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Les tutelles MNHN-CNRS-SU-EPHE-UA

L’Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité est une unité CNRS du Muséum national d’Histoire naturelle de Paris, ayant aussi pour tutelles l’Université Pierre et Marie Curie et l’Ecole Pratique des Hautes Etudes.

L’UMR 7205 a pour objectif de répondre aux questions concernant l’origine de la biodiversité, les modalités de diversification des espèces, la mise en place des communautés animales en lien avec l’évolution spatio-temporelle des taxons. L’unité est un des pôles européens de systématique et contribue de manière importante à la taxonomie et à la biologie de l’évolution. Les approches de systématique phylogénétique privilégiées par l’unité sont intégratives et ont amené la conception d’outils taxonomiques, moléculaires, génétiques, acoustiques, cytogénétiques, morphologiques et morphométriques.

L’Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité (ISYEB) succède à l’OSEB depuis le 1er Janvier 2014. Les laboratoires de l’Institut se trouvent au Jardin des Plantes dans des bâtiments situés rue Buffon et rue Cuvier (Entomologie, Mammifères et Oiseaux, Malacologie, Botanique, Reptiles-Amphibiens, Géologie).

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Achaz Guillaume, Rodriguez-Verdugo Alejandra, Gaut Brandon S. & Tenaillon Olivier, 2014 — « The Reproducibility of Adaptation in the Light of Experimental Evolution with Whole Genome Sequencing » in Ecological Genomics.. vol. 781, , dir. Springer Netherlands p. 211-231
ISBN
978-94-007-7346-2 978-94-007-7347-9
http://link.springer.com/10.1007/978-94-007-7347-9_11
Blanquart François, Achaz Guillaume, Bataillon Thomas & Tenaillon Olivier, décembre 2014 — Properties of selected mutations and genotypic landscapes under Fisher’s geometric model: GENOTYPIC LANDSCAPES UNDER FISHER’S MODEL. Evolution vol. 68, n° 12, p. 3537-3554
ISSN
00143820
https://dx.doi.org/10.1111/evo.12545
Soldano Henry, 2015 — Motifs fermés et abstraction : au-delà des treillis.. Revue d’Intelligence Artificielle vol. 29, 3-4, p. 321-348
https://dx.doi.org/10.3166/ria.29.321-348
, 2016 — Solving Large Scale Learning Tasks. Challenges and Algorithms - Essays Dedicated to Katharina Morik on the Occasion of Her 60th Birthday. vol. 9580, , dir. Springer
ISBN
978-3-319-41705-9
http://dx.doi.org/10.1007/978-3-319-41706-6
Gangloff Serge, Achaz Guillaume, Francesconi Stefania, Villain Adrien, Miled Samia, Denis Claire & Arcangioli Benoit, décembre 2017 — Quiescence unveils a novel mutational force in fission yeast. eLife vol. 6, ,
ISSN
2050-084X
https://dx.doi.org/10.7554/eLife.27469
Brézellec Pierre, Petit Marie-Agnès, Pasek Sophie, Vallet-Gely Isabelle, Possoz Christophe & Ferat Jean-Luc, 2017 — Domestication of Lambda Phage Genes into a Putative Third Type of Replicative Helicase Matchmaker. Genome Biology and Evolution vol. 9, n° 6, p. 1561-1566
ISSN
1759-6653
https://dx.doi.org/10.1093/gbe/evx111
Ferretti Luca, Ledda Alice, Wiehe Thomas, Achaz Guillaume & Ramos-Onsins Sebastian E., 2017 — Decomposing the Site Frequency Spectrum: The Impact of Tree Topology on Neutrality Tests. Genetics vol. 207, n° 1, p. 229-240
ISSN
1943-2631
https://dx.doi.org/10.1534/genetics.116.188763
Ferretti Luca, Weinreich Daniel, Tajima Fumio & Achaz Guillaume, novembre 2018 — Evolutionary constraints in fitness landscapes. Heredity vol. 121, n° 5, p. 466-481
ISSN
1365-2540
https://dx.doi.org/10.1038/s41437-018-0110-1
Institut de Systématique Évolution Biodiversité (ISYEB) MuséumNational d’Histoire Naturelle Centre National de la RechercheScientifique (CNRS) Sorbonne Université EPHE, Deroin T., Offroy B., Chapard A. & Le Disquet I., décembre 2018 — Enhancement of the Botanical Micro-Slide Library of Philippe Van Tieghem at the Herborium of Paris (P): Historical Significance, Restoration and Prospects". Visnyk of Lviv University. Biological series , n° 78, p. 20-24
ISSN
02065657, 20755236
https://dx.doi.org/10.30970/vlubs.2018.78.05
Desjonquères Camille, Rybak Fanny, Ulloa Juan Sebastian, Kempf Alexandre, Bar Hen Avner & Sueur Jérôme, 2020 — Monitoring the acoustic activity of an aquatic insect population in relation to temperature, vegetation and noise. Freshwater Biology vol. 65, n° 1, p. 107-116
ISSN
0046-5070, 1365-2427
