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Systématique, Phylogéographie, Évolution, Conservation (SPEC)
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violaine.colin [at] mnhn.fr
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01 49 79 48 52
Adresse(s)

45 rue Buffon
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75005 Paris

Responsabilités dans l'unité

Directrice de l’Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité (ISYEB)

Responsabilités hors unité

Membre du Conseil Scientifique du Département Origines et Evolution du MNHN

Membre du Comité de pilotage Bases de données naturalistes du Muséum

Membre du comité Scientifique de l’OSU ECCE TERRA

Bien-être animal:

          - Membre du Comité Cuvier d’éthique en expérimentation animale,

          - Représentante de l’ISYEB au sein de l’Etablissement Utilisateur « faune sauvage non-hébergée » du Muséum,

          - Membre de la Structure Chargée du Bien Etre Animal au sein de l’Etablissement Utilisateur « faune sauvage non-hébergée » du Muséum.

Membre du « scientific advisory committee » du Museum d’Histoire Naturelle de Bonn (Allemagne)

Collections

Présentation

Axes de recherche

Mes travaux ont pour but de mieux comprendre l’origine, la structure et l’évolution de la biodiversité. Je m’intéresse en particulier aux facteurs impliqués dans la diversification des taxons, et aux déterminants de la variabilité phénotypique.

Ces questions sont abordées dans une perspective évolutive, où les processus historiques, développementaux et environnementaux sont examinés conjointement à différentes échelles spatio-temporelles.

Ces travaux sont profondément ancrés dans l’exploitation et l’enrichissement des collections d’histoire naturelle et reposent sur des études de taxonomie intégrative. Avec mes collaborateurs nous combinons des études de phylogénie et de phylogéographie, de morphométrie, de cytogénétique et d’écologie.

Les données moléculaires sont utilisées pour reconstruire les relations de parenté entre taxons, dater les évènements de divergence, et inférer l’histoire démographique des taxons.

Les analyses de modélisation de niche écologique permettent d’inférer les distributions actuelles et passées des taxons.

La morphométrie géométrique (2D et 3D) permet de quantifier finement les patrons de variation et d’évolution des formes aux échelles micro- et macroévolutives.

Ces données, combinés aux données paléoclimatiques et tectoniques, nous permettent d’identifier les principales périodes de diversification et les facteurs géo-climatiques associés et de discuter des modèles de diversification (modèle géographique et écologique). De plus, la combinaison d’études phylogénétiques comparatives, d’étude de modularité et d’études morpho-fonctionnelles nous permet d’identifier les processus évolutifs impliqués dans la diversification des phénotypes.

 

Bandeau violaine Colin

Mots clés : Systématique, Biologie évolutive, Phylogénie, Phylogéographie, Diversité phénotypique, Conservation de la biodiversité

 

 

 

 

