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Les tutelles MNHN-CNRS-SU-EPHE-UA

L’Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité est une unité CNRS du Muséum national d’Histoire naturelle de Paris, ayant aussi pour tutelles l’Université Pierre et Marie Curie et l’Ecole Pratique des Hautes Etudes.

L’UMR 7205 a pour objectif de répondre aux questions concernant l’origine de la biodiversité, les modalités de diversification des espèces, la mise en place des communautés animales en lien avec l’évolution spatio-temporelle des taxons. L’unité est un des pôles européens de systématique et contribue de manière importante à la taxonomie et à la biologie de l’évolution. Les approches de systématique phylogénétique privilégiées par l’unité sont intégratives et ont amené la conception d’outils taxonomiques, moléculaires, génétiques, acoustiques, cytogénétiques, morphologiques et morphométriques.

L’Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité (ISYEB) succède à l’OSEB depuis le 1er Janvier 2014. Les laboratoires de l’Institut se trouvent au Jardin des Plantes dans des bâtiments situés rue Buffon et rue Cuvier (Entomologie, Mammifères et Oiseaux, Malacologie, Botanique, Reptiles-Amphibiens, Géologie).

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Hánová Alexandra, Konečný Adam, Nicolas Violaine, Denys Christiane, Granjon Laurent, Lavrenchenko Leonid A., Šumbera Radim, Mikula Ondřej & Bryja Josef, 2021 — Multilocus phylogeny of African striped grass mice (Lemniscomys): Stripe pattern only partly reflects evolutionary relationships. Molecular Phylogenetics and Evolution vol. 155, , p. 107007
ISSN
1055-7903
https://dx.doi.org/10.1016/j.ympev.2020.107007
Mikula Ondřej, Nicolas Violaine, Šumbera Radim, Konečný Adam, Denys Christiane, Verheyen Erik, Bryjová Anna, Lemmon Alan R., Moriarty Lemmon Emily & Bryja Josef, 2021 — Nuclear phylogenomics, but not mitogenomics, resolves the most successful Late Miocene radiation of African mammals (Rodentia: Muridae: Arvicanthini). Molecular Phylogenetics and Evolution , , p. 107069
ISSN
1055-7903
https://dx.doi.org/10.1016/j.ympev.2021.107069
Couvreur Thomas L.P., Dauby Gilles, Blach-Overgaard Anne, Deblauwe Vincent, Dessein Steven, Droissart Vincent, Hardy Oliver J., Harris David J., Janssens Steven B., Ley Alexandra C., Mackinder Barbara A., Sonké Bonaventure, Sosef Marc S.M., Stévart Tariq, Svenning Jens-Christian et al., 2021 — Tectonics, climate and the diversification of the tropical African terrestrial flora and fauna. Biological Reviews vol. 96, n° 1, p. 16-51 Publisher: John Wiley \& Sons, Ltd
ISSN
1464-7931
https://dx.doi.org/10.1111/brv.12644
Nicolas Violaine, Hugot Jean-Pierre & Cornette Raphaël, 2021 — New data on the distribution of the two mole species Talpa aquitania Nicolas, Matinez-Vargas & Hugot, 2017 and T. europaea Linnaeus, 1758 in France based on museum and newly collected specimens. Zoosystema. Publications Scientifiques du Muséum national d’Histoire naturelle vol. 43, n° 24, p. 585-617
https://dx.doi.org/https://doi.org/10.5252/zoosystema2021v43a24
Nicolas Violaine, Mikula Ondřej, Lavrenchenko Leonid A., Šumbera Radim, Bartáková Veronika, Bryjová Anna, Meheretu Yonas, Verheyen Erik, Missoup Alain Didier, Lemmon Alan R., Moriarty Lemmon Emily & Bryja Josef, 2021 — Phylogenomics of African radiation of Praomyini (Muridae: Murinae) rodents: First fully resolved phylogeny, evolutionary history and delimitation of extant genera. Molecular Phylogenetics and Evolution vol. 163, , p. 107263
ISSN
10557903
https://dx.doi.org/10.1016/j.ympev.2021.107263
Kouassi Stephane Kan, Nicolas Violaine, Aniskine Vladimir, Lalis Aude, Cruaud Corinne, Couloux Arnaud, Colyn Marc, Dosso Mireille, Koivogui Lamine, Verheyen Erik, Akoua-Koffi Chantal & Denys Christiane, 2008 — Taxonomy and biogeography of the African Pygmy mice, Subgenus Nannomys (Rodentia, Murinae, Mus) in Ivory Coast and Guinea (West Africa). Mammalia vol. 72, n° 3, p. 237-252
ISSN
0025-1461
https://dx.doi.org/10.1515/MAMM.2008.035
Nicolas Violaine, Natta Armand, Barriere Patrick, Delapré Arnaud & Colyn Marc, 2010 — Terrestrial small mammal diversity and abundance in central Benin: comparison between habitats, with conservation implications. African Journal of Ecology vol. 48, n° 4, p. 1092-1104
ISSN
0141-6707
https://dx.doi.org/10.1111/j.1365-2028.2010.01221.x
Lalis A., Nicolas V., Ohler A., Miralles A., Crochet P-A, Leblois R., Fadh S., El Hassani A., Bennazou T. & Denys C., 2015 — Résumé scientifique - Comparative phylogeography and population genetic structure of 10 widespread small vertebrate species in Morocco. Présenté au Congrès international Barcode of Life à Guelph (Canada). , ,
