- ZALKO Julie - "Limites d'espèces, différenciation écologique et adaptations morpho-anatomiques dans un jeune groupe de légumineuses endémiques néocalédoniennes (Arthroclianthus Baill., Nephrodesmus Schindl.)". Co-encadrants Florian Jabbour, Thierry Deroin et Corinne Sarthou, ISYEB. (Thèse soutenue le 23 mai 2022)
- GARDERE Mathieu - "Origine de l’endémisme en milieu insulaire : le modèle des Campanules de l’archipel du Cap Vert". Encadrants Serge Muller et Jean-Yves Dubuisson, ISYEB. (Thèse soutenue le 14 septembre 2020)
- INSISIENGMAY Oudomphone “Systématique du genre Kaempferia L. (Zingiberaceae) au Laos ". Co-encadrants T. Haevermans (50%), ISYEB et M. Newman, Royal Botanic Garden, Edinburg, Écosse,UK. (Thèse soutenue le 28 février 2019.)
- DEL RIO Cédric - « Les Icacinaceae du Paléogène du Bassin Parisien (Co-encadrants Thomas Haevermans (33%), ISYEB / Dario de Franceschi (33%) CR2P et R. Thomas (33%). (Thèse soutenue le 16 novembre 2018.)
- Zhou Meng-Yuan - “Phylogeny and Systematics of Paleotropical bamboos (Poaceae – Bambusoideae)”. Co-encadrants Thomas Haevermans, ISYEB et De-Zhu Li Kunming, (Institute of Botany).(Thèse soutenue le 17 mai 2017)