Publications

2024
  • Jiménez-Mejías Pedro, Manzano Saúl, Gowda Vinita, Krell Frank-Thorsten, Lin Mei-Ying, Martín-Bravo Santiago, Martín-Torrijos Laura, Nieto Feliner Gonzalo, Mosyakin Sergei, Naczi Robert, Acedo Carmen, Álvarez Inés, Crisci Jorge, Luceño Garcés Modesto, Manning John et al., juin 2024Protecting stable biological nomenclatural systems enables universal communication: A collective international appeal. Abstract The fundamental value of universal nomenclatural systems in biology is that they enable unambiguous scientific… Bioscience , biae043, biae043 Publisher: Oxford University Press (OUP) tex.hal_id: hal-04662116 tex.hal_version: v1
    ISSN
    0006-3568, 1525-3244
  • Bryja Josef, Kerbis Peterhans Julian C, Lavrenchenko Leonid A, Nicolas Violaine, Denys Christiane, Bryjová Anna, Šumbera Radim & Mikula Ondřej, mai 2024Integrative taxonomic revision of the African thicket rats (Murinae: Grammomys ): how genomics decreases the number of currently recognized species. Abstract Thicket rats of the genus Grammomys are partly arboreal rodents distributed across a large part of sub-Saharan Africa… Zoological Journal of the Linnean Society , , zlae057 tex.earlyaccessdate: MAY 2024 tex.eissn: 1096-3642 tex.unique-id: WOS:001230690000001
    ISSN
    0024-4082, 1096-3642
  • Clements Hayley S., Do Linh San Emmanuel, Hempson Gareth, Linden Birthe, Maritz Bryan, Monadjem Ara, Reynolds Chevonne, Siebert Frances, Stevens Nicola, Biggs Reinette, De Vos Alta, Blanchard Ryan, Child Matthew, Esler Karen J., Hamann Maike et al., 2024The bii4africa dataset of faunal and floral population intactness estimates across Africa’s major land uses. Abstract Sub-Saharan Africa is under-represented in global biodiversity datasets, particularly regarding the impact of land use… Scientific Data vol. 11, n° 1, p. 191 Number: 191 tex.eissn: 2052-4463 tex.orcid-numbers: Nowak, Katarzyna/0000-0002-4992-7910 Radlofff, Frans/0000-0001-5309-1506 McIntyre, Trevor/0000-0001-8395-7550 Carvalho, Filipe/0000-0003-2161-5293 Meller, Paulina/0000-0001-6711-4385 Measey, John/0000-00
    ISSN
    2052-4463
  • Mostafavi Ehsan, Mohammadpour Roya, Esmaeili Saber, Mahmoudi Ahmad, Salehi-Vaziri Mostafa, Ghasemi Ahmad, Rohani Mahdi, Mohammadi Ali, Eybpoosh Sana, Baseri Neda, Denys Christiane, Maurin Max, Nicolas Violaine, Lalis Aude & Hugot Jean-Pierre, 2024The Epidemiological Investigation of Yersinia pestis, Francisella tularensis, and Arenavirus Infections in Small Mammals in Northwestern Iran. Background: The control and prevention of rodent-borne diseases are mainly based on our knowledge of ecology and the infectious… Vector-Borne and Zoonotic Diseases , , Publisher: Mary Ann Liebert, Inc., publishers
    ISSN
    1530-3667
2023
  • Ayoro Joelle Halamoussa, Nicolas Violaine, Segniagbeto Gabriel Hoinsoude, Hema Emmanuel Midibahaye, Ohler Annemarie & Kabre Gustave Boureima, 2023Potential impact of climate change on spatial distribution of two savannah amphibian species in West Africa. AFRICAN JOURNAL OF ECOLOGY vol. 61, n° 4, p. 878-889 tex.earlyaccessdate: JUN 2023 tex.eissn: 1365-2028 tex.orcid-numbers: Ohler, Annemarie/0000-0001-6531-464X Segniagbeto, Gabriel Hoinsoude/0000-0002-4697-3671 nicolas, violaine/0000-0001-5384-7529 AYORO, Halamoussa/0000-0001-8690-4569 tex.researcherid-numb
    ISSN
    0141-6707
  • Dianat Malahat, Konečný Adam, Lavrenchenko Leonid A., Kerbis Peterhans Julian C., Demos Terrence C., Nicolas Violaine, Ortiz David & Bryja Josef, 2023How to cross the desert if you are small and need mountains? OutofEthiopia dispersal in Afromontane shrews. Abstract Aim The Eastern Afromontane Biodiversity Hotspot (EABH) offers an ideal location to investigate the evolutionary… Journal of Biogeography vol. 51, n° 2, jbi.14748 tex.earlyaccessdate: OCT 2023 tex.eissn: 1365-2699 tex.orcid-numbers: Ortiz, David/0000-0001-7904-6463 Dianat, Malahat/0000-0001-5393-1165 Bryja, Josef/0000-0003-0516-7742 nicolas, violaine/0000-0001-5384-7529 Demos, Terrence/0000-0003-0522-3708 tex.resea
    ISSN
    0305-0270, 1365-2699
  • Dianat Malahat, Voet Inessa, Ortiz David, Goüy de Bellocq Joëlle, Cuypers Laura N., Kryštufek Boris, Bureš Michal, Čížková Dagmar, Bryjová Anna, Bryja Josef, Nicolas Violaine & Konečný Adam, 2023Cryptic diversity of Crocidura shrews in the savannahs of Eastern and Southern Africa. Molecular Phylogenetics and Evolution vol. 180, n° 2, p. 107708 Number: 107708 tex.earlyaccessdate: JAN 2023 tex.eissn: 1095-9513 tex.orcid-numbers: Dianat, Malahat/0000-0001-5393-1165 Bryja, Josef/0000-0003-0516-7742 Gouy de Bellocq, Joelle/0000-0001-5831-6284 Ortiz, David/0000-0001-7904-6463 Cizkova, Dagmar/0000-000
    ISSN
    10557903
  • Laurence Florian, Nicolas Violaine, Ayoro Halamoussa Joëlle & Ohler Annemarie, 2023Species distribution modelling of Hylarana Species (Anura, Ranidae) and the problem of accurate species identification. Species of Hylarana Tschudi, 1838 are among the most common amphibian species in the Oriental region. Their poorly known… Zootaxa vol. 5258, n° 1, p. 99-112 tex.eissn: 1175-5334 tex.orcid-numbers: AYORO, Halamoussa/0000-0001-8690-4569 LAURENCE, Florian/0000-0002-5841-1326 Ohler, Annemarie/0000-0001-6531-464X nicolas, violaine/0000-0001-5384-7529 tex.researcherid-numbers: nicolas, violaine/N-9991-2017 tex.uniq
    ISSN
    1175-5334, 1175-5326
  • Mahmoudi Ahmad, Mostafavi Ehsan, Mohammadi Ali, Jalali Tahmineh, Denys Christiane, Nicolas Violaine, Hugot Jean-Pierre, Lalis Aude & Salehi-Vaziri Mostafa, 2023The first identification of Tula orthohantavirus in forest dormice (Rodentia: Gliridae) from Iran. Abstract Orthohantaviruses are a group of zoonotic pathogens that can cause severe and potentially fatal syndromes in humans… MAMMALIA vol. 87, n° 4, p. 405-412 tex.earlyaccessdate: JUN 2023 tex.eissn: 1864-1547 tex.orcid-numbers: Mostafavi, Ehsan/0000-0002-1997-517X Mahmoudi, Ahmad/0000-0003-4698-137X Christiane, Denys/0000-0002-1519-1546 tex.researcherid-numbers: Hugot, Jean-Pierre/F-6594-2012 Salehi-Vaziri, Mo
    ISSN
    0025-1461