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Les tutelles MNHN-CNRS-SU-EPHE-UA

L’Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité est une unité CNRS du Muséum national d’Histoire naturelle de Paris, ayant aussi pour tutelles l’Université Pierre et Marie Curie et l’Ecole Pratique des Hautes Etudes.

L’UMR 7205 a pour objectif de répondre aux questions concernant l’origine de la biodiversité, les modalités de diversification des espèces, la mise en place des communautés animales en lien avec l’évolution spatio-temporelle des taxons. L’unité est un des pôles européens de systématique et contribue de manière importante à la taxonomie et à la biologie de l’évolution. Les approches de systématique phylogénétique privilégiées par l’unité sont intégratives et ont amené la conception d’outils taxonomiques, moléculaires, génétiques, acoustiques, cytogénétiques, morphologiques et morphométriques.

L’Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité (ISYEB) succède à l’OSEB depuis le 1er Janvier 2014. Les laboratoires de l’Institut se trouvent au Jardin des Plantes dans des bâtiments situés rue Buffon et rue Cuvier (Entomologie, Mammifères et Oiseaux, Malacologie, Botanique, Reptiles-Amphibiens, Géologie).

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Bonnefous H., Teulière J., Lapointe F.J., Lopez P. & Bapteste E., 2024 — Most genetic roots of fungal and animal aging are hundreds of millions of years old according to phylostratigraphy analyses of aging networks.. GeroScience , ,
https://dx.doi.org/https://rdcu.be/dKFlV
Bonnefous H, Teulière J, Lapointe FJ, Lopez P & Bapteste E, 2024 — Most genetic roots of fungal and animal aging are hundreds of millions of years old according to phylostratigraphy analyses of aging networks.. GEROSCIENCE , ,
ISSN
2509-2715
https://dx.doi.org/10.1007/s11357-024-01234-9
Denoeud France, Godfroy Olivier, Cruaud Corinne, Heesch Svenja, Nehr Zofia, Tadrent Nachida, Couloux Arnaud, Brillet-Guéguen Loraine, Delage Ludovic, Mckeown Dean, Motomura Taizo, Sussfeld Duncan, Fan Xiao, Mazéas Lisa, Terrapon Nicolas et al., 2024 — Evolutionary genomics of the emergence of brown algae as key components of coastal ecosystems. Brown seaweeds are keystone species of coastal ecosystems, often forming extensive underwater forests, and are under… Cell , , ISBN: 0092-8674 Publisher: Elsevier Type: 10.1016/j.cell.2024.10.049
https://hal.science/hal-04794231
Bapteste Éric, 2024 — The ageing virus hypothesis: Epigenetic ageing beyond the Tree of Life. BioEssays , , p. 2400099
ISSN
0265-9247, 1521-1878
https://dx.doi.org/10.1002/bies.202400099
Denoeud France, Godfroy Olivier, Cruaud Corinne, Heesch Svenja, Nehr Zofia, Tadrent Nachida, Couloux Arnaud, Brillet-Guéguen Loraine, Delage Ludovic, Mckeown Dean, Motomura Taizo, Sussfeld Duncan, Fan Xiao, Mazéas Lisa, Terrapon Nicolas et al., 2024 — Evolutionary genomics of the emergence of brown algae as key components of coastal ecosystems. Cell vol. 187, n° 24, 6943–6965.e39
ISSN
00928674
https://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2024.10.049
Bernard Charles, Li Yanyan, Lopez Philippe & Bapteste Eric, avril 2023 — Large-Scale Identification of Known and Novel RRNPP Quorum-Sensing Systems by RRNPP_Detector Captures Novel Features of Bacterial, Plasmidic, and Viral Coevolution. Abstract Gram-positive Firmicutes bacteria and their mobile genetic elements (plasmids and bacteriophages) encode peptide-based… Molecular Biology and Evolution vol. 40, n° 4, ISBN: 0737-4038 Publisher: Oxford University Press (OUP) Type: 10.1093/molbev/msad062
https://hal.science/hal-04246120
Teulière J, Bernard C, Bonnefous H, Martens J, Lopez P & Bapteste E, 2023 — Interactomics: dozens of viruses, co-evolving with humans, including the influenza A virus, may actively distort human ageing. Abstract Some viruses (e.g. HIV-1, SARS-CoV-2) have been experimentally proposed to accelerate features of human ageing and of… MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION vol. 40, n° 2, msad012
ISSN
0737-4038
https://dx.doi.org/10.1093/molbev/msad012
Aggarwal Shifu, Huang Elaine, Do Hackwon, Makthal Nishanth, Li Yanyan, Bapteste Eric, Lopez Philippe, Bernard Charles & Kumaraswami Muthiah, 2023 — The leaderless communication peptide (LCP) class of quorum-sensing peptides is broadly distributed among Firmicutes. Abstract The human pathogen Streptococcus pyogenes secretes a short peptide (leaderless communication peptide, LCP) that… Nature Communications vol. 14, n° 1, p. 5947
