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Les tutelles MNHN-CNRS-SU-EPHE-UA

L’Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité est une unité CNRS du Muséum national d’Histoire naturelle de Paris, ayant aussi pour tutelles l’Université Pierre et Marie Curie et l’Ecole Pratique des Hautes Etudes.

L’UMR 7205 a pour objectif de répondre aux questions concernant l’origine de la biodiversité, les modalités de diversification des espèces, la mise en place des communautés animales en lien avec l’évolution spatio-temporelle des taxons. L’unité est un des pôles européens de systématique et contribue de manière importante à la taxonomie et à la biologie de l’évolution. Les approches de systématique phylogénétique privilégiées par l’unité sont intégratives et ont amené la conception d’outils taxonomiques, moléculaires, génétiques, acoustiques, cytogénétiques, morphologiques et morphométriques.

L’Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité (ISYEB) succède à l’OSEB depuis le 1er Janvier 2014. Les laboratoires de l’Institut se trouvent au Jardin des Plantes dans des bâtiments situés rue Buffon et rue Cuvier (Entomologie, Mammifères et Oiseaux, Malacologie, Botanique, Reptiles-Amphibiens, Géologie).

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L’Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité
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Ledoux Jean-Baptiste, Gomez-Garrido Jessica, Cruz Fernando, Camara Ferreira Francisco, Matos Ana, Sarropoulou Xenia, Ramirez-Calero Sandra, Aurelle Didier, Lopez-Sendino Paula, Grayson Natalie, Moore Bradley, Antunes Agostinho, Aguilera Laura, Gut Marta, Salces-Ortiz Judit et al., février 2025 — Chromosome-Level Genome Assembly and Annotation of Corallium rubrum : A Mediterranean Coral Threatened by Overharvesting and Climate Change. Abstract Reference genomes are key resources in biodiversity conservation. Yet, sequencing efforts are not evenly distributed… Genome Biology and Evolution vol. 17, n° 2, ISBN: 1759-6653 Publisher: Society for Molecular Biology and Evolution Type: 10.1093/gbe/evae253
https://hal.science/hal-04935559
Modica Maria Vittoria, Leone Serena, Gerdol Marco, Greco Samuele, Aurelle Didier, Oliverio Marco, Fassio Giulia, El Koulali Khadija, Barrachina Célia & Dutertre Sebastien, 2025 — The proteotranscriptomic characterization of venom in the white seafan Eunicella singularis elucidates the evolution of Octocorallia arsenal. Open Biology vol. 15, n° 3, p. 250015 Publisher: Royal Society tex.hal_id: hal-04997735 tex.hal_version: v1
https://dx.doi.org/10.1098/rsob.250015
Ledoux Jean-Baptiste, Gomez-Garrido Jessica, Cruz Fernando, Camara Ferreira Francisco, Matos Ana, Sarropoulou Xenia, Ramirez-Calero Sandra, Aurelle Didier, Lopez-Sendino Paula, Grayson Natalie, Moore Bradley, Antunes Agostinho, Aguilera Laura, Gut Marta, Salces-Ortiz Judit et al., 2025 — Chromosome-level genome assembly and annotation of corallium rubrum : a mediterranean coral threatened by overharvesting and climate change. Genome Biology and Evolution vol. 17, n° 2, Publisher: Society for Molecular Biology and Evolution tex.hal_id: hal-04935559 tex.hal_version: v1
https://dx.doi.org/10.1093/gbe/evae253
Aurelle D., août 2024 — Scripts for filtering SNPs from RAD sequencing; analysis of Mediterranean octocorals along a depth gradient. , , Type: Scripts and results of the filtering of SNPs for the analysis of genomic differentiation along depths in Mediterranean octocorals. Output from an R Markdown
https://hal.science/hal-04622544
