Sophie BROUILLET | L’Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité

L’Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité est une unité CNRS du Muséum national d’Histoire naturelle de Paris, ayant aussi pour tutelles l’Université Pierre et Marie Curie et l’Ecole Pratique des Hautes Etudes.

L’UMR 7205 a pour objectif de répondre aux questions concernant l’origine de la biodiversité, les modalités de diversification des espèces, la mise en place des communautés animales en lien avec l’évolution spatio-temporelle des taxons. L’unité est un des pôles européens de systématique et contribue de manière importante à la taxonomie et à la biologie de l’évolution. Les approches de systématique phylogénétique privilégiées par l’unité sont intégratives et ont amené la conception d’outils taxonomiques, moléculaires, génétiques, acoustiques, cytogénétiques, morphologiques et morphométriques.

L’Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité (ISYEB) succède à l’OSEB depuis le 1er Janvier 2014. Les laboratoires de l’Institut se trouvent au Jardin des Plantes dans des bâtiments situés rue Buffon et rue Cuvier (Entomologie, Mammifères et Oiseaux, Malacologie, Botanique, Reptiles-Amphibiens, Géologie).

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sophie.brouillet [at] mnhn.fr

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45 rue Buffon
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75005 Paris

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Publications

2024

Puillandre Nicolas, Miralles Aurélien, Brouillet Sophie, Fedosov Alexander, Fischell Frank, Patmanidis Stefanos & Vences Miguel, 2024 — « Species Delimitation and Exploration of Species Partitions with ASAP and LIMES » in DNA Barcoding.. vol. 2744, , p. 313-334 Series Title: Methods in Molecular Biology

ISBN

978-1-07-163580-3 978-1-07-163581-0

https://dx.doi.org/10.1007/978-1-0716-3581-0_20

2022

Miralles Aurelien, Ducasse Jacques, Brouillet Sophie, Flouri Tomas, Fujisawa Tomochika, Kapli Paschalia, Knowles L. Lacey, Kumari Sangeeta, Stamatakis Alexandros, Sukumaran Jeet, Lutteropp Sarah, Vences Miguel & Puillandre Nicolas, 2022 — SPART : A versatile and standardized data exchange format for species partition information. Molecular Ecology Resources vol. 22, n° 1, p. 430-438

ISSN

1755-098X

https://dx.doi.org/10.1111/1755-0998.13470

2021

Vences Miguel, Miralles Aurélien, Brouillet Sophie, Ducasse Jacques, Fedosov Alexander, Kharchev Vladimir, Kostadinov Ivaylo, Kumari Sangeeta, Patmanidis Stefanos, Scherz Mark, Puillandre Nicolas & Renner Susanne, juillet 2021 — iTaxoTools 0.1: Kickstarting a specimen-based software toolkit for taxonomists. While powerful and user-friendly software suites exist for phylogenetics, and an impressive cybertaxomic infrastructure of… Megataxa vol. 6, n° 2, p. 77-92 ISBN: 2703-3082 Publisher: Magnolia Press Type: 10.11646/MEGATAXA.6.2.1

ISSN

2703-3090, 2703-3082

https://dx.doi.org/10.11646/megataxa.6.2.1
Puillandre Nicolas, Brouillet Sophie & Achaz Guillaume, 2021 — ASAP: assemble species by automatic partitioning. Molecular Ecology Resources vol. 21, n° 2, p. 609-620

ISSN

1755-098X
Vences Miguel, Miralles Aurélien, Brouillet Sophie, Ducasse Jacques, Fedosov Alexander, Kharchev Vladimir, Kostadinov Ivaylo, Kumari Sangeeta, Patmanidis Stefanos, Scherz Mark, Puillandre Nicolas & Renner Susanne, 2021 — iTaxoTools 0.1: Kickstarting a specimen-based software toolkit for taxonomists. While powerful and user-friendly software suites exist for phylogenetics, and an impressive cybertaxomic infrastructure of… Megataxa vol. 6, n° 2, p. 77-92 ISBN: 2703-3082 Publisher: Magnolia Press Type: 10.11646/MEGATAXA.6.2.1

https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03321424

2020

Abdi Basma, Nguyen Thuy, Brouillet Sophie, Desire Nathalie, Sayon Sophie, Wirden Marc, Jary Aude, Achaz Guillaume, Assoumou Lambert, Palich Romain, Simon Anne, Tubiana Roland, Valantin Marc-Antoine, Katlama Christine, Calvez Vincent et al., 2020 — No HIV-1 molecular evolution on long-term antiretroviral therapy initiated during primary HIV-1 infection.. AIDS (London, England) vol. 34, n° 12, p. 1745-1753

ISSN

1473-5571 0269-9370

https://dx.doi.org/10.1097/QAD.0000000000002629
Puillandre Nicolas, Brouillet Sophie & Achaz Guillaume, 2020 — ASAP : assemble species by automatic partitioning. Molecular Ecology Resources vol. 21, n° 2, 1755–0998.13281

ISSN

1755-098X, 1755-0998

https://dx.doi.org/10.1111/1755-0998.13281

2016

Gonçalves Isabelle R., Brouillet Sophie, Soulié Marie-Christine, Gribaldo Simonetta, Sirven Catherine, Charron Noémie, Boccara Martine & Choquer Mathias, novembre 2016 — Genome-wide analyses of chitin synthases identify horizontal gene transfers towards bacteria and allow a robust and unifying classification into fungi. BMC evolutionary biology vol. 16, n° 1, p. 252

ISSN

1471-2148

https://dx.doi.org/10.1186/s12862-016-0815-9
Suez Marie, Behdenna Abdelkader, Brouillet Sophie, Graça Paula, Higuet Dominique & Achaz Guillaume, 2016 — MicNeSs : genotyping microsatellite loci from a collection of (NGS) reads. Molecular Ecology Resources vol. 16, n° 2, p. 524-533

ISSN

1755098X

https://dx.doi.org/10.1111/1755-0998.12467

2013

Dettaï Agnès, Debruyne Régis, Gallut Cyril, Brouillet Sophie, Couloux Arnaud, Améziane Nadia, Monniot Françoise & Lecointre Guillaume, 2013 — "La mitogénomique, un nouvel outil pour l’exploration de la biodiversité et de l’évolution dans l’Océan Austral". 9e Journées Scientifiques du CNFRA. Institut océanographique. Paris.. , ,

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