https://dx.doi.org/10.1111/fwb.13171
Huber B., Whibley A., Poul Y. L., Navarro N., Martin A., Baxter S., Shah A., Gilles B., Wirth T., McMillan W. O. & Joron M., 2015 — Conservatism and novelty in the genetic architecture of adaptation in Heliconius butterflies. Heredity vol. 114, n° 5, p. 515-524
ISSN
0018-067X, 1365-2540
https://dx.doi.org/10.1038/hdy.2015.22
Merker Matthias, Blin Camille, Mona Stefano, Duforet-Frebourg Nicolas, Lecher Sophie, Willery Eve, Blum Michael G B, Rüsch-Gerdes Sabine, Mokrousov Igor, Aleksic Eman, Allix-Béguec Caroline, Antierens Annick, Augustynowicz-Kopeć Ewa, Ballif Marie, Barletta Francesca et al., 2015 — Evolutionary history and global spread of the Mycobacterium tuberculosis Beijing lineage. Nature Genetics vol. 47, n° 3, p. 242-249
ISSN
1061-4036, 1546-1718
https://dx.doi.org/10.1038/ng.3195
Wirth Thierry, 2015 — Massive lineage replacements and cryptic outbreaks of Salmonella Typhi in eastern and southern Africa. Nature Genetics vol. 47, n° 6, p. 565-567
ISSN
1061-4036
https://dx.doi.org/10.1038/ng.3318
Glaser Philippe, Martins-Simões Patrícia, Villain Adrien, Barbier Maxime, Tristan Anne, Bouchier Christiane, Ma Laurence, Bes Michele, Laurent Frederic, Guillemot Didier, Wirth Thierry & Vandenesch François, 2016 — Demography and intercontinental spread of the USA300 community-acquired methicillin-resistant Staphylococcus aureus lineage. mBio vol. 7, n° 1, e02183--15
ISSN
2150-7511
https://dx.doi.org/10.1128/mBio.02183-15
Sapriel G., Konjek J., Orgeur M., Bouri L., Frezal L., Roux A. L., Dumas E., Brosch R., Bouchier C., Brisse S., Vandenbogaert M., Thiberge J. M., Caro V., Ngeow Y. F., Tan J. L. et al., 2016 — Genome-wide mosaicism within Mycobacterium abscessus: evolutionary and epidemiological implications. BMC Genomics vol. 17, n° 1, p. 118
ISSN
1471-2164 (Electronic) 1471-2164 (Linking)
https://dx.doi.org/10.1186/s12864-016-2448-1
Alhaj Hussen K., Vu Manh T. P., Guimiot F., Nelson E., Chabaane E., Delord M., Barbier M., Berthault C., Dulphy N., Alberdi A. J., Burlen-Defranoux O., Socie G., Bories J. C., Larghero J., Vanneaux V. et al., 2017 — Molecular and Functional Characterization of Lymphoid Progenitor Subsets Reveals a Bipartite Architecture of Human Lymphopoiesis. Immunity vol. 47, n° 4, 680–696 e8
ISSN
1097-4180 (Electronic) 1074-7613 (Linking)
https://dx.doi.org/10.1016/j.immuni.2017.09.009
Rasigade Jean-Philippe, Barbier Maxime, Dumitrescu Oana, Pichat Catherine, Carret Gérard, Ronnaux-Baron Anne-Sophie, Blasquez Ghislaine, Godin-Benhaim Christine, Boisset Sandrine, Carricajo Anne, Jacomo Véronique, Fredenucci Isabelle, Pérouse de Montclos Michèle, Flandrois Jean-Pierre, Ader Florence et al., 2017 — Strain-specific estimation of epidemic success provides insights into the transmission dynamics of tuberculosis. Scientific Reports vol. 7, , p. 45326
https://dx.doi.org/10.1038/srep45326
Barbier M., Dumitrescu O., Pichat C., Carret G., Ronnaux-Baron A. S., Blasquez G., Godin-Benhaim C., Boisset S., Carricajo A., Jacomo V., Fredenucci I., Perouse de Montclos M., Genestet C., Flandrois J. P., Ader F. et al., 2018 — Changing patterns of human migrations shaped the global population structure of Mycobacterium tuberculosis in France. Scientific reports vol. 8, n° 1, p. 5855
ISSN
2045-2322 (Electronic) 2045-2322 (Linking)
https://dx.doi.org/10.1038/s41598-018-24034-6
Gustave C. A., Tristan A., Martins-Simoes P., Stegger M., Benito Y., Andersen P. S., Bes M., Le Hir T., Diep B. A., Uhlemann A. C., Glaser P., Laurent F., Wirth T. & Vandenesch F., 2018 — Demographic fluctuation of community-acquired antibiotic-resistant Staphylococcus aureus lineages: potential role of flimsy antibiotic exposure. Isme Journal vol. 12, n° 8, p. 1879-1894
ISSN
1751-7370 (Electronic) 1751-7362 (Linking)
https://dx.doi.org/10.1038/s41396-018-0110-4
Kramer R., Sabatier M., Wirth T., Pichon M., Lina B., Schuffenecker I. & Josset L., 2018 — Molecular diversity and biennial circulation of enterovirus D68: a systematic screening study in Lyon, France, 2010 to 2016. Eurosurveillance vol. 23, n° 37,
ISSN
1560-7917 (Electronic) 1025-496X (Linking)
https://dx.doi.org/10.2807/1560-7917.ES.2018.23.37.1700711
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  • 2001
  • 2000
  • 1999
  • 1998
  • 1997
  • 1976
  • 13

