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Les tutelles MNHN-CNRS-SU-EPHE-UA

L’Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité est une unité CNRS du Muséum national d’Histoire naturelle de Paris, ayant aussi pour tutelles l’Université Pierre et Marie Curie et l’Ecole Pratique des Hautes Etudes.

L’UMR 7205 a pour objectif de répondre aux questions concernant l’origine de la biodiversité, les modalités de diversification des espèces, la mise en place des communautés animales en lien avec l’évolution spatio-temporelle des taxons. L’unité est un des pôles européens de systématique et contribue de manière importante à la taxonomie et à la biologie de l’évolution. Les approches de systématique phylogénétique privilégiées par l’unité sont intégratives et ont amené la conception d’outils taxonomiques, moléculaires, génétiques, acoustiques, cytogénétiques, morphologiques et morphométriques.

L’Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité (ISYEB) succède à l’OSEB depuis le 1er Janvier 2014. Les laboratoires de l’Institut se trouvent au Jardin des Plantes dans des bâtiments situés rue Buffon et rue Cuvier (Entomologie, Mammifères et Oiseaux, Malacologie, Botanique, Reptiles-Amphibiens, Géologie).

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Pang Ka-Lai, Jones E., Abdel-Wahab Mohamed, Adams Sarah, Alves Artur, Azevedo Egídia, Bahkali Ali, Barata Margarida, Burgaud Gaëtan, Caeiro Maria Filomena, Calabon Mark, Devadatha Bandarupalli, Dupont Joëlle, Fryar Sally, González Maria et al., août 2023 — Recent progress in marine mycological research in different countries, and prospects for future developments worldwide. Early research on marine fungi was mostly descriptive, with an emphasis on their diversity and taxonomy, especially of those… Botanica Marina vol. 66, n° 4, p. 239-269 ISBN: 0006-8055 Publisher: De Gruyter Type: 10.1515/bot-2023-0015
https://nantes-universite.hal.science/hal-04771647
Bourgeois Thomas, Suffert Frédéric, Dury Gérard, Biau Gwenola, Lacoste Sandrine, Dupont Jöelle, Prado Soizic & Saumon Sandrine, août 2023 — Dietary preferences of Heteromurus nitidus (Collembola) among wheat fungal communities: Implications for bioregulation of two widespread pathogens. Applied Soil Ecology vol. 188, , p. 104897 Publisher: Elsevier tex.hal_id: hal-04085273 tex.hal_version: v1
https://dx.doi.org/10.1016/j.apsoil.2023.104897
Menelle Pauline, Quintin Jérôme, Cottet Kevin, Fromentin Yann, Dupont Joëlle, Lallemand Marie-Christine & Buisson Didier, 2021 — Biotransformation of guttiferones, Symphonia globulifera metabolites, by Bipolaris cactivora , an endophytic fungus isolated from its leaves. Organic & Biomolecular Chemistry , , 10.1039.D0OB02443K
ISSN
1477-0520, 1477-0539
https://dx.doi.org/10.1039/D0OB02443K
Navarro David, Chaduli Delphine, Taussac Sabine, Lesage-Meessen Laurence, Grisel Sacha, Haon Mireille, Callac Philippe, Courtecuisse Régis, Decock Cony, Dupont Joëlle, Richard-Forget F., Fournier Jacques, Guinberteau Jacques, Lechat Christian, Moreau Pierre-Arthur et al., 2021 — Large-scale phenotyping of 1,000 fungal strains for the degradation of non-natural, industrial compounds. Fungal biotechnology is set to play a keystone role in the emerging bioeconomy, notably to address pollution issues arising… Communications Biology vol. 4, n° 1, p. 871 Accession Number: 34267314 ISBN: 2399-3642 Publisher: Nature Publishing Group Type: 10.1038/s42003-021-02401-w
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03313721
Vallet Marine, Strittmatter Martina, Murúa Pedro, Lacoste Sandrine, Dupont Joëlle, Hubas Cédric, Genta-Jouve Grégory, Gachon Claire M M, Kim Gwang Hoon & Prado Soizic, 2018 — Chemically-mediated interactions between macroalgae, their fungal endophytes, and protistan pathogens. Frontiers in Microbiology vol. 9, , p. 3161 Publisher: Frontiers Media tex.hal_id: hal-02297595 tex.hal_version: v1 tex.pdf: https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-02297595/file/Vallet%20et%20al.%20-%202018%20-%20Chemically-Mediated%20Interactions%20Between%20Macroalga.pdf
https://dx.doi.org/10.3389/fmicb.2018.03161
Fernand Maherizo Gedice, Roullier Catherine C, Guitton Yann, Lalande Julie, Lacoste Sandrine, Dupont Joëlle, Ruiz Nicolas, Pouchus Yves François, Raheriniaina Christian & Ranaivoson Eulalie, octobre 2017 — Fungi isolated from Madagascar shrimps - investigation of the Aspergillus niger metabolism by combined LC-MS and NMR metabolomics studies. Aquaculture (Amsterdam, Netherlands) vol. 479, , p. 750-758 Publisher: Elsevier tex.hal_id: hal-03015843 tex.hal_version: v1
https://dx.doi.org/10.1016/j.aquaculture.2017.07.015
Dupont Joëlle, Dequin Sylvie, Giraud Tatiana, Le Tacon François, Marsit Souhir, Ropars Jeanne, Richard Franck & Selosse Marc-André, 2017 — Fungi as a Source of Food. ABSTRACT In this article, we review some of the best-studied fungi used as food sources, in particular, the cheese fungi, the… Microbiology Spectrum vol. 5, n° 3, 5.3.09
ISSN
2165-0497
https://dx.doi.org/10.1128/microbiolspec.FUNK-0030-2016