ISSN
2041-1723
https://dx.doi.org/10.1038/s41467-023-41719-3
Bapteste Eric, Huneman Philippe, Keller Laurent, Teulière Jérôme, Lopez Philippe, Teeling Emma C., Lindner Ariel B., Baudisch Annette, Ludington William B. & Franceschi Claudio, 2023 — Expanding evolutionary theories of ageing to better account for symbioses and interactions throughout the Web of Life. How, when, and why organisms age are fascinating issues that can only be fully addressed by adopting an evolutionary… Ageing Research Reviews vol. 89, , p. 101982
ISSN
1568-1637
https://dx.doi.org/10.1016/j.arr.2023.101982
Lemieux-Labonté Virginie, Vigliotti Chloé, Tadic Zoran, Wehrle Beck, Lopez Philippe, Bapteste Eric, Lapointe François-Joseph, German Donovan P. & Herrel Anthony, 2022 — Proximate Drivers of Population-Level Lizard Gut Microbial Diversity: Impacts of Diet, Insularity, and Local Environment. Microorganisms vol. 10, n° 8, p. 1550
ISSN
2076-2607
https://dx.doi.org/10.3390/microorganisms10081550
Ocaña-Pallarès Eduard, Williams Tom A., López-Escardó David, Arroyo Alicia S., Pathmanathan Jananan S., Bapteste Eric, Tikhonenkov Denis V., Keeling Patrick J., Szöllősi Gergely J. & Ruiz-Trillo Iñaki, 2022 — Divergent genomic trajectories predate the origin of animals and fungi. Abstract Animals and fungi have radically distinct morphologies, yet both evolved within the same eukaryotic supergroup:… Nature vol. 609, n° 7925, p. 1-7
ISSN
0028-0836, 1476-4687
https://dx.doi.org/10.1038/s41586-022-05110-4
Teulière Jérôme, Bernard Charles, Corel Eduardo, Lapointe François-Joseph, Martens Johannes, Lopez Philippe & Bapteste Eric, 2022 — Network analyses unveil ageing-associated pathways evolutionarily conserved from fungi to animals. GeroScience , ,
ISSN
2509-2715, 2509-2723
https://dx.doi.org/10.1007/s11357-022-00704-2
Watson Andrew, Lopez Philippe & Bapteste Eric, 2022 — Hundreds of Out-of-Frame Remodeled Gene Families in the Escherichia coli Pangenome. Molecular Biology and Evolution vol. 39, n° 1, msab329 Publisher: Oxford University Press (OUP) tex.hal_id: hal-03820636 tex.hal_version: v1
ISSN
0737-4038, 1537-1719
https://dx.doi.org/10.1093/molbev/msab329
Bernard Guillaume, Teuliere Jerome, Lopez Philippe, Corel Eduardo, Lapointe Francois-Joseph & Bapteste Eric, 2022 — Aging at Evolutionary Crossroads: Longitudinal Gene Co-expression Network Analyses of Proximal and Ultimate Causes of Aging in Bats. Molecular Biology and Evolution vol. 39, n° 1, msab302
ISSN
0737-4038
https://dx.doi.org/10.1093/molbev/msab302
Bapteste Eric, 2022 — Tout se transforme ! Comment marche l’évolution. Illustrations Mélie Lychee.. , , dir. Circonflexe
ISBN
EAN : 9782378623814
https://www.circonflexe.fr/catalogue/a-paraitre/tout-se-transforme-comment-marche-l-evolution
Bapteste Eric, 2022 — Le monde surprenant des microbes Virus, bactéries, archées.... , , dir. Editons Circonflexe
https://www.circonflexe.fr/catalogue/ouvrage/le-monde-surprenant-des-microbes-9782378624255
Watson Andrew K, Lopez Philippe & Bapteste Eric, novembre 2021 — Hundreds of out-of-frame remodelled gene families in the E. coli pangenome. Molecular Biology and Evolution , , msab329 Publisher: Oxford University Press (OUP) tex.hal_id: hal-03451955 tex.hal_version: v1
https://dx.doi.org/10.1093/molbev/msab329/6430988
Bernard Charles, Li Yanyan, Bapteste Eric & Lopez Philippe, octobre 2021 — RRNPP_detector: a tool to detect RRNPP quorum sensing systems in chromosomes, plasmids and phages of gram-positive bacteria. ABSTRACT Gram-positive bacteria (e.g. Firmicutes) and their mobile genetic elements (plasmids, bacteriophages) encode peptide… , , Type: 10.1101/2021.08.18.456871
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03384406
Bernard Charles, Li Yanyan, Lopez Philippe & Bapteste Eric, octobre 2021 — Large-scale identification of viral quorum sensing systems reveals density-dependent sporulation-hijacking mechanisms in bacteriophages. Communication between viruses supported by quorum sensing systems (QSSs) were found to optimize the fitness of temperate… , , Type: 10.1101/2021.07.15.452460
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03384404
Teulière Jérôme, Bernard Charles & Bapteste Eric, septembre 2021 — Interspecific interactions that affect ageing: Age-distorters manipulate host ageing to their own evolutionary benefits. Ageing Research Reviews vol. 70, , p. 101375
ISSN
15681637
https://dx.doi.org/10.1016/j.arr.2021.101375
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