Entité de rattachement

  • 161
  • 172
  • 222
  • Adaptation, Intégration, Réticulation, Evolution (AIRE)
  • Atelier de bio-informatique (ABI)
  • Biologie de la mangrove
  • Dessin scientifique
  • Diversification et adaptation aux échelles micro et macro-évolutives (DIVA)
  • Equipe logistique
  • Evolution fonctionnelle et Taxonomie (EvoFoncT)
  • Exploration, Espèces et Evolution (3E)
  • Homologies
  • Interactions et Evolution Végétale et Fongique (INEVEF)
  • Laboratoire informatique et Systématique (LIS-C)
  • Morpho-Anatomie et Développement des Plantes (MADP)
  • Phylogénomique, phylodynamique et interactions hôtes-pathogènes (PhyloPath)
  • Secrétariat et gestion
  • Systématique, Phylogéographie, Évolution, Conservation (SPEC)

Organisme de rattachement

  • -
  • CNRS
  • En délégation - Université de Montpellier
  • ENS Lyon
  • EPHE-PSL
  • MNHN
  • Sorbonne Université
  • UA
  • UFI
  • Université Paris-Diderot
  • UVSQ

Statut

  • -
  • Adjoint Technique
  • Assistant(e) de Recherche, détachée du Missouri Botanical Garden
  • Assistant(e) ingénieur(e)
  • Assistant Curator, détaché du Missouri Botanical Garden
  • ATER
  • Attaché(e) Honoraire
  • Bénévole
  • Chaire de professeur junior en taxonomie intégrative
  • Chargé(e) d'études
  • Chef de projet
  • Directeur d'études EPHE-PSL
  • Directeur d'études EPHE-PSL
  • Directeur de recherche au CNRS
  • Directeur de Recherche émérite
  • Directrice d'études EPHE-PSL
  • Doctorant(e)
  • Gestionnaire de Collections
  • Ingénieur(e) d'Etudes
  • Ingénieur(e) de Recherche
  • Maître de Conférences
  • Maître de Conférences de l'Université d'Aix-Marseille, en délégation CNRS à l'ISYEB
  • Post-doctorant(e)
  • Professeur(e)
  • Professeur(e) Emérite
  • Professeur émérite
  • Professeur émérite, détaché du Missouri Botanical Garden
  • Responsable scientifique de collection à l'Herbier
  • Responsable service conservation des collections de Botanique
  • Secrétaire de la Direction
  • Senior Manager Africa, détaché du Missouri Botanical Garden
  • Technicien(ne)

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