Siuda Amy N. S., Blanfuné Aurélie, Dibner Skye, Verlaque Marc, Boudouresque Charles-François, Connan Solène, Goodwin Deborah S., Stiger-Pouvreau Valérie, Viard Frédérique, Rousseau Florence, Michotey Valérie, Schell Jeffrey M., Changeaux Thomas, Aurelle Didier & Thibaut Thierry, mai 2024 — Morphological and molecular characters differentiate common morphotypes of atlantic holopelagic sargassum. Phycology vol. 4, n° 2, p. 256-275 Publisher: Wiley tex.hal_id: mnhn-04572926 tex.hal_version: v1
ISSN
2673-9410
https://dx.doi.org/10.3390/phycology4020014
Le Gall Line, Corbari Laure, Aurelle D., Bay-Nouailhat Anne, Bay-Nouailhat Wilfried, de Bettignies Thibaut, Duchaud Éric, Marani Gilberto & Bouchet Philippe, janvier 2024 — Bilan scientifiqueLA PLANÈTE REVISITÉE EN CORSE, Volet marin 2019-2021. Le projet La Planète Revisitée en Corse est mené par le Muséum national d’Histoire naturelle (MNHN), la Collectivité de Corse … , , p. 189
https://mnhn.hal.science/mnhn-04552677
Le Gall Line, Corbari Laure, Aurelle Didier, Bay-Nouailhat Anne, Bay-Nouailhat Wilfried, De Bettignies Thibaut, Duchaud Éric, Marani Gilberto & Bouchet Philippe, 2024 — A PLANÈTE REVISITÉE EN CORSE : Volet marin 2019-2021. , , p. 189
Le Gall Line, Corbari Laure, Aurelle D., Bay-Nouailhat Anne, Bay-Nouailhat Wilfried, de Bettignies Thibaut, Duchaud Éric, Marani Gilberto & Bouchet Philippe, janvier 2024 — Bilan scientifiqueLA PLANÈTE REVISITÉE EN CORSE. , , p. 189 tex.hal_id: mnhn-04552677 tex.hal_version: v1
https://mnhn.hal.science/mnhn-04552677
Aurelle Didier, Haguenauer Anne, Blaise Chloé, Reynes Lauric, Arnaud-Haond Sophie, Boavida Joana, Cabau C??dric, Klopp Christophe, Lundalv Tomas, Noûs Camille, Sartoretto Stéphane, Wienberg Claudia, Jiménez Carlos & Orejas Covadonga, 2024 — On the specific status of eastern Mediterranean Dendrophyllia corals (Cnidaria, Anthozoa): Genetic characterization and speciation scenarios. Zoologica Scripta vol. 53, n° 2, p. 235-247 Publisher: Wiley tex.hal_id: hal-04354995 tex.hal_version: v1
https://dx.doi.org/10.1111/zsc.12643
Aurelle Didier, 2024 — Analysis of speciation and hybridization in Mediterranean octocorals. , , tex.hal_id: hal-04544432 tex.hal_version: v1
https://dx.doi.org/10.5281/zenodo.10966625
Aurelle D., Haguenauer A, Bally M., Zuberer F, Guillemain D., Ledoux J.b., Sartoretto S., Cabau C., Lapeyre R., Chaoui L, Kara H, Samadi S. & Pontarotti P, 2024 — Symbiosis, hybridization and speciation in Mediterranean octocorals (Octocorallia, Eunicellidae). BIOLOGICAL JOURNAL OF THE LINNEAN SOCIETY , , p. 1-75
https://goo.gl/scholar/hHCPf6
Sartoretto S., Ledoux Jb, Gueret E., Guillemain D., Ravel C., Moirand L. & Aurelle D., novembre 2023 — Ecological and genomic characterization of a remarkable natural heritage: a mesophotic ‘giant’ Paramuricea clavata forest. Paramuricea clavata is an ecosystem engineer, structuring hard bottom communities in the Mediterranean Sea, from 10 to 200 m… Marine Ecology Progress Series vol. SHIFT, , ISBN: 0171-8630 Publisher: Inter Research Type: 10.3354/meps14427
https://hal.science/hal-04342474
Reynes Lauric, Fouqueau Louise, Aurelle Didier, Mauger Stéphane, Destombe Christophe & Valero Myriam, novembre 2023 — Temporal genomics help in deciphering neutral and adaptive patterns in the contemporary evolution of kelp populations. ABSTRACT The long-term persistence of species in the face of climate change can be evaluated by examining the interplay between… Journal of Evolutionary Biology , , Type: 10.1101/2023.05.22.541724
https://dx.doi.org/10.1093/jeb/voae048
Oury Nicolas, Noël Cyril, Mona Stefano, Aurelle Didier & Magalon Hélène, mai 2023 — From genomics to integrative species delimitation? The case study of the Indo-Pacific Pocillopora corals. Molecular Phylogenetics and Evolution vol. 184, , p. 107803 Pages: 107803 Type: 10.1016/j.ympev.2023.107803
ISSN
10557903
