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Biodiversité: Interactions, Adaptations, Spéciation (BIAS)
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Biologie évolutive

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Responsabilités dans l'unité

Responsable de l'équipe Biodiversité: interactions, adaptation, spéciation

Responsabilités hors unité

Research associate au STRI

Membre du managing board de PCI evolutionary biology

Enseignements

Présentation

Les publications antérieures à 2014

Présentation

CV

Depuis fin 2009 chercheur CNRS au Muséum National d’Histoire Naturelle, Paris, France

  • Depuis 2022: Reasearch Associte au STRI (Panama)
  • Depuis 2017 DR2 CNRS
  • 2016. HDR
  • 2013. CR1 CNRS
  • 2009. CR2 CNRS au MNHN
  • 2009. Postdoc, Imperial College London, UK
  • 2005 – 2008. Postdoc, Universités de Edinburgh et Cambridge, UK
  • 2001 – 2004. Postdoc, Universités de Helsinki et Oulu, Finland
  • 1996 – 2000. Thèse de doctorat en Biologie Evolutive, Université Montpellier II, France.

Principaux thèmes de recherche

Le grand nombre d’espèces présentes sur terre, et particulièrement dans les ‘points chauds’ de diversité, constitue un défi pour la biologie évolutive moderne. Afin d’appréhender l’origine et l’évolution d’une telle diversité, je m’intéresse 1) aux facteurs impliqués dans la spéciation, et 2) aux processus dynamiques qui permettent la coexistence de multiples espèces. Nous envisageons ces questions dans une perspective évolutive, où les processus historiques et écologiques sont examinés conjointement, à différentes échelles spatiales et temporelles. Plus précisément, nous travaillons aussi bien à l’échelle de tout un groupe taxonomique, qui porte la signature des évènements qui ont façonné la diversité de ce groupe, qu’à l’échelle de la communauté, où les espèces interagissent. Parce que l’analyse des patrons de diversification d’un groupe ne peut se faire sans une excellente connaissance de la taxonomie de ce groupe, nous nous attachons également à établir ou réviser la systématique des groupes étudiés.

Nous utilisons principalement les papillons ithomiines (Nymphalidae : Ithomiini, 393 espèces) comme groupe modèle. Les ithomiines forment une tribu néotropicale diversifiée, qui occupe les forêts humides à des altitudes variées. Toutes les espèces participent au mimétisme de type müllerien : des espèces non-comestibles qui coexistent convergent pour leurs coloration alaires avertissantes, diminuant ainsi le coup per-capita de la prédation (mimétisme mutualiste). Les papillons mimétiques forment des anneaux mimétiques localement (Figure 1), qui comportent plusieurs espèces partageant les mêmes colorations avertissantes.

Figure 1. Four mimicry rings formed by ithomiine species in Añangu, Ecuador © MNHN

Figure 1. Four mimicry rings formed by ithomiine species in Añangu, Ecuador

Crédits
© MNHN

Projets

Patrons macroévolutifs et macroécologiques de biodiversité chez les papillons ithomiines

Membres de l’équipe : Nicolas Chazot (ancien doctorant), Lisa de Silva (ancienne postdoc), Mael Doré (doctorant)

Principaux collaborateurs : Keith Willmott (University of Gainesville, USA), André Freitas (University of Campinas, Brazil), Gerardo Lamas (Museo de Historia Natural, Lima, Peru), Jim Mallet (university of Harvard, USA)

Grace à un travail collaboratif, nous avons généré une phylogénie moléculaire à l'échelle de l'espèce pour la tribu Ithomiini (Figure 2). Cette phylogénie nous a permis d'inférer l'histoire de diversification au cours du temps et de l'espace des papillons ithomiines, et a révélé le role majeur du système Pebas, un environnement acquatique qui occupait l'ouest de l'Amazonie au Miocène et qui a mené à l'extinction de nombreuses lignée d'ithomiines, et des Andes, qui ont favorisé la diversification des ithomiines.

