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Les pathogènes et nuisibles des plantes provoquent des dégâts considérables qui sont à l’origine de la perte de 30% des récoltes dans le monde. La diversité des pathogènes associés aux plantes est étudiée pour des plantes d’intérêt économique majeur dans l’espace agricole mais la diversité associée à un environnement plus large est méconnue. L’exemple des bactéries pathogènes de plantes isolées hors de l’espace agricole montre que la répartition des espèces varie fortement selon l’environnement considéré et que la diversité des espèces ne se résume pas à celle présentes dans les champs cultivés. L’analyse en cours des génomes des différentes espèces semblent suggérer des trajectoires évolutives contrastées.
