Only 5% of described species have a conservation status. Methods used to assess conservation status cannot be generalized to all species. Using population genetics’models, we developed a new method to study demography based on the length of compatible blocks along the genome, i.e. blocks of nucleotides within which recombination events are not detectable. From whole-genome data of multiple individuals in a population, we can chop a chromosome into compatible blocks in seconds. Lengths of compatible blocks depend on the frequency of recombination events which is influenced by the ancestral history of the population. Using the distribution of block lengths, we can discriminate a constant population and a declining one. This method can infer a very recent decline of a population from DNA sequences. It could be a new tool to assess conservation status in a wide range of species.
L’Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité est une unité CNRS du Muséum national d’Histoire naturelle de Paris, ayant aussi pour tutelles l’Université Pierre et Marie Curie et l’Ecole Pratique des Hautes Etudes.
L’UMR 7205 a pour objectif de répondre aux questions concernant l’origine de la biodiversité, les modalités de diversification des espèces, la mise en place des communautés animales en lien avec l’évolution spatio-temporelle des taxons. L’unité est un des pôles européens de systématique et contribue de manière importante à la taxonomie et à la biologie de l’évolution. Les approches de systématique phylogénétique privilégiées par l’unité sont intégratives et ont amené la conception d’outils taxonomiques, moléculaires, génétiques, acoustiques, cytogénétiques, morphologiques et morphométriques.
L’Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité (ISYEB) succède à l’OSEB depuis le 1er Janvier 2014. Les laboratoires de l’Institut se trouvent au Jardin des Plantes dans des bâtiments situés rue Buffon et rue Cuvier (Entomologie, Mammifères et Oiseaux, Malacologie, Botanique, Reptiles-Amphibiens, Géologie).