Les Andes concentrent actuellement la majorité de la biodiversité des ithomiines.

 

ithomiine_phylo.png

Phylogénie des Ithomiini

Crédits
Nicolas Chazot

Figure 2: phylogénie moléculaire des papillons ithomiines, comportant 339 espèces sur les 393 espèces répertoriées.

 

Ecologie phylogenetique des communautés

Membres de l’équipe : Nicolas Chazot (ancien doctorant), Thomas Aubier (ancient doctorant), Yann Le Poul (ancien doctorant), Mael Doré (doctorant)

Principaux collaborateurs : Keith Willmott (University of Gainesville, USA), Chris Jiggins (University of Cambridge, UK), Zach Gompert (University of Utah, USA), Colin Fontaine (MNHN)

Les forces qui gouvernent l’assemblage des communautés (guildes) sont complexes, et peuvent être classées en trois catégories : les forces ‘neutres’ (dispersion, dérive), l’adaptation locale, et les interactions entre espèces. Seule une perspective évolutive, tenant compte de la proximité phylogénétique entre espèces, permet de rendre compte des rôles respectifs de ces différentes forces. Nous mesurons l’abondance et des traits adaptatifs des espèces qui coexistent et nous utilisons les phylogénies de ces espèces pour explorer à différentes échelles spatiales (communauté locale, région) l’importance de l’inertie phylogénétique, de l’adaptation locale (micro ou macrohabitat) et des interactions entre espèces (compétition, mutualisme – en l’occurrence le mimétisme, Figure 3). Cette démarche empirique est complétée par une approche théorique qui permet de générer des prédictions.

Nous nous intéressons également à la structure des réseaux d’interaction à plusieurs niveaux trophiques explicites (en prenant en compte les relations phylogénétiques des espèces de chacun de ces niveaux), en particulier les relations papillons – plantes-hôtes, et les réseaux trophiques plantes / pucerons / parasitoides primaires / parasitoides secondaires.

Figure 3. Mimicry drives microhabitat niche convergence among ithomiine butterflies © MNHN

Figure 3. Mimicry drives microhabitat niche convergence among ithomiine butterflies

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© MNHN

Ecologie et génomique de la speciation

Membres de l’équipe : Melanie McClure (ancienne postdoc), Florence Prunier (AI), Céline Houssin (Tech.), Yann Le Poul (ancien doctorant), Jérémy Gauthier (ancien postdoc)

Principaux collaborateurs : Claire Lemaitre and Fabrice Legeai (GenScale, Rennes), Emmanuelle Jacquin-Joly (iEES, Paris), Annabel Whibley (JIC, Norwich, UK), Kanchon Dasmahapatra (University of York, UK), Mathieu Joron (CEFE, Montpellier).

Nous testons expérimentalement chez des espèces d’ithomiines le rôle de différents facteurs, tels que le patron de coloration, la plante hôte, le microhabitat et les phéromones dans l’isolement reproducteur entre taxons parapatriques (Figure 4). En parallèle, nous explorons la structure génétique des populations de ces taxons en utilisant des marqueurs générés par du séquençage haut-débit.

Figure 4. Mating between Andean and Amazonian subspecies of Ithomia salapia © MNHN

Figure 4. Mating between Andean and Amazonian subspecies of Ithomia salapia

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Evolution de la transparence chez les lépidoptères

Membres de l’équipe : Charline Pinna (doctorante), Monica Arias (postdoc), Violaine Ossola (doctorante)

Principaux collaborateurs : Doris Gomez (CEFE, Montpellier), Serge Berthier (INSP, Paris), Christine Andraud (CRC, Paris), Nipam Patel (university of Berkely, USA), Johanna Mappes (University of Jyvaskyla, Finland)

