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Les tutelles MNHN-CNRS-SU-EPHE-UA

L’Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité est une unité CNRS du Muséum national d’Histoire naturelle de Paris, ayant aussi pour tutelles l’Université Pierre et Marie Curie et l’Ecole Pratique des Hautes Etudes.

L’UMR 7205 a pour objectif de répondre aux questions concernant l’origine de la biodiversité, les modalités de diversification des espèces, la mise en place des communautés animales en lien avec l’évolution spatio-temporelle des taxons. L’unité est un des pôles européens de systématique et contribue de manière importante à la taxonomie et à la biologie de l’évolution. Les approches de systématique phylogénétique privilégiées par l’unité sont intégratives et ont amené la conception d’outils taxonomiques, moléculaires, génétiques, acoustiques, cytogénétiques, morphologiques et morphométriques.

L’Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité (ISYEB) succède à l’OSEB depuis le 1er Janvier 2014. Les laboratoires de l’Institut se trouvent au Jardin des Plantes dans des bâtiments situés rue Buffon et rue Cuvier (Entomologie, Mammifères et Oiseaux, Malacologie, Botanique, Reptiles-Amphibiens, Géologie).

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Arroyo Alicia S, Iannes Romain, Bapteste Eric & Ruiz-Trillo Iñaki, 2020 — Gene Similarity Networks Unveil a Potential Novel Unicellular Group Closely Related to Animals from the Tara Oceans Expedition. Genome Biology and Evolution vol. 12, n° 9, p. 1664-1678
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Watson Andrew K, Lopez Philippe & Bapteste Eric, 2021 — Retracing lineage history: time to emphasize genetic turn-over Authorship. Trends in Microbiology vol. 29, n° 11, p. 957-958 Publisher: Elsevier tex.hal_id: hal-03341509 tex.hal_version: v1
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https://dx.doi.org/10.1016/j.tim.2021.08.001
Arroyo Alicia S., Lannes Romain, Bapteste Eric & Ruiz-Trillo Inaki, 2021 — Gene Similarity Networks Unveil a Potential Novel Unicellular Group Closely Related to Animals from the Tara Oceans Expedition (vol 12, pg 1664, 2020). Genome Biology and Evolution vol. 13, n° 8, evab140
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1759-6653
https://dx.doi.org/10.1093/gbe/evab140
Bapteste Eric & Papale Francois, 2021 — Modeling the evolution of interconnected processes: It is the song and the singers Tracking units of selection with interaction networks. BioEssays : news and reviews in molecular, cellular and developmental biology vol. 43, n° 1, e2000077
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Ocaña-Pallarès Eduard, Williams Tom A., López-Escardó David, Arroyo Alicia S., Pathmanathan Jananan S., Bapteste Eric, Tikhonenkov Denis V., Keeling Patrick J., Szöllősi Gergely J. & Ruiz-Trillo Iñaki, 2022 — Divergent genomic trajectories predate the origin of animals and fungi. Abstract Animals and fungi have radically distinct morphologies, yet both evolved within the same eukaryotic supergroup:… Nature vol. 609, n° 7925, p. 1-7
ISSN
0028-0836, 1476-4687
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Bapteste E., 2018 — Tous entrelacés : une histoire de l’évolution. The Conversation , ,
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Lannes Romain, Bapteste Éric & Lopez Philippe, novembre 2019 — Search for unknown environmental sequences of medical/biological interest using large sequence similarity networks, Recherche de séquences environnementales inconnues d’intérêt médical/biologique par l’utilisation de grands réseaux de similarité de.... The objective of this thesis was to identify as yet unknown microorganisms present in various environments and to characterize… , , X
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Watson Andrew K, Lopez Philippe & Bapteste Eric, novembre 2021 — Hundreds of out-of-frame remodelled gene families in the E. coli pangenome. Molecular Biology and Evolution , , msab329 Publisher: Oxford University Press (OUP) tex.hal_id: hal-03451955 tex.hal_version: v1