https://dx.doi.org/10.1016/j.ympev.2023.107803
Coelho Márcio a G, Pearson Gareth A, Boavida Joana R H, Paulo Diogo, Aurelle Didier, Arnaud-haond Sophie, Gómez-gras Daniel, Bensoussan Nathaniel, López-sendino Paula, Cerrano Carlo, Kipson Silvija, Bakran-petricioli Tatjana, Ferretti Eliana, Linares Cristina, Garrabou Joaquim et al., 2023 — Not out of the Mediterranean: Atlantic populations of the gorgonian Paramuricea clavata are a separate sister species under further lineage diversification. Ecology and Evolution vol. 13, n° 1, Publisher: Wiley Open Access tex.hal_id: hal-03962833 tex.hal_version: v1
https://dx.doi.org/10.1002/ece3.9740
Oury Nicolas, Noël Cyril, Mona Stefano, Aurelle Didier & Magalon Helene, 2022 — From Genomics to Integrative Taxonomy? The Case Study of Pocillopora Corals. Abstract With the advent of genomics, sequencing thousands of loci from hundreds of individuals now appears feasible at… bioRxiv PREPRINT , , PREPRINT
https://dx.doi.org/DOI: 10.1101/2022.10.04.510617
Tignat-Perrier Romie, van de Water Jeroen A. J. M., Guillemain Dorian, Aurelle Didier, Allemand Denis & Ferrier-Pagès Christine, 2022 — The Effect of Thermal Stress on the Physiology and Bacterial Communities of Two Key Mediterranean Gorgonians. In the Mediterranean Sea, the tree-shaped gorgonian corals form large forests that provide a place to live for many species… Applied and Environmental Microbiology vol. 88, n° 6, e02340–21
ISSN
0099-2240, 1098-5336
https://dx.doi.org/10.1128/aem.02340-21
Aurelle D., Desnues Christelle, Sartoretto Stephane, Rozis Emma, Bouchard Sonia, Guillemain Dorian, Moirand Laurine, Chenesseau Sandrine, Pontarotti Pierre, Accornero Alessandra, Poggiale Jean-Christophe, Chaoui Lamya, Hichem Kara M., Eda Topçu Nur, Samadi Sarah et al., 2022 — « Holobiont diversity in heterogeneous and anthropized marine environments » in Ecology and Evolution: New perspectives and societal challenges.. Marine biodiversity is impacted by local and global anthropic pressures. In this context, it is crucial to better understand… Colloque Ecology and Evolution: New perspectives and societal challenges. Metz France , , tex.hal_id: hal-03947518 tex.hal_version: v1
https://hal.science/hal-03947518
Gazulla Carlota, López-Sendino Paula, Antunes Agostinho, Aurelle Didier, Montero-Serra Ignasi, Dominici Jean-Marie, Linares Cristina, Garrabou Joaquim & Ledoux Jean-Baptiste, juin 2021 — Demo-Genetic Approach for the Conservation and Restoration of a Habitat-Forming Octocoral: The Case of Red Coral, Corallium rubrum, in the Réserve Naturelle de Scandola. Marine protected areas (MPAs) are one of the most efficient conservation tools to buffer marine biodiversity loss induced by… Frontiers in Marine Science vol. 8, , ISBN: 2296-7745 Publisher: Frontiers Media Type: 10.3389/fmars.2021.633057
https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-03276401
Reynes Lauric, Thibaut Thierry, Mauger Stéphane, Blanfuné Aurelie, Holon Florian, Cruaud Corinne, Couloux Arnaud, Valero Myriam & Aurelle Didier, 2021 — Genomic signatures of clonality in the deep water kelp Laminaria rodriguezii. Molecular Ecology vol. 30, n° 8, p. 1806-1822
ISSN
0962-1083
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  • Philippe BOUCHET
  • Magalie CASTELIN
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  • Stefano MONA
  • Nicolas PUILLANDRE
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  • Atelier de bio-informatique (ABI)
  • Diversification et adaptation aux échelles micro et macro-évolutives (DIVA)
  • Exploration, Espèces et Evolution (3E)
  • Phylogénomique, phylodynamique et interactions hôtes-pathogènes (PhyloPath)

Organisme de rattachement

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