René ZARAGUETA I BAGILS

René ZARAGUETA I BAGILS
Maître de Conférences
Entité de rattachement
Laboratoire informatique et Systématique (LIS)

Contact

Téléphone
01 40 79 80 54
Adresse(s)

43 rue Buffon
CP48
75005 Paris

Responsabilités hors unité

  • co-responsable du master Systématique Evolution Paléontologie

Enseignement(s)

J'enseigne la biologie des organismes et la systématique dans tous les niveaux du premier cycle universitaire, de L1 au L3.

J'enseigne aussi dans le master Systématique, Evolution, Paléobiodiversité - SEP (MNHN-UPMC) l'analyse à trois éléments et la biogéographie cladistique (Area Cladistics), ainsi que l'épistémologie et la philosophie des sciences

Je suis responsable d'un module de l'école doctorale du MNHN, intitulé "Analyse à trois éléments en systématique et biogéographie".

Recherche

Ma recherche concerne la théorie et le développement de l'analyse à trois éléments ou 3ia (pour three-item analysis). La 3ia est une théorie de classification des taxons en systématique et des aires biogéographiques en analyse cladistique d'aires qui se caractérise par une phase d'analyse supplémentaire par rapport aux autres théories de classification, dans laquelle les hypothèses d'homologie sont décomposées en hiérarchies élémentaires qui expriment que deux entités sont plus proches entre elles qu'aucune ne l'est d'une troisième (d’où le nom de 3ia). En 3ia, il n'est pas nécessaire d'introduire des groupes externes, il n'y a pas de matrices de taxons/caractères (ou aires/taxons), il n'y a jamais de points d'interrogations, etc.

Les résultats de la recherche en 3ia ont été implémentés dans le logiciel LisBeth

Publications

2021
  • Rineau Valentin, Zaragueta Rene & Bardin Jérémie, 2021 — Information content of trees: three-taxon statements, inference rules and dependency. Biological Journal of the Linnean Society. Vol. 133, n° 4, p. 1152-1170. tex.eprint:https://academic.oup.com/biolinnean/article-pdf/133/4/1152/39305759/blab046.pdf.
    ISSN: 
    0024-4066
    https://dx.doi.org/10.1093/biolinnean/blab046
  • Bourgoin Thierry, Bailly Nicolas, Zaragueta René & Vignes-Lebbe Régine, 2021 — Complete formalization of taxa with their names, contents and descriptions improves taxonomic databases and access to the taxonomic knowledge they support. Systematics and Biodiversity. Vol. 19, n° 7, p. 738-746. Publisher: Taylor & Francis tex.eprint: https://doi.org/10.1080/14772000.2021.1915895.
    ISSN: 
    1477-2000, 1478-0933
    https://dx.doi.org/10.1080/14772000.2021.1915895
2019
  • Darlu P., Tassy P., D’Haese C. & Zaragueta i Bagils R., 2019 — La Reconstruction Phylogénétique Concepts et Méthodes (Nouvelle Édition Revue et Augmentée)Collection Science et Philosophie. Dir. Editions mat\'eriologiques.
2018
  • Rineau Valentin, Zaragueta Bagils René & Laurin Michel, 2018 — Impact of errors on cladistic inference: simulation-based comparison between parsimony and three-taxon analysis. Contributions to Zoology, Naturalis. Vol. 87, n° 1, p. 25-40.
2017
  • Bouziane Khalloufi Didier Dutheil, Dutheil D.B., Brito P., Mora T. & Zaragueta-Bagils R., 2017 — Mesozoic clupeomorphs of North Africa : diversity and phylogeny. Research & Knowledge. Vol. 3, n° 2, p. 46-49.
    https://dx.doi.org/10.14456/randk.2017.25
2016
  • Pinna Mário De, Bockmann Flávio A. & Zaragueta Bagils René, Juillet 2016 — Unrooted trees discovered independently in philology and phylogenetics: a remarkable case of methodological convergence. Systematics and Biodiversity. Vol. 14, n° 4, p. 317-326.
    ISSN: 
    1477-2000, 1478-0933
    https://dx.doi.org/10.1080/14772000.2016.1150906
  • Zaragueta Bagils R. & Pécaud S., 2016 — « Why should cladograms be dichotomous? » in The Future of Phylogenetic Systematics: The Legacy of Willi Hennig. Dir. Cambridge university press, p. 230-257.
    https://halshs.archives-ouvertes.fr/halshs-01304788
2015
  • Zaragueta Bagils R., 2015 — Les deux biogéogrpahies : biogéographie historique vs histoire géographique. Ste francais de systematique. Vol. 30, p. 134-153.
    http://www.projets.upmc.fr/ashic/cours/2H003/2H003-td4_RZ.pdf
  • Rineau Valentin, Grand Anaïs, Zaragueta René & Laurin Michel, 2015 — Experimental systematics: sensitivity of cladistic methods to polarization and character ordering schemes. Contributions to Zoology. Vol. 84, p. 129-148.
  • Lecointre G., Ekström P., Gargaud Muriel, Klein Etienne, Longo Giuseppe, Martin H., Walliser B., Zanda Brigitte & Zaragueta Bagils R., 2015 — « Catégories et classification face au changement » in L’évolution, de l’univers aux sociétés. Objets et concepts. Dir. Editions Matériologiques, p. 455-474.
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