Les lépidoptères ont de grandes ailes recouvertes d’écailles. Ces dernières interviennent dans de nombreuses adaptations, comme l’hydrophobie, la thermorégulation, l’aérodynamisme et surtout les motifs des ailes. Pourtant, de nombreuses espèces ont des ailes partiellement ou totalement transparentes... et beaucoup d’entre elles possèdent des défenses chimiques et sont mimétiques (Figure 5). A l’interface entre la physique, la biologie évolutive et la biologie du développement, nous caractérisons les structures (écailles et nanostructures de la membrane) et les propriétés optiques des ailes transparentes pour en comprendre le développement et leur évolution à la lumière de l’écologie des espèces. Nous mettons également en oeuvre des approches expérimentales.

Figure 5. Hypomenitis enigma © MNHN

Figure 5. Hypomenitis enigma

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Collaboration à d'autres projets

• Avec Doris Gomez (CEFE, Montpellier): évolution des couleurs iridescents chez les colibris, au moyen de mesures optiques et d’analyses comparatives (thèse de Hugon Gruson).

• Avec Keith Willmott (University of Gainesville)et Johanna Mappes (University of Jyvaskyla, Finlande): mimétisme chez le genre Adelpha (thèse de Erika Paez)

• Avec Violaine Llaurens (ISYEB, Paris) et Bastien Nay (LSO, Palaiseau): évolution de la toxicité chez les papillons Heliconius et Ithomiini (thèse de Ombeline Sculfort)

• Avec Rodolphe Rougerie (ISYEB, Paris): patrons spatio-temporels de diversification chez les papillons de nuit Saturniidae and Sphingidae (thèse de Pierre Arnal, ANR SPHINX)

• Avec Frédéric Austerlitz et Laure Ségurel (Ecoanthropologie, Musée de l'Homme): détection de sélection sur des caractères polygéniques (thèse de Léa Bouteille)

Financements récents

Coordinatrice

  • 2017 - 2021 : HFSP research grant (Development, functions, and evolution of transparency in butterflies : an interdisciplinary approach)
  • 2015 - 2018 : ANR SPECREP (Repeatability of the speciation process in butterflies : natural replicates in a suture zone system)

Partenaire

  • 2017 - 2022 : ANR CLEARWING (Transparency : physical origin, adaptive functions and evolution in clearwing butterflies)
  •  2017 - 2022 : ANR SPHINX (Understanding and predicting species adaptation to environmental changes in Insectes)

 

 

 

 

 