Gu Se Hun, Nicolas Violaine, Lalis Aude, Sathirapongsasuti Nuankanya & Yanagihara Richard, 2013 — Complete genome sequence and molecular phylogeny of a newfound hantavirus harbored by the Doucet’s musk shrew (Crocidura douceti) in Guinea. Infection Genetics and Evolution vol. 20, , p. 118-123
ISSN
1567-1348
https://dx.doi.org/10.1016/j.meegid.2013.08.016
Denys Christiane, Lalis Aude, Kourouma Fode, Kouassi Stephane Kan, Nicolas Violaine, Aniskine Vladimir & Kivogui Lamine, 2012 — Morphological, genetical and ecological discrimination of sympatric Coastal Guinea Mastomys (Mammalia: Rodentia) species (West Africa): implications for health and agriculture. Revue D Ecologie-La Terre Et La Vie vol. 67, n° 2, p. 193-211
ISSN
0249-7395
Nicolas Violaine, Hugot Jean-Pierre & Cornette Raphaël, 2021 — New data on the distribution of the two mole species Talpa aquitania Nicolas, Matinez-Vargas & Hugot, 2017 and T. europaea Linnaeus, 1758 in France based on museum and newly collected specimens. Zoosystema. Publications Scientifiques du Muséum national d’Histoire naturelle vol. 43, n° 24, p. 585-617
ISSN
1280-9551
https://dx.doi.org/10.5252/zoosystema2021v43a24
Nicolas Violaine, Bryja Josef, Stoetzel Emmanuelle, Cornette Raphaeel & Denys Christiane, 2022 — Communication - Geographical distribution and diversification of small mammals in sub-Saharan Africa: integration of fossil and modern data. Distribution géographique et diversification des petits mammifères en Afrique sub-saharienne : intégration des.... , , Colloque
Nicolas Violaine, Bryja Josef, Stoetzel Emmanuelle, Cornette Raphael, Denys Christiane C., Dianat Malahat, Konečný Adam, Krasova Jarmila, Linchamps Pierre, Mikula Ondrej, Mizerovská Daniela, Mulualem Getachew, Terray Léa & Voet Inessa, novembre 2022 — « Geographical distribution and diversification of small mammals in sub-Saharan Africa: integration of fossil and modern data » in Colloque du GDR rift - groupe interdisciplinaire grand rift africain.. , , tex.hal_id: hal-03854983 tex.hal_version: v1
https://hal.science/hal-03854983
Nicolas Violaine, Bryja Josef, Stoetzel Emmanuelle, Cornette Raphaeel & Denys Christiane, 2022 — Communication - Geographical distribution and diversification of small mammals in sub-Saharan Africa: integration of fossil and modern data. Distribution géographique et diversification des petits mammifères en Afrique sub-saharienne : intégration des don. , , Colloque
Nicolas Violaine, décembre 2021 — « Phylogeography » in Biogeography : an integrative approach of the evolution of living.. , n° 1, p. 59-76 tex.hal_id: hal-03468408 tex.hal_version: v1
https://dx.doi.org/10.1002/9781119882381.ch3
Voet Inessa & Nicolas Violaine, 2022 — « Phylogéographie » in Biogéographie - Une approche intégrative de l’évolution du vivant... vol. 3, , dir. ISTE Editions p. 71-93
ISBN
978-1-78948-060-3
https://www.istegroup.com/fr/produit/la-biogeographie/
Voet Inessa, Denys Christiane, Colyn Marc, Lalis Aude, Konečný Adam, Delapré Arnaud, Nicolas Violaine & Cornette Raphaël, 2022 — Incongruences between morphology and molecular phylogeny provide an insight into the diversification of the Crocidura poensis species complex. Scientific Reports vol. 12, n° 1, p. 10531
ISSN
2045-2322
https://dx.doi.org/10.1038/s41598-022-12615-5
Formenti Giulio, Theissinger Kathrin, Fernandes Carlos, Bista Iliana, Bombarely Aureliano, Bleidorn Christoph, Ciofi Claudio, Crottini Angelica, Godoy José A., Höglund Jacob, Malukiewicz Joanna, Mouton Alice, Oomen Rebekah A., Paez Sadye, Palsb??ll Per J. et al., 2022 — The era of reference genomes in conservation genomics. Trends in Ecology & Evolution vol. 37, n° 3,
ISSN
0169-5347
https://dx.doi.org/10.1016/j.tree.2021.11.008
Durocher Marine, Grouard Sandrine, Nicolas Violaine, Maestri Renan & Evin Allowen, 2022 — Defining Fragmentation Patterns of Archaeological Bone Remains without Typologies: A Landmark-Based Approach on Rodent Mandibula. Quaternary vol. 5, n° 1, p. 14
ISSN
2571-550X
https://dx.doi.org/10.3390/quat5010014
Costes Pauline, Klein Estelle, Delapré Arnaud, Houssin Céline, Nicolas Violaine & Cornette Raphaël, 2022 — Comparative morphofunctional analysis of the humerus and ulna in three Western European moles species of the genus Talpa , including the newly described T. aquitania. Journal of Anatomy vol. 242, n° 2, p. 257-276
ISSN
0021-8782, 1469-7580
https://dx.doi.org/10.1111/joa.13772
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