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Massé Cécile, Antajan Elvire, Auby Isabelle, Bernard Guillaume, Bouchet Vincent, Burel Thomas, Charmasson Julie, Dauvin Jean-Claude, Delaquaize François, Duron Noémie, Gouillieux Benoît, Goulletquer Philippe, Humbert Suzie, Janson Anne-Laure, Jourde Jérôme et al., 2021 — Compte rendu de l’atelier national “ espèces non indigènes ” (ENI), 14.10.2021, MNHN Paris. , , 17 pages tex.hal_id: mnhn-04166402 tex.hal_version: v1
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Bernard Charles, Li Yanyan, Bapteste Eric & Lopez Philippe, octobre 2021 — RRNPP_detector: a tool to detect RRNPP quorum sensing systems in chromosomes, plasmids and phages of gram-positive bacteria. ABSTRACT Gram-positive bacteria (e.g. Firmicutes) and their mobile genetic elements (plasmids, bacteriophages) encode peptide… , , Type: 10.1101/2021.08.18.456871
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Bernard Charles, Li Yanyan, Lopez Philippe & Bapteste Eric, octobre 2021 — Large-scale identification of viral quorum sensing systems reveals density-dependent sporulation-hijacking mechanisms in bacteriophages. Communication between viruses supported by quorum sensing systems (QSSs) were found to optimize the fitness of temperate… , , Type: 10.1101/2021.07.15.452460
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Guillaume Bernard, Jérôme Teulière, Philippe Lopez, Eduardo Corel, François-Joseph Lapointe, Eric Bapteste & Corel Eduardo, octobre 2021 — For consideration as an Article in the Discoveries section of MBE Aging at evolutionary crossroads: longitudinal gene co-expression network analyses of proximal and ultimate causes of aging in bats. How, when and why do organisms, their tissues and their cells age remain challenging issues, although researchers have… Molecular Biology and Evolution , , ISBN: 0737-4038 Publisher: Oxford University Press (OUP) Type: 10.1093/molbev/msab302/6400255
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Bernard Charles, Lopez Philippe & Bapteste Eric, 2020 — « Microbial Communication Networks: Sketching a Method for Analyzing the Communication of Bacteriophages Inside Environmental Communities » in Biocommunication of Phages.. , , p. 163-181
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978-3-030-45884-3 978-3-030-45885-0
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Teulière Jérôme, Bernard Charles, Corel Eduardo, Lapointe François-Joseph, Martens Johannes, Lopez Philippe & Bapteste Eric, 2022 — Network analyses unveil ageing-associated pathways evolutionarily conserved from fungi to animals. GeroScience , ,
ISSN
2509-2715, 2509-2723
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Watson Andrew, Lopez Philippe & Bapteste Eric, 2022 — Hundreds of Out-of-Frame Remodeled Gene Families in the Escherichia coli Pangenome. Molecular Biology and Evolution vol. 39, n° 1, msab329 Publisher: Oxford University Press (OUP) tex.hal_id: hal-03820636 tex.hal_version: v1
ISSN
0737-4038, 1537-1719
https://dx.doi.org/10.1093/molbev/msab329
Bernard Guillaume, Teuliere Jerome, Lopez Philippe, Corel Eduardo, Lapointe Francois-Joseph & Bapteste Eric, 2022 — Aging at Evolutionary Crossroads: Longitudinal Gene Co-expression Network Analyses of Proximal and Ultimate Causes of Aging in Bats. Molecular Biology and Evolution vol. 39, n° 1, msab302
ISSN
0737-4038
https://dx.doi.org/10.1093/molbev/msab302
Bapteste Eric, 2022 — Tout se transforme ! Comment marche l’évolution. Illustrations Mélie Lychee.. , , dir. Circonflexe
ISBN
EAN : 9782378623814
https://www.circonflexe.fr/catalogue/a-paraitre/tout-se-transforme-comment-marche-l-evolution
Bapteste Eric, 2022 — Le monde surprenant des microbes Virus, bactéries, archées.... , , dir. Editons Circonflexe
https://www.circonflexe.fr/catalogue/ouvrage/le-monde-surprenant-des-microbes-9782378624255
Bonnefous H, Teulière J, Lapointe FJ, Lopez P & Bapteste E, 2024 — Most genetic roots of fungal and animal aging are hundreds of millions of years old according to phylostratigraphy analyses of aging networks.. GEROSCIENCE , ,
ISSN
2509-2715
https://dx.doi.org/10.1007/s11357-024-01234-9
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