Terrains de recherche

Amérique du sud

France

Publications

2024
  • Rosser Neil, Seixas Fernando, Queste Lucie M., Cama Bruna, Mori-Pezo Ronald, Kryvokhyzha Dmytro, Nelson Michaela, Waite-Hudson Rachel, Goringe Matt, Costa Mauro, Elias Marianne, Mendes Eleres De Figueiredo Clarisse, Freitas André Victor Lucci, Joron Mathieu, Kozak Krzysztof et al., 2024Hybrid speciation driven by multilocus introgression of ecological traits. Abstract Hybridization allows adaptations to be shared among lineages and may trigger the evolution of new species 1,2 … Nature , ,
    ISSN
    0028-0836, 1476-4687
2023
  • Maisonneuve Ludovic, Elias Marianne, Smadi Charline & Llaurens Violaine, novembre 2023The limits of evolutionary convergence in sympatry: Reproductive interference and historical constraints leading to local diversity in warning traits. American Naturalist vol. 201, , E000–E000 Publisher: University of Chicago Press tex.hal_id: hal-04073974 tex.hal_local_reference: PROBA tex.hal_version: v1
    ISSN
    0003-0147, 1537-5323
  • Gauthier Jérémy, Meier Joana, Legeai Fabrice, McClure Melanie, Whibley Annabel, Bretaudeau Anthony, Boulain Hélène, Parrinello Hugues, Mugford Sam, Durbin Richard, Zhou Chenxi, McCarthy Shane, Wheat Christopher, Piron-Prunier Florence, Monsempes Christelle et al., 2023First chromosome scale genomes of ithomiine butterflies (Nymphalidae: Ithomiini): comparative models for mimicry genetic studies. The ithomiine butterflies (Nymphalidae: Danainae) represent the largest known radiation of Müllerian mimetic butterflies. They… Molecular Ecology Resources , , Accession Number: 36533297 ISBN: 1755-098X Publisher: Wiley/Blackwell Type: 10.1111/1755-0998.13749
  • Dutrillaux Bernard, Dutrillaux Anne-Marie, Mcclure Mélanie, Gèze Marc, Elias Marianne & Bed’hom Bertrand, janvier 2023Improved basic cytogenetics challenges holocentricity of butterfly chromosomes. Mitotic chromosomes of butterflies, which look like dots or short filaments in most published data, are generally considered to… Cytogenetic and Genome Research vol. 162, n° 5, p. 262-272 Publisher: Karger tex.hal_id: hal-04084494 tex.hal_version: v1
    ISSN
    1424-8581, 1424-859X
  • Gauthier Jérémy, Meier Joana, Legeai Fabrice, McClure Melanie, Whibley Annabel, Bretaudeau Anthony, Boulain Hélène, Parrinello Hugues, Mugford Sam, Durbin Richard, Zhou Chenxi, McCarthy Shane, Wheat Christopher, Piron-Prunier Florence, Monsempes Christelle et al., 2023First chromosome scale genomes of ithomiine butterflies (Nymphalidae: Ithomiini): comparative models for mimicry genetic studies. The ithomiine butterflies (Nymphalidae: Danainae) represent the largest known radiation of Müllerian mimetic butterflies. They… Molecular Ecology Resources vol. 23, n° 4, p. 872-885 Accession Number: 36533297 ISBN: 1755-098X Publisher: Wiley/Blackwell Type: 10.1111/1755-0998.13749
  • Doré Maël, Willmott Keith, Lavergne Sebastien, Chazot Nicolas, Freitas André V. L., Fontaine Colin & Elias Marianne, 2023Mutualistic interactions shape global spatial congruence and climatic niche evolution in Neotropical mimetic butterflies. Ecology Letters vol. 26, n° 6, ele.14198
    ISSN
    1461-023X, 1461-0248
  • Chatelain Paul, Elias Marianne, Fontaine Colin, Villemant Claire, Dajoz Isabelle & Perrard Adrien, 2023Mullerian mimicry among bees and wasps: a review of current knowledge and future avenues of research. BIOLOGICAL REVIEWS vol. 98, n° 4, p. 1310-1328 tex.earlyaccessdate: MAR 2023 tex.eissn: 1469-185X tex.orcid-numbers: Chatelain, Paul/0000-0003-2554-1260 tex.unique-id: WOS:000961549800001
    ISSN
    1464-7931
2022
  • Sculfort Ombeline, Maisonneuve Ludovic, Elias Marianne, Aubier Thomas G. & Llaurens Violaine, juin 2022Uncovering the effects of Müllerian mimicry on the evolution of conspicuousness in colour patterns. Oikos vol. 2022, n° 6,
    ISSN
    0030-1299, 1600-0706
  • Rougerie Rodolphe, Cruaud Astrid, Arnal Pierre, Ballesteros-Mejia Liliana, Condamine Fabien L., Decaëns Thibaud, Elias Marianne, Gey Delphine, Hebert Paul D. N., Kitching Ian J., Lavergne Sébastien, Lopez-Vaamonde Carlos, Murienne Jérôme, Cuenot Yves, Nidelet Sabine et al., 2022Phylogenomics Illuminates the Evolutionary History of Wild Silkmoths in Space and Time (Lepidoptera: Saturniidae). BIORXIV - PREPRINT vol. Evolutionary Biology, , PREPRINT