René ZARAGUETA I BAGILS
Maître de Conférences
Entité de rattachement
Laboratoire informatique et Systématique (LIS-C)
Contact
Courriel
rene.zaragueta_bagils [at] sorbonne-universite.fr
Téléphone
01 40 79 80 54
Adresse(s)
43 rue Buffon
CP48
75005 Paris
Responsabilités hors unité
- co-responsable du master Systématique Evolution Paléontologie
Enseignements
J’enseigne la biologie des organismes et la systématique dans tous les niveaux du premier cycle universitaire, de L1 au L3.
J’enseigne aussi dans le master Systématique, Evolution, Paléobiodiversité - SEP (MNHN-UPMC) l’analyse à trois éléments et la biogéographie cladistique (Area Cladistics), ainsi que l’épistémologie et la philosophie des sciences
Je suis responsable d’un module de l’école doctorale du MNHN, intitulé « Analyse à trois éléments en systématique et biogéographie ».
Présentation
Recherche
Ma recherche concerne la théorie et le développement de l’analyse à trois éléments ou 3ia (pour three-item analysis). La 3ia est une théorie de classification des taxons en systématique et des aires biogéographiques en analyse cladistique d’aires qui se caractérise par une phase d’analyse supplémentaire par rapport aux autres théories de classification, dans laquelle les hypothèses d’homologie sont décomposées en hiérarchies élémentaires qui expriment que deux entités sont plus proches entre elles qu’aucune ne l’est d’une troisième (d’où le nom de 3ia). En 3ia, il n’est pas nécessaire d’introduire des groupes externes, il n’y a pas de matrices de taxons/caractères (ou aires/taxons), il n’y a jamais de points d’interrogations, etc.
Les résultats de la recherche en 3ia ont été implémentés dans le logiciel LisBeth
Publications
2021
- , 2021 — Complete formalization of taxa with their names, contents and descriptions improves taxonomic databases and access to the taxonomic knowledge they support. Systematics and Biodiversity vol. 19, n° 7, p. 738-746 Publisher: Taylor & Francis: STM, Behavioural Science and Public Health Titles tex.hal_id: mnhn-03232322 tex.hal_version: v1ISSN1477-2000, 1478-0933
- , 2021 — Information content of trees: three-taxon statements, inference rules and dependency. Biological Journal of the Linnean Society vol. 133, n° 4, p. 1152-1170 tex.eprint:https://academic.oup.com/biolinnean/article-pdf/133/4/1152/39305759/blab046.pdfISSN0024-4066
2019
- , 2019 — La reconstruction phylogénétique Concepts et méthodes (Nouvelle édition revue et augmentée)Collection science et philosophie. , , dir. Editions matériologiques
2018
- , 2018 — Impact of errors on cladistic inference: simulation-based comparison between parsimony and three-taxon analysis. Contributions to Zoology, Naturalis vol. 87, n° 1, p. 25-40
2017
- , 2017 — Mesozoic clupeomorphs of North Africa : diversity and phylogeny. Research & Knowledge vol. 3, n° 2, p. 46-49
2016
- , juillet 2016 — Unrooted trees discovered independently in philology and phylogenetics: a remarkable case of methodological convergence. Systematics and Biodiversity vol. 14, n° 4, p. 317-326ISSN1477-2000, 1478-0933
- , 2016 — « Why should cladograms be dichotomous? » in The Future of Phylogenetic Systematics: The Legacy of Willi Hennig.. , , dir. Cambridge university press p. 230-257
2015
- , 2015 — Experimental systematics: sensitivity of cladistic methods to polarization and character ordering schemes. Contributions to Zoology vol. 84, , p. 129-148
- , 2015 — Les deux biogéogrpahies : biogéographie historique vs histoire géographique. Ste francais de systematique vol. 30, , p. 134-153