Informations pratiques
Apport de l’ADN ancien dans l’étude de l’émergence et de l’évolution de pathogènes de cultures
Les pathogènes de cultures représentent une menace pour l’Homme depuis l’apparition de l’Agriculture. Afin de mieux comprendre les maladies actuelles de cultures et prévenir les épidémies futures, il est indispensable de comprendre les facteurs contrôlant l’émergence, l’adaptation et la diffusion des agents pathogènes. De récents développements méthodologiques dans le domaine de l’épidémiologie moléculaire permettent désormais de reconstruire les dynamiques spatio-temporelles des maladies avec une précision accrue. Alors que la quasi-totalité des études précédemment réalisées se sont entièrement appuyées sur l’échantillonnage d’individus contemporains (période de 30 ans au maximum), de récents progrès dans les technologies de séquençage permettent désormais de reconstruire les génomes historiques datant de plusieurs siècles et ainsi d’étudier l’histoire des pathogènes avec une plus grande justesse. L’étude de l’émergence d’une bactérie pathogène des agrumes dans l’océan indien sera présentée, ainsi qu’une preuve de concept d’approche indirecte dans la reconstruction de séquences nucléiques virales depuis des échantillons d’herbier.
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