Comby Morgane, Gacoin Marie, Robineau Mathilde, Rabenoelina Fanja, Ptas Sébastien, Dupont Joëlle, Profizi Camille & Baillieul Fabienne, 2017 — Screening of wheat endophytes as biological control agents against Fusarium head blight using two different in vitro tests. Microbiological Research vol. 202, , p. 11-20
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09445013
https://dx.doi.org/10.1016/j.micres.2017.04.014
Comby Morgane, Lacoste Sandrine, Baillieul Fabienne, Profizi Camille & Dupont Joelle, mars 2016 — Spatial and Temporal Variation of Cultivable Communities of Co-occurring Endophytes and Pathogens in Wheat. Frontiers in Microbiology vol. 7, , p. 403 WOS:000373276400001
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https://dx.doi.org/10.3389/fmicb.2016.00403
Ropars J, Lo YC, Dumas E, Snirc A, Begerow D, Rollnik T, Lacoste S, Dupont J, Giraud T & López-Villavicencio M, 2016 — Fertility depression among cheese-making Penicillium roqueforti strains suggests degeneration during domestication. EVOLUTION vol. 70, n° 9, p. 2099-2109
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0014-3820
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Dupont Joëlle & Schwabe Enrico, 2016 — First evidence of the deep-sea fungus Oceanitis scuticella Kohlmeyer (Halosphaeriaceae, Ascomycota) from the Northern Hemisphere. Botanica Marina , ,
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Ropars J, de la Vega RCR, López-Villavicencio M, Dupont J, Swennen D, Dumas E, Giraud T & Branca A, 2016 — « Diversity and mechanisms of genomic adaptation in Penicillium » in Aspergillus and Penicillium in the Post-Genomic Era.. , , dir. Caister Academic Press p. 27-42 Pages: 42
ISBN
978-1-910190-39-5
Vallet Marine, Du Kady, Strittmatter Martina, Dupont Joelle & Gachon Claire M. M., 2015 — Biodiversity, secondary metabolome and ecological role of fungal endophytes associated with the brown algae Laminaria digitata, ascophyllum nodosum, Saccharina latissima and Pelvetia canaliculata. European Journal of Phycology vol. 50, , p. 116 WOS:000360244400195
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0967-0262
Gillot G, Jany JL, Coton M, Le Floch G, Debaets S, Ropars J, López-Villavicencio M, Dupont J, Branca A, Giraud T & Coton E, 2015 — Insights into Penicillium roqueforti Morphological and Genetic Diversity. PLOS ONE vol. 10, n° 6, e0129849 WOS:000356835000067
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1932-6203
https://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0129849
Khoyratty Shahnoo, Dupont Joelle, Lacoste Sandrine, Palama Tony Lionel, Choi Young Hae, Kim Hye Kyong, Payet Bertrand, Grisoni Michel, Fouillaud Mireille, Verpoorte Robert & Kodja Hippolyte, 2015 — Fungal endophytes of Vanilla planifolia across Reunion Island: isolation, distribution and biotransformation. Bmc Plant Biology vol. 15, , p. 142 WOS:000356052700001
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1471-2229
https://dx.doi.org/10.1186/s12870-015-0522-5
Ropars J, de la Vega RCR, López-Villavicencio M, Gouzy J, Sallet E, Dumas E, Lacoste S, Debuchy R, Dupont J, Branca A & Giraud T, 2015 — Adaptive Horizontal Gene Transfers between Multiple Cheese-Associated Fungi. CURRENT BIOLOGY vol. 25, n° 19, p. 2562-2569
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0960-9822
https://dx.doi.org/10.1016/j.cub.2015.08.025
Petit Vanessa W, Rolland Jean-Luc, Blond Alain, Cazevieille Chantal, Djediat Chakib, Peduzzi Jean, Goulard Christophe, Bachère Evelyne, Dupont Joëlle, Destoumieux-Garzón Delphine & Rebuffat Sylvie, 2015 — A hemocyanin-derived antimicrobial peptide from the penaeid shrimp adopts an alpha-helical structure that specifically permeabilizes fungal membranes. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - General Subjects vol. 1860, n° 3, p. 557-568 Publisher: Elsevier tex.hal\_id: hal-01259500 tex.hal\_version: v1
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https://dx.doi.org/10.1016/j.bbagen.2015.12.010
Tian Yuan, Arnand Severine, Buisson Didier, Kunz Caroline, Hachette Francois, Dupont Joelle, Nay Bastien & Prado Soizic, décembre 2014 — The fungal leaf endophyte Paraconiothyrium variabile specifically metabolizes the host-plant metabolome for its own benefit. Phytochemistry vol. 108, , p. 95-101 WOS:000347597400010
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https://dx.doi.org/10.1016/j.phytochem.2014.09.021
Ropars J, López-Villavicencio M, Dupont J, Snirc A, Gillot G, Coton M, Jany JL, Coton E & Giraud T, 2014 — Induction of sexual reproduction and genetic diversity in the cheese fungus Penicillium roqueforti. EVOLUTIONARY APPLICATIONS vol. 7, n° 4, p. 433-441
ISSN
1752-4571
https://dx.doi.org/10.1111/eva.12140
Cheeseman Kevin, Ropars Jeanne, Renault Pierre, Dupont Joelle, Gouzy Jerome, Branca Antoine, Abraham Anne-Laure, Ceppi Maurizio, Conseiller Emmanuel, Debuchy Robert, Malagnac Fabienne, Goarin Anne, Silar Philippe, Lacoste Sandrine, Sallet Erika et al., 2014 — Multiple recent horizontal transfers of a large genomic region in cheese making fungi. Nature Communications vol. 5, , p. 2876 WOS:000331077800001
ISSN
2041-1723
https://dx.doi.org/10.1038/ncomms3876
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