Dufresnes Christophe, France James, Kalaentzis Konstantinos, Martínez-Solano Iñigo, de Visser Manon C, Arntzen Jan W & Wielstra Ben, mai 2024 — Spatial genetic structure in European marbled newts revealed with target enrichment by sequence capture. Molecular Phylogenetics and Evolution vol. 194, , p. 108043 Publisher: Elsevier tex.hal_id: hal-04547713 tex.hal_version: v1
https://dx.doi.org/10.1016/j.ympev.2024.108043
Schmidt Robin, Dufresnes Christophe, Kristin Anton, Kuenzel Sven, Vences Miguel & Hawlitschek Oliver, avril 2024 — Phylogenetic insights into central european chorthippus and pseudochorthippus (orthoptera: Acrididae) species using ddRADseq data. MOLECULAR PHYLOGENETICS AND EVOLUTION vol. 193, , p. 108012 Number: 108012 tex.earlyaccessdate: JAN 2024 tex.eissn: 1095-9513 tex.orcid-numbers: Schmidt, Robin/0000-0003-1269-2553 tex.unique-id: WOS:001166267600001
ISSN
1055-7903
https://dx.doi.org/10.1016/j.ympev.2024.108012
Vences Miguel, Miralles Aurélien & Dufresnes Christophe, février 2024 — Next-generation species delimitation and taxonomy: Implications for biogeography. Journal of Biogeography , , Publisher: Wiley tex.hal_id: hal-04547717 tex.hal_version: v1
https://dx.doi.org/10.1111/jbi.14807
Dufresnes Christophe, Poyarkov Nikolay A & Jablonski Daniel, février 2024 — Reply to Lukhtanov: Polytypic species: Old wine in a new bottle. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America vol. 121, n° 9, e2321819121 Publisher: National Academy of Sciences tex.hal_id: hal-04547709 tex.hal_version: v1
https://dx.doi.org/10.1073/pnas.2321819121
Gippner Sven, Strowbridge Nicholas, Sunje Emina, Capstick Maria, Amat Felix, Bogaerts Serge, Merabet Khaled, Preissler Kathleen, Galan Pedro, Martinez-Solano Izigo, Bonato Lucio, Steinfartz Sebastian, Velo-Anton Guillermo, Dufresnes Christophe, Elmer Kathryn R. et al., 2024 — The effect of hybrids on phylogenomics and subspecies delimitation in ¡i¿Salamandra¡/i¿, a highly diversified amphibian genus. SALAMANDRA vol. 60, n° 2, p. 105-128 tex.unique-id: WOS:001228713200001
ISSN
0036-3375
Kuijt Marit, Oskam Liam, den Boer Ingrid, Dufresnes Christophe, France James, Gilbert Maarten J., de Visser Manon C., Struijk ichard P. J. H. & Wielstra Ben, 2024 — Amphibia-Reptilia (vol 44, pg 1, 2023). AMPHIBIA-REPTILIA vol. 45, n° 1, p. 129 tex.eissn: 1568-5381 tex.orcid-numbers: Wielstra, Ben/0000-0002-7112-5965 tex.researcherid-numbers: Wielstra, Ben/G-3773-2015 tex.unique-id: WOS:001202811800001
ISSN
0173-5373
https://dx.doi.org/10.1163/15685381-244501ER
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Par auteurs

  • Philippe BOUCHET
  • Thierry BOURGOIN
  • Christiane DENYS
  • Thierry DE FONTAINE DE RESBECQ DEUVE
  • Alain DUBOIS
  • Romain GARROUSTE
  • Jean-Bernard HUCHET
  • Ivan INEICH
  • Corentin JOUAULT
  • Aurélien MIRALLES
  • Violaine NICOLAS-COLIN
  • Annemarie OHLER
  • Germinal ROUHAN
  • Claire VILLEMANT
  • (-) Christophe DUFRESNES

Année

  • 2025
  • 2024

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  • Evolution fonctionnelle et Taxonomie (EvoFoncT)
  • Exploration, Espèces et Evolution (3E)
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  • Systématique, Phylogéographie, Évolution, Conservation